Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00063
- Subject:
- XM_006500870.3
- Aligned Length:
- 2430
- Identities:
- 2063
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGGCCTCAGAGGCTCGGGGTGGTCTGGGGGCCCCTCCGCTGCAGTCTGCCCGATCCCTGCCGGGCCCCGCCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGCCTCAAGCACTTCCCGCTCGACCTGCGCACGTCTATGGATGGCAAATGCAAGGAGATCGCCGAGGAGCTGT 148
||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1 -------------------------------------ATGGATGGCAAATGCAAGGAGATCGCTGAGGAGTTGT 37
Query 149 TCACCCGCTCACTGGCTGAGAGCGAGCTCCGTAGTGCCCCGTATGAGTTCCCCGAGGAGAGCCCCATTGAACAG 222
|||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 38 TCAGCCGCTCACTGGCTGAGAGTGAGCTTCGTAGCGCCCCTTATGAGTTCCCAGAGGAAAGCCCCATCGAGCAG 111
Query 223 CTGGAGGAGCGGCGGCAGCGGCTGGAGCGGCAGATCAGCCAGGATGTCAAGCTGGAGCCAGACATCCTGCTTCG 296
||.||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 112 CTAGAAGAACGGAGGCAGCGGCTGGAGCGCCAGATCAGCCAGGATGTCAAGCTGGAGCCAGATATTCTTCTTCG 185
Query 297 GGCCAAGCAAGATTTCCTGAAGACGGACAGTGACTCGGACCTACAGCTCTACAAGGAACAGGGTGAGGGGCAGG 370
.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 186 AGCCAAGCAAGATTTCCTGAAGACAGACAGCGACTCAGACTTACAGCTGTACAAGGAGCAAGGAGAGGGACAGG 259
Query 371 GTGACCGGAGCCTGCGGGAGCGTGATGTG---CTGGAACGGGAGTTTCAGCGGGTCACCATCTCTGGGGAGGAG 441
|||||.||.|.||..||||.||||||||| .||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 260 GTGACAGGGGTCTTTGGGAACGTGATGTGGTATTGGAACGGGAATTTCAGCGGGTCATCATCTCTGGGGAGGAG 333
Query 442 AAGTGTGGGGTGCCGTTCACAGACCTGCTGGATGCAGCCAAGAGTGTGGTGCGGGCGCTCTTCATCCGGGAGAA 515
||||||||||||||.|||||||||||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 334 AAGTGTGGGGTGCCATTCACAGACCTCTTAGACGCAGCCAAAAGTGTGGTTCGGGCACTTTTCATCCGGGAGAA 407
Query 516 GTACATGGCCCTGTCCCTGCAGAGCTTCTGCCCCACCACCCGCCGCTACCTGCAGCAGCTGGCTGAAAAGCCTC 589
||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 408 GTACATGGCCCTATCACTGCAGAGCTTCTGTCCCACCACCCGCCGTTACCTGCAGCAGCTGGCTGAGAAGCCCC 481
Query 590 TGGAGACCCGGACCTATGAACAGGGCCCCGACACCCCTGTGTCTGCTGATGCCCCGGTGCACCCCCCTGCGCTG 663
|||||||.||.||.|||||.|||.|.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 482 TGGAGACTCGAACTTATGAGCAGAGTCCTGATACCCCTGTATCTGCTGATGCCCCAGTGCATCCCCCTGCACTG 555
Query 664 GAGCAGCACCCGTATGAGCACTGTGAGCCAAGCACCATGCCTGGGGACCTGGGCTTGGGTCTGCGCATGGTGCG 737
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556 GAGCAGCACCCGTATGAGCACTGTGAGCCAAGCGCCATGCCTGGGGACCTGGGCTTGGGTCTGCGCATGGTGCG 629
Query 738 GGGTGTGGTGCACGTCTACACCCGCAGGGAACCCGACGAGCATTGCTCAGAGGTGGAGCTGCCATACCCTGACC 811
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||..|.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 630 TGGTGTGGTGCACGTCTACACCCGCAGGGACCCTGATGAGCACTGTCCGGAGGTGGAGCTTCCATACCCTGACC 703
Query 812 TGCAGGAATTTGTGGCTGACGTCAATGTGCTGATGGCCCTGATTATCAATGGCCCCATAAAGTCATTCTGCTAC 885
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 704 TACAGGAATTTGTAGCTGACGTCAATGTGCTGATGGCCCTGATCATCAATGGTCCCATAAAGTCATTCTGCTAC 777
Query 886 CGCCGGCTGCAGTACCTGAGCTCCAAGTTCCAGATGCATGTGCTACTCAATGAGATGAAGGAGCTGGCCGCCCA 959
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 778 CGCCGGCTGCAGTACCTGAGCTCCAAATTCCAGATGCACGTTTTGCTCAATGAGATGAAGGAGCTCGCTGCTCA 851
Query 960 GAAGAAAGTGCCACACCGAGATTTCTACAACATCCGCAAGGTGGACACCCACATCCATGCCTCGTCCTGCATGA 1033
||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 852 GAAGAAAGTGCCACACCGGGACTTCTACAATATCCGTAAGGTGGACACACACATCCACGCCTCGTCCTGCATGA 925
Query 1034 ACCAGAAGCATCTGCTGCGCTTCATCAAGCGGGCAATGAAGCGGCACCTGGAGGAGATCGTGCACGTGGAGCAG 1107
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 926 ACCAGAAACATCTACTGCGCTTCATCAAGCGGGCCATGAAGCGGCACCTGGAGGAGATTGTGCATGTGGAACAG 999
Query 1108 GGCCGTGAACAGACGCTGCGGGAGGTCTTTGAGAGCATGAATCTCACGGCCTACGACCTGAGTGTGGACACGCT 1181
|||||.||.|||||||||.|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1000 GGCCGCGAGCAGACGCTGAGAGAAGTCTTCGAGAGCATGAACCTCACTGCCTACGACTTAAGTGTGGACACGCT 1073
Query 1182 GGATGTGCATGCGGACAGGAACACTTTCCATCGCTTTGACAAGTTTAATGCCAAATACAACCCTATTGGGGAGT 1255
|||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 GGATGTGCATGCGGACAGGAATACCTTTCATCGATTTGACAAATTCAATGCCAAATACAACCCTATTGGGGAGT 1147
Query 1256 CCGTCCTCCGAGAGATCTTCATCAAGACGGACAACAGGGTATCTGGGAAGTACTTTGCTCACATCATCAAGGAG 1329
|.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 CTGTTCTCCGAGAGATCTTCATTAAAACCGACAACAAGATTTCTGGGAAGTACTTTGCTCACATCATCAAGGAG 1221
Query 1330 GTGATGTCAGACCTGGAGGAGAGCAAATACCAGAATGCAGAGCTGCGGCTCTCCATTTACGGGCGCTCGAGGGA 1403
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1222 GTGATGGCAGACTTGGAGGAGAGCAAATACCAGAATGCAGAGCTCCGGCTGTCCATCTACGGGCGTTCGAGGGA 1295
Query 1404 TGAGTGGGACAAGCTGGCGCGCTGGGCCGTCATGCACCGCGTGCACTCCCCCAACGTGCGCTGGCTGGTGCAGG 1477
||||||||||||||||||.||||||||.||.|..|||...||||||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1296 TGAGTGGGACAAGCTGGCACGCTGGGCAGTGAACCACAAAGTGCACTCTCCCAATGTCCGCTGGCTGGTGCAGG 1369
Query 1478 TGCCCCGCCTCTTTGATGTGTACCGTACCAAGGGCCAGCTGGCCAACTTCCAGGAGATGCTGGAGAACATCTTC 1551
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1370 TGCCCCGCCTCTTCGATGTGTACCGCACCAAGGGCCAGCTGGCCAACTTCCAAGAGATGCTGGAGAACATCTTT 1443
Query 1552 CTGCCACTGTTCGAGGCCACTGTGCACCCTGCCAGCCACCCGGAACTGCATCTCTTCTTAGAGCACGTGGATGG 1625
|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1444 CTGCCCCTGTTTGAGGCTACTGTGCACCCTGCCAGCCACCCGGAGCTGCACCTCTTTCTGGAGCACGTGGATGG 1517
Query 1626 TTTTGACAGCGTGGATGATGAGTCCAAGCCTGAAAACCATGTCTTCAACCTGGAGAGCCCCCTGCCTGAGGCGT 1699
||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 1518 TTTTGATAGCGTGGATGATGAGTCCAAGCCAGAGAACCACGTCTTCAACCTGGAGAGTCCCCTCCCAGAAGCTT 1591
Query 1700 GGGTGGAGGAGGACAACCCACCCTATGCCTACTACCTGTACTACACCTTTGCCAACATGGCCATGTTGAACCAC 1773
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1592 GGGTGGAGGAGGACAACCCTCCCTATGCCTACTACCTGTACTACACCTTCGCTAACATGGCTATGTTGAACCAT 1665
Query 1774 CTGCGCAGGCAGAGGGGCTTCCACACGTTTGTGCTGAGGCCACACTGTGGGGAGGCTGGGCCCATCCACCACCT 1847
||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1666 CTGCGCAGGCAGAGAGGTTTCCACACGTTCGTGCTGAGGCCGCACTGTGGGGAGGCCGGGCCCATCCACCACCT 1739
Query 1848 GGTGTCAGCCTTCATGCTGGCTGAGAACATTTCCCACGGGCTCCTTCTGCGCAAGGCCCCCGTCCTGCAGTACC 1921
|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 GGTATCAGCCTTCATGCTGGCCGAGAACATCTCCCACGGGCTGCTCCTGCGCAAGGCCCCCGTCCTGCAGTACC 1813
Query 1922 TGTACTACCTGGCCCAGATCGGCATCGCCATGTCTCCGCTCAGCAACAACAGCCTCTTCCTCAGCTATCACCGG 1995
||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1814 TGTATTACCTGGCTCAGATCGGCATCGCCATGTCCCCGCTCAGCAACAACAGCCTGTTCCTCAGCTACCACCGG 1887
Query 1996 AATCCGCTACCGGAGTACCTGTCCCGCGGCCTCATGGTCTCCCTGTCCACTGATGATCCCTTGCAGTTCCACTT 2069
||.||.||.||.||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888 AACCCTCTCCCTGAGTACTTGTCCCGTGGCCTCATGGTCTCGCTGTCCACAGATGATCCCTTGCAGTTCCACTT 1961
Query 2070 CACCA---------------------------------AGGAGCCGCTGATGGAGGAGTACAGCATCGCCACCC 2110
||||| |||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 CACCAAGGTCAGACCCAGGCCAGCGGGCAGCCAAGGGCAGGAGCCCCTGATGGAGGAGTACAGCATCGCCACCC 2035
Query 2111 AGGTGTGGAAGCTCAGCTCCTGCGATATGTGTGAGCTGGCCCGCAACAGCGTGCTCATGAGCGGCTTCTCGCAC 2184
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2036 AGGTGTGGAAGCTCAGCTCCTGCGATATGTGCGAGCTGGCCCGTAACAGCGTGCTCATGAGTGGCTTCTCTCAC 2109
Query 2185 AAGGTAAAGAGCCACTGGCTGGGACCCAACTATACCAAGGAAGGCCCTGAGGGGAATGACATCCGCCGGACCAA 2258
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2110 AAGGTGAAAAGCCACTGGCTGGGACCCAACTATACCAAGGAGGGCCCTGAGGGCAATGATATCCGCCGTACCAA 2183
Query 2259 TGTGCCAGACATCCGCGTGGGCTACCGCTACGAGACCCTGTGCCAGGAGCTGGCGCTCATCACGCAGGCAGTCC 2332
.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2184 CGTGCCAGACATCCGAGTGGGCTACCGCTATGAGACGCTATGCCAGGAGCTGGCACTTATCACACAGGCCGTCC 2257
Query 2333 AGAGTGAGATGCTGGAGACCATTCCAGAGGAGGCGGGTATCACCATGAGCCCAGGGCCTCAA 2394
|.||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||.||...||||||||||||||||
Sbjct 2258 AAAGTGAGATGCTGGAGACCATCCCAGAGGAAGTGGGCATTGTCATGAGCCCAGGGCCT--- 2316