Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00173
- Subject:
- NM_007298.3
- Aligned Length:
- 2277
- Identities:
- 2097
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGGATTTATCTGCTCTTCGCGTTGAAGAAGTACAAAATGTCATTAATGCTATGCAGAAAATCTTAGAGTGTCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATTTATCTGCTCTTCGCGTTGAAGAAGTACAAAATGTCATTAATGCTATGCAGAAAATCTTAGAGTGTCC 74
Query 75 CATCTGTCTGGAGTTGATCAAGGAACCTGTCTCCACAAAGTGTGACCACATATTTTGCAAATTTTGCATGCTGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCTGTCTGGAGTTGATCAAGGAACCTGTCTCCACAAAGTGTGACCACATATTTTGCAAATTTTGCATGCTGA 148
Query 149 AACTTCTCAACCAGAAGAAAGGGCCTTCACAGTGTCCTTTATGTAAGAATGATATAACCAAAAGGAGCCTACAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACTTCTCAACCAGAAGAAAGGGCCTTCACAGTGTCCTTTATGTAAGAATGATATAACCAAAAGGAGCCTACAA 222
Query 223 GAAAGTACGAGATTTAGTCAACTTGTTGAAGAGCTATTGAAAATCATTTGTGCTTTTCAGCTTGACACAGGTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAGTACGAGATTTAGTCAACTTGTTGAAGAGCTATTGAAAATCATTTGTGCTTTTCAGCTTGACACAGGTTT 296
Query 297 GGAGTATGCAAACAGCTATAATTTTGCAAAAAAGGAAAATAACTCTCCTGAACATCTAAAAGATGAAGTTTCTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGTATGCAAACAGCTATAATTTTGCAAAAAAGGAAAATAACTCTCCTGAACATCTAAAAGATGAAGTTTCTA 370
Query 371 TCATCCAAAGTATGGGCTACAGAAACCGTGCCAAAAGACTTCTACAGAGTGAACCCGAAAATCCTTCCTTGCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCATCCAAAGTATGGGCTACAGAAACCGTGCCAAAAGACTTCTACAGAGTGAACCCGAAAATCCTTCCTTGCAG 444
Query 445 GAAACCAGTCTCAGTGTCCAACTCTCTAACCTTGGAACTGTGAGAACTCTGAGGACAAAGCAGCGGATACAACC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAACCAGTCTCAGTGTCCAACTCTCTAACCTTGGAACTGTGAGAACTCTGAGGACAAAGCAGCGGATACAACC 518
Query 519 TCAAAAGACGTCTGTCTACATTGAATTGGGATCTGATTCTTCTGAAGATACCGTTAATAAGGCAACTTATTGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAAAAGACGTCTGTCTACATTGAATTGGGATCTGATTCTTCTGAAGATACCGTTAATAAGGCAACTTATTGCA 592
Query 593 GTGTGGGAGATCAAGAATTGTTACAAATCACCCCTCAAGGAACCAGGGATGAAATCAGTTTGGATTCTGCAAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGTGGGAGATCAAGAATTGTTACAAATCACCCCTCAAGGAACCAGGGATGAAATCAGTTTGGATTCTGCAAAA 666
Query 667 AAGGCTGCTTGTGAATTTTCTGAGACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAATAATGATTTGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGCTGCTTGTGAATTTTCTGAGACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAATAATGATTTGAA 740
Query 741 CACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAAAGTATCAGGGTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAGAGTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAAAGTATCAGGGTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAGAGTG 814
Query 815 AAACAAGCGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGACATTTTAACCACTCAGCAGAGGGATACC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAACAAGCGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGACATTTTAACCACTCAGCAGAGGGATACC 888
Query 889 ATGCAACATAACCTGATAAAGCTCCAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAGCATGGGAGCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGCAACATAACCTGATAAAGCTCCAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAGCATGGGAGCCA 962
Query 963 GCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTCTGCCCTTGAGGACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTCTGCCCTTGAGGACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCA 1036
Query 1037 CATCAGAAAAAGTATTAACTTCACAGAAAAGTAGTGAATACCCTATAAGCCAGAATCCAGAAGGCCTTTCTGCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATCAGAAAAAGTATTAACTTCACAGAAAAGTAGTGAATACCCTATAAGCCAGAATCCAGAAGGCCTTTCTGCT 1110
Query 1111 GACAAGTTTGAGGTGTCTGCAGATAGTTCTACCAGTAAAAATAAAGAACCAGGAGTGGAAAGGTCATCCCCTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACAAGTTTGAGGTGTCTGCAGATAGTTCTACCAGTAAAAATAAAGAACCAGGAGTGGAAAGGTCATCCCCTTC 1184
Query 1185 TAAATGCCCATCATTAGATGATAGGTGGTACATGCACAGTTGCTCTGGGAGTCTTCAGAATAGAAACTACCCAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAAATGCCCATCATTAGATGATAGGTGGTACATGCACAGTTGCTCTGGGAGTCTTCAGAATAGAAACTACCCAT 1258
Query 1259 CTCAAGAGGAGCTCATTAAGGTTGTTGATGTGGAGGAGCAACAGCTGGAAGAGTCTGGGCCACACGATTTGACG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCAAGAGGAGCTCATTAAGGTTGTTGATGTGGAGGAGCAACAGCTGGAAGAGTCTGGGCCACACGATTTGACG 1332
Query 1333 GAAACATCTTACTTGCCAAGGCAAGATCTAGAGGGAACCCCTTACCTGGAATCTGGAATCAGCCTCTTCTCTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAACATCTTACTTGCCAAGGCAAGATCTAGAGGGAACCCCTTACCTGGAATCTGGAATCAGCCTCTTCTCTGA 1406
Query 1407 TGACCCTGAATCTGATCCTTCTGAAGACAGAGCCCCAGAGTCAGCTCGTGTTGGCAACATACCATCTTCAACCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACCCTGAATCTGATCCTTCTGAAGACAGAGCCCCAGAGTCAGCTCGTGTTGGCAACATACCATCTTCAACCT 1480
Query 1481 CTGCATTGAAAGTTCCCCAATTGAAAGTTGCAGAATCTGCCCAGAGTCCAGCTGCTGCTCATACTACTGATACT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGCATTGAAAGTTCCCCAATTGAAAGTTGCAGAATCTGCCCAGAGTCCAGCTGCTGCTCATACTACTGATACT 1554
Query 1555 GCTGGGTATAATGCAATGGAAGAAAGTGTGAGCAGGGAGAAGCCAGAATTGACAGCTTCAACAGAAAGGGTCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCTGGGTATAATGCAATGGAAGAAAGTGTGAGCAGGGAGAAGCCAGAATTGACAGCTTCAACAGAAAGGGTCAA 1628
Query 1629 CAAAAGAATGTCCATGGTGGTGTCTGGCCTGACCCCAGAAGAATTTATGCTCGTGTACAAGTTTGCCAGAAAAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAAAGAATGTCCATGGTGGTGTCTGGCCTGACCCCAGAAGAATTTATGCTCGTGTACAAGTTTGCCAGAAAAC 1702
Query 1703 ACCACATCACTTTAACTAATCTAATTACTGAAGAGACTACTCATGTTGTTATGAAAACAGATGCTGAGTTTGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCACATCACTTTAACTAATCTAATTACTGAAGAGACTACTCATGTTGTTATGAAAACAGATGCTGAGTTTGTG 1776
Query 1777 TGTGAACGGACACTGAAATATTTTCTAGGAATTGCGGGAGGAAAATGGGTAGTTAGCTATTTCTGGGTGACCCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTGAACGGACACTGAAATATTTTCTAGGAATTGCGGGAGGAAAATGGGTAGTTAGCTATTTCTGGGTGACCCA 1850
Query 1851 GTCTATTAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAGCATGATTTTGAAGTCAGAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTCTATTAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAGCATGATTTTGAAGTCAGAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACC 1924
Query 1925 ACCAAGGTCCAAAGCGAGCAAGAGAATCCCAGGACAGAAAGATCTTCAGGGGGCTAGAAATCTGTTGCTATGGG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCAAGGTCCAAAGCGAGCAAGAGAATCCCAGGACAGAAAGATCTTCAGGGGGCTAGAAATCTGTTGCTATGGG 1998
Query 1999 CCCTTCACCAACATGCCCACAG---------------------------------------------------- 2020
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCCTTCACCAACATGCCCACAGATCAACTGGAATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTCTGTGGTGAAGGAGCT 2072
Query 2021 ----------------------GGTGTCCACCCAATTGTGGTTGTGCAGCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTCATCATTCACCCTTGGCACAGGTGTCCACCCAATTGTGGTTGTGCAGCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATG 2146
Query 2073 GCTTCCATGCAATTGGGCAGATGTG------------------------------------------------- 2097
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTTCCATGCAATTGGGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGACCCGAGAGTGGGTGTTGGACAGTGTAGCACTC 2220
Query 2098 --------------------------------------------------------- 2097
Sbjct 2221 TACCAGTGCCAGGAGCTGGACACCTACCTGATACCCCAGATCCCCCACAGCCACTAC 2277