Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00105
- Subject:
- XM_011520107.3
- Aligned Length:
- 2004
- Identities:
- 1875
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGCTCCAGTGGGACACTTGGAGGTCATGATGAACGCAAAGAACGTGGTGCTGGCTAGAGTGTATACGTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------ATGGCAGACCAGAGAATGG 19
|||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGACCCAAGCTTAACTTTTCCAATGTGGAATCCTGGGCCTTCATTGATCATCCAATGGCAGACCAGAGAATGG 148
Query 20 ACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGT 93
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGT 222
Query 94 GGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCAAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGA 167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCAAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGA 296
Query 168 CCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTG 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTG 370
Query 242 AAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATG 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATG 444
Query 316 TCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAA 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAA 518
Query 390 TCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAG 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAG 592
Query 464 CAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATC 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATC 666
Query 538 CTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGT 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGT 740
Query 612 CAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTA 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTA 814
Query 686 AAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGT 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGT 888
Query 760 AACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTT 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTT 962
Query 834 CTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAAC 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAAC 1036
Query 908 CAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCA 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCA 1110
Query 982 GTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGT 1184
Query 1056 AGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTC 1258
Query 1130 ACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAAT 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAAT 1332
Query 1204 TGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTG 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTG 1406
Query 1278 GACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAA 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAA 1480
Query 1352 CCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGG 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGG 1554
Query 1426 ACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGA 1628
Query 1500 GGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGA 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGA 1702
Query 1574 GTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCC 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCC 1776
Query 1648 AGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGA 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGA 1850
Query 1722 GAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAA 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAA 1924
Query 1796 TGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGG 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGG 1998
Query 1870 CCGCTG 1875
||||||
Sbjct 1999 CCGCTG 2004