Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00076
- Subject:
- NM_009685.3
- Aligned Length:
- 2126
- Identities:
- 1922
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACC 74
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||
Sbjct 1 ATGTCTGTTCCATCATCCCTGAGCCAGTCGGCCATTAACGCTAACAGCCACGGAGGCCCTGCACTCAGCTTCCC 74
Query 75 CCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACC 148
|.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 75 CTTACCCCTGCACGCTGCCCATAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAAGCCACAGCTGTGGTACCCAAGGACC 148
Query 149 TGCGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAG 222
|.||.||.||.|||||.||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||
Sbjct 149 TTCGAAGTGCTATGGGAGAGGGTAGTGTGCCTGAACCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGTTAAAGGAAGGCCAG 222
Query 223 AACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC 296
||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACCAGCTTCGGAGGGCTGCCACAGCCCACCGAGACCAGAACCGAAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC 296
Query 297 CAGCCAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAG 370
||||||||||.||||||.||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CAGCCAGGAGGCTGAGACGGCACCTTTGGGTCCCAAAGGCTTAATGCATCTATACTCTGAGCTGGAGCTCTCGG 370
Query 371 CTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAG 444
|.|||||.||||||||||||||.||.|..|||.|.|.|.|||||||||.|||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 371 CCCACAATGCAGCCAACCGAGGGCTTCATGGATCCGCCTTGATCATCAACACCCAGGAACAGGGACCAGATGAA 444
Query 445 GGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTT 518
||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGAGGAGAAGGCAGCAGGAGAGGCTGAGGAGGATGATGAAGACGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACTT 518
Query 519 ATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGG-AGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGAT 591
.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||.||||| ||.||||| |..|||||||.|||||.|||||.
Sbjct 519 GTCTTCTCCTCCAGGGCTACCTGAGCCTCTGGAGAATGTGGAAGTCCCCT-CTGGGCCCCAGGCCCTCACAGAC 591
Query 592 GGCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTC 665
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GGCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCTAGCCTCCTATTTGGCATGCGAAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTC 665
Query 666 AAGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCAGAGGACACAGATTCCTTCTGGAACCCCA 739
|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AAGCTGGGCCACCTTATCACAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCGGAGGACACAGATTCCTTCTGGAACCCCA 739
Query 740 ACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACCTATTACTGG 813
||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 ACGCTTTCGAGACGGATTCCGATCTACCGGCTGGATGGATGAGGGTACAGGACACCTCAGGGACCTACTACTGG 813
Query 814 CACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGA 887
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCAGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGA 887
Query 888 GGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGAAGGATGAAC 961
.||||||||||||||||||||.||.||||||||...|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 888 AGAGTCCCAGCTCACCTGGACTGGCTTTGCTCACCAAGAAGGCTTTGAGGAAGGAGAGTTTTGGAAGGATGAAC 961
Query 962 CCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCAGCTCAGAGC 1035
|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||.|||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 962 CCAGTGAGGAGGCCCCAATGGAGTTGGGACTGAAGGACCCCGAGGAGGCGACATTGTCCTTCCCAGCTCAGAGC 1035
Query 1036 CTCAGCCCAGAGCC-GTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAAGTGTT 1108
|||||||||||.|| ||| |||||.|||||.||||||||..|||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CTCAGCCCAGAACCAGTT-CCCCAGGAGGAAGAGAAGCTGTCCCAACGGAATGCCAACCCAGGGATCAAGTGTT 1108
Query 1109 TCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGTGTGGCAGTC 1182
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 TCGCTGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCAGGACGCAGCAGTGTGGCAGTC 1182
Query 1183 AACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGGGAAGG 1256
||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 1183 AACAATTGTATCCGCCAGCTCTCCTACCACAAAAACAATCTACATGATCCGATGGCTGGGGGCTGGGGAGAGGG 1256
Query 1257 AAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCTGCACG 1330
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||.||||.|.||||||||.|
Sbjct 1257 AAAGGATCTGCTGCTCCAGCTGGAGGACGAGACTCTAAAGTTGGTGGAGCCACAGAACCAGACGCTGCTGCATG 1330
Query 1331 CCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGAAGGGACTTTGCCTACGTAGCTCGT 1404
|.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1331 CACAGCCCATCGTCAGCATTCGTGTGTGGGGCGTTGGGCGGGACAGTGGAAGGGACTTTGCCTACGTAGCTCGA 1404
Query 1405 GATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 GATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCT 1478
Query 1479 GCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATGGACTCTCCCTGGACC 1552
|||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1479 GCATGAGATCTGCTCCAAGATCATGTCTGAACGGCGCAATGCTCGCTGCTTGGTCAATGGACTCTCCCTAGACC 1552
Query 1553 ACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCCAGAAGTTCCAA 1626
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1553 ACTCTAAACTCGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCACCAAAGAATGAGCTGGTGCAGAAGTTCCAA 1626
Query 1627 GTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCCCTCGAGTCAGT 1700
||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1627 GTCTATTACCTGGGAAATGTGCCAGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGACGTGATTAATGGGGCCCTGGAGTCAGT 1700
Query 1701 CCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTACCCTCACCATCTTGC 1774
||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1701 CCTGTCTTCCAGTAGCCGTGAGCAGTGGACTCCAAGTCACGTCAGCGTGGCCCCTGCCACCCTCACCATCTTGC 1774
Query 1775 ACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGGGCAGAGATGTC 1848
|||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1775 ACCAGCAGACAGAAGCGGTGCTGGGGGAGTGCCGGGTGCGGTTTCTCTCCTTCCTGGCTGTGGGCAGAGATGTG 1848
Query 1849 CACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTGGTGCGAGCCCAATGC 1922
|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1849 CACACATTCGCGTTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGTCACATGTTTTGGTGTGAGCCCAATGC 1922
Query 1923 TGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCCCGTTCCCAGG 1996
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct 1923 TGCCAGTCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCATGCATGCTCCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCTCGCTCCCAGA 1996
Query 1997 CCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTGGACTGTCCGCAGGGGT 2070
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1997 CCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCGGAGTCAGTTGCAAGACGTGTAGGGTGGACAGTCCGCAGGGGT 2070
Query 2071 GTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA 2124
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.||||||
Sbjct 2071 GTTCAGTCGCTGTGGGGTTCCCTCAAGCCCAAACGTCTGGGATCCCAGACCCCA 2124