Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00098
• Subject: NR_160934.1
• Aligned Length: 1447
• Identities: 893
• Gaps: 554

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGAGCGCCAAGTCCAG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  GTCACTGAGGGTTGACTGACTGGAGAGCTCAAGTGCAGCAAAGAGAAGTGTCAGAGCATGAGCGCCAAGTCCAG  74

Query   18  AACCATAGGGATTATTGGAGCTCCTTTCTCAAAGGGACAGCCACGAGGAGGGGTGGAAGAAGGCCCTACAGTAT  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct   75  AACCATAGGGATTATTGGAGCTCCTTTCTCAAAGGGAC------------------------------------  112

Query   92  TGAGAAAGGCTGGTCTGCTTGAGAAACTTAAAGAACAAGAGTGTGATGTGAAGGATTATGGGGACCTGCCCTTT  165
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  -------------------------------------AGAGTGTGATGTGAAGGATTATGGGGACCTGCCCTTT  149

Query  166  GCTGACATCCCTAATGACAGTCCCTTTCAAATTGTGAAGAATCCAAGGTCTGTGGGAAAAGCAAGCGAGCAGCT  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  GCTGACATCCCTAATGACAGTCCCTTTCAAATTGTGAAGAATCCAAGGTCTGTGGGAAAAGCAAGCGAGCAGCT  223

Query  240  GGCTGGCAAGGTGGCAGAAGTCAAGAAGAACGGAAGAATCAGCCTGGTGCTGGGCGGAGACCACAGTTTGGCAA  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  GGCTGGCAAGGTGGCAGAAGTCAAGAAGAACGGAAGAATCAGCCTGGTGCTGGGCGGAGACCACAGTTTGGCAA  297

Query  314  TTGGAAGCATCTCTGGCCATGCCAGGGTCCACCCTGATCTTGGAGTCATCTGGGTGGATGCTCACACTGATATC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  TTGGAAGCATCTCTGGCCATGCCAGGGTCCACCCTGATCTTGGAGTCATCTGGGTGGATGCTCACACTGATATC  371

Query  388  AACACTCCACTGACAACCACAAGTGGAAACTTGCATGGACAACCTGTATCTTTCCTCCTGAAGGAACTAAAAGG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  AACACTCCACTGACAACCACAAGTGGAAACTTGCATGGACAACCTGTATCTTTCCTCCTGAAGGAACTAAAAGG  445

Query  462  AAAGATTCCCGATGTGCCAGGATTCTCCTGGGTGACTCCCTGTATATCTGCCAAGGATATTGTGTATATTGGCT  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  AAAGATTCCCGATGTGCCAGGATTCTCCTGGGTGACTCCCTGTATATCTGCCAAGGATATTGTGTATATTGGCT  519

Query  536  TGAGAGACGTGGACCCTGGGGAACACTACATTTTGAAAACTCTAGGCATTAAATACTTTTCAATGACTGAAGTG  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  TGAGAGACGTGGACCCTGGGGAACACTACATTTTGAAAACTCTAGGCATTAAATACTTTTCAATGACTGAAGTG  593

Query  610  GACAGACTAGGAATTGGCAAGGTGATGGAAGAAACACTCAGCTATCTACTAGGAAGAAAGAAAAGGCCAATTCA  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  GACAGACTAGGAATTGGCAAGGTGATGGAAGAAACACTCAGCTATCTACTAGGAAGAAAGAAAAGGCCAATTCA  667

Query  684  TCTAAGTTTTGATGTTGACGGACTGGACCCATCTTTCACACCAGCTACTGGCACACCAGTCGTGGGAGGTCTGA  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  TCTAAGTTTTGATGTTGACGGACTGGACCCATCTTTCACACCAGCTACTGGCACACCAGTCGTGGGAGGTCTGA  741

Query  758  CATACAGAGAAGGTCTCTACATCACAGAAGAAATCTACAAAACAGGGCTACTCTCAGGATTAGATATAATGGAA  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  CATACAGAGAAGGTCTCTACATCACAGAAGAAATCTACAAAACAGGGCTACTCTCAGGATTAGATATAATGGAA  815

Query  832  GTGAACCCATCCCTGGGGAAGACACCAGAAGAAGTAACTCGAACAGTGAACACAGCAGTTGCAATAACCTTGGC  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  GTGAACCCATCCCTGGGGAAGACACCAGAAGAAGTAACTCGAACAGTGAACACAGCAGTTGCAATAACCTTGGC  889

Query  906  TTGTTTCGGACTTGCTCGGGAGGGTAATCACAAGCCTATTGACTACCTTAACCCACCTAAG-------------  966
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  890  TTGTTTCGGACTTGCTCGGGAGGGTAATCACAAGCCTATTGACTACCTTAACCCACCTAAGTAAATGTGGAAAC  963

Query  967  --------------------------------------------------------------------------  966
                                                                                      
Sbjct  964  ATCCGATATAAATCTCATAGTTAATGGCATAATTAGAAAGCTAATCATTTTCTTAAGCATAGAGTTATCCTTCT  1037

Query  967  --------------------------------------------------------------------------  966
                                                                                      
Sbjct 1038  AAAGACTTGTTCTTTCAGAAAAATGTTTTTCCAATTAGTATAAACTCTACAAATTCCCTCTTGGTGTAAAATTC  1111

Query  967  --------------------------------------------------------------------------  966
                                                                                      
Sbjct 1112  AAGATGTGGAAATTCTAACTTTTTTGAAATTTAAAAGCTTATATTTTCTAACTTGGCAAAAGACTTATCCTTAG  1185

Query  967  --------------------------------------------------------------------------  966
                                                                                      
Sbjct 1186  AAAGAGAAGTGTACATTGATTTCCAATTAAAAATTTGCTGGCATTAAAAATAAGCACACTTACATAAGCCCCCA  1259

Query  967  --------------------------------------------------------------------------  966
                                                                                      
Sbjct 1260  TACATAGAGTGGGACTCTTGGAATCAGGAGACAAAGCTACCACATGTGGAAAGGTACTATGTGTCCATGTCATT  1333

Query  967  -----------------------------------------  966
                                                     
Sbjct 1334  CAAAAAATGTGATTTTTTATAATAAACTCTTTATAACAAGA  1374