Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00105
- Subject:
- XM_024448522.1
- Aligned Length:
- 1903
- Identities:
- 1786
- Gaps:
- 104
Alignment
Query 1 ATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCT--- 71
|||| ||...|||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGT------------CCTTTCTGCTGAA 17
Query 72 -TTC-CAGCTC---TCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAA--ACGGAAAGGCAGCT--CCAC----- 131
||| |||.|| | |||| ||| ||| ||| .|.|.|.|.|||.| ||||
Sbjct 18 GTTCACAGGTCGAAT-TTGG------------GGA--GCA----CAATGGCTGGAGGTCAGATGCCCACTAGGA 72
Query 132 -------TGACTACCA-AGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACA 197
|||.||..| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 GATGCTATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACA 146
Query 198 CCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTT 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 CCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTT 220
Query 272 TTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTA 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 TTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTA 294
Query 346 AGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAAC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 AGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAAC 368
Query 420 TTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTG 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 TTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTG 442
Query 494 ACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGT 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 ACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGT 516
Query 568 CAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGC 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGC 590
Query 642 ACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGAT 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 ACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGAT 664
Query 716 TATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAG 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAG 738
Query 790 GACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAA---AGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTT 860
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGCAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTT 812
Query 861 GAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCT 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 GAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCT 886
Query 935 GCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCT 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 GCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCT 960
Query 1009 ATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGC 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGC 1034
Query 1083 ATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAG 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 ATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAG 1108
Query 1157 AATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGT 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 AATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGT 1182
Query 1231 TCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTC 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTC 1256
Query 1305 AACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCC 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 AACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCC 1330
Query 1379 ACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCA 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 ACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCA 1404
Query 1453 GGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAG 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 GGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAG 1478
Query 1527 AGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 AGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTC 1552
Query 1601 CAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAG 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAG 1626
Query 1675 GAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGAT 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 GAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGAT 1700
Query 1749 TGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAG 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 TGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAG 1774
Query 1823 CAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG 1875
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 CAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG 1827