Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00105
• Subject: XM_011520105.3
• Aligned Length: 2019
• Identities: 1875
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAGCTCCAGTGGGACACTTGGAGGTCATGATGAACGCAAAGAACGTGGTGCTGGCTAGAGTGTATACGTT  74

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGCAGACCAGAGAATGG  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGACCCAAGCTTAACTTTTCCAATGTGGAATCCTGGGCCTTCATTGATCATCCAATGGCAGACCAGAGAATGG  148

Query   20  ACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGT  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGT  222

Query   94  GGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCAAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGA  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCAAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGA  296

Query  168  CCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTG  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTG  370

Query  242  AAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATG  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATG  444

Query  316  TCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAA  518

Query  390  TCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAG  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAG  592

Query  464  CAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATC  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATC  666

Query  538  CTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGT  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGT  740

Query  612  CAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTA  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTA  814

Query  686  AAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGT  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGT  888

Query  760  AACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTT  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTT  962

Query  834  CTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAAC  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAAC  1036

Query  908  CAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCA  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCA  1110

Query  982  GTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGT  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGT  1184

Query 1056  AGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTC  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTC  1258

Query 1130  ACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAAT  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAAT  1332

Query 1204  TGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTG  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTG  1406

Query 1278  GACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAA  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAA  1480

Query 1352  CCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGA---------------A  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |
Sbjct 1481  CCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGATTCCTTTGTTGTA  1554

Query 1411  GGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGG  1484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGG  1628

Query 1485  CCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCC  1558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCC  1702

Query 1559  CATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACT  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACT  1776

Query 1633  CCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTC  1706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTC  1850

Query 1707  TTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTA  1780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTA  1924

Query 1781  ATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTT  1854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTT  1998

Query 1855  AGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1875
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGTGACTTGCCATGGCCGCTG  2019