Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_00076
Subject:
NM_001310600.1
Aligned Length:
708
Identities:
455
Gaps:
223

Alignment

Query   1  MSVPSSLSQSAINANSHGGPALSLPLPLHAAHNQLLNAKLQATAVGPKDLRSAMGEGGGPEPGPANAKWLKEGQ  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  NQLRRAATAHRDQNRNVTLTLAEEASQEPEMAPLGPKGLIHLYSELELSAHNAANRGLRGPGLIISTQEQGPDE  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GEEKAAGEAEEEEEDDDDEEEEEDLSSPPGLPEPLESVEAPPRPQALTDGPREHSKSASLLFGMRNSAASDEDS  222
                                                                               ....|.
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------MFSQDF  6

Query 223  SWATLSQGSPSYGSPEDTDSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQE  296
           ..|...|..    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   7  FLAIILQDN----SP---DSFWNPNAFETDSDLPAGWMRVQDTSGTYYWHIPTGTTQWEPPGRASPSQGSSPQE  73

Query 297  ESQLTWTGFAHGEGFEDGEFWKDEPSDEAPMELGLKEPEEGTLTFPAQSLSPEPLPQEEEKLPPRNTNPGIKCF  370
           |||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||.|||.||.||||||||||.|||||||..||.|||||||
Sbjct  74  ESQLTWTGFAHQEGFEEGEFWKDEPSEEAPMELGLKDPEEATLSFPAQSLSPEPVPQEEEKLSQRNANPGIKCF  147

Query 371  AVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMSGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQSQALLHA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 148  AVRSLGWVEMTEEELAPGRSSVAVNNCIRQLSYHKNNLHDPMAGGWGEGKDLLLQLEDETLKLVEPQNQTLLHA  221

Query 445  QPIISIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMAERRNARCLVNGLSLDH  518
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 222  QPIVSIRVWGVGRDSGRDFAYVARDKLTQMLKCHVFRCEAPAKNIATSLHEICSKIMSERRNARCLVNGLSLDH  295

Query 519  SKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILH  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  SKLVDVPFQVEFPAPKNELVQKFQVYYLGNVPVAKPVGVDVINGALESVLSSSSREQWTPSHVSVAPATLTILH  369

Query 593  QQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQA  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 370  QQTEAVLGECRVRFLSFLAVGRDVHTFAFIMAAGPASFCCHMFWCEPNAASLSEAVQAACMLRYQKCLDARSQT  443

Query 667  STSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGAHTP  708
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 444  STSCLPAPPAESVARRVGWTVRRGVQSLWGSLKPKRLGSQTP  485