Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00174
- Subject:
- NM_139294.5
- Aligned Length:
- 2521
- Identities:
- 2042
- Gaps:
- 332
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGCTGA------------------------------------------------GCGGTGGCGGT-- 24
||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGCTGAGTGGCGGCGGTGGCAGCAGCAGCGGTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGCGGTGG 74
Query 25 -------GGTGGCGGCGCGGAGCCGGGCCAGGCTCTGTTCAACGGGGACATGGAGCCCGAGGCCGGCGCCGGCG 91
||.||||||||.||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||| |||||||
Sbjct 75 CGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGCAGGGCCAGGCTCTGTTCAATGGCGACATGGAGCCGGAG------GCCGGCG 142
Query 92 CCGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCTGCCATTCCGGAGGAGGTGTGGAATATCAAACAAATGATTAAG 165
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 143 CTGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCGGCCATTCCTGAAGAGGTATGGAATATCAAGCAAATGATTAAG 216
Query 166 TTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGGGAGCATAATCCACCATCAATATATCTGGA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 217 TTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGAGAGCATAACCCACCATCAATATACCTGGA 290
Query 240 GGCCTATGAAGAATACACCAGCAAGCTAGATGCACTCCAACAAAGAGAACAACAGTTATTGGAATCTCTGGGGA 313
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct 291 GGCCTATGAAGAGTACACCAGCAAGCTAGATGCCCTTCAGCAAAGAGAACAGCAGCTTTTGGAATCCCTG---- 360
Query 314 ACGGAACTGATTTTTCTGTTTCTAGCTCTGCATCAATGGATACCGTTACATCTTCTTCCTCTTCTAGCCTTTCA 387
Sbjct 361 -------------------------------------------------------------------------- 360
Query 388 GTGCTACCTTCATCTCTTTCAGTTTTTCAAAATCCCACAGATGTGGCACGGAGCAACCCCAAGTCACCACAAAA 461
||||||||||.|||||||||||...||||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 361 ---------------------GTTTTTCAAACTCCCACAGATGCATCACGGAACAACCCCAAGTCACCACAGAA 413
Query 462 ACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCTGCAAGGTGTGGAGTTACAGTCCGAG 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 414 ACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCCGCAAGATGTGGTGTTACAGTTCGAG 487
Query 536 ACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTAATCCCAGAGTGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGGA 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 ACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTCATCCCAGAATGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGGA 561
Query 610 GAGAAGAAACCAATTGGTTGGGACACTGATATTTCCTGGCTTACTGGAGAAGAATTGCATGTGGAAGTGTTGGA 683
|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||..||||
Sbjct 562 GAGAAGAAACCAATTGGCTGGGACACGGACATTTCCTGGCTTACTGGAGAGGAGTTACATGTTGAAGTACTGGA 635
Query 684 GAATGTTCCACTTACAACACACAACTTTGTACGAAAAACGTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACTTTTGTCGAA 757
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 636 GAATGTCCCACTTACAACACACAACTTTGTACGGAAAACTTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACTTTTGCCGAA 709
Query 758 AGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGCTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGTTGTAGTACAGAAGTTCCA 831
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 710 AGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGTTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGTTGTAGTACAGAGGTTCCA 783
Query 832 CTGATGTGTGTTAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAACACCACCCAATACCACA 905
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||
Sbjct 784 CTGATGTGTGTAAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAGCATCACCCAGTACCACA 857
Query 906 GGAAGAGGCGTCCTTAGCAGAGACTGCCCTAACATCTGGATCATCCCCTTCCGCACCCGCCTCGGACTCTATTG 979
|||.|||||.|||||..|||||||||||||..||||||| ||||.|||||||||||.||||.|||||||.||
Sbjct 858 GGAGGAGGCCTCCTTCCCAGAGACTGCCCTTCCATCTGG---ATCCTCTTCCGCACCCCCCTCAGACTCTACTG 928
Query 980 GGCCCCAAATTCTCACCAGTCCGTCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTTCCGACCAGCAGATGAA 1053
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 GGCCCCAAATCCTCACCAGTCCATCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTTCCGACCAGCAGATGAA 1002
Query 1054 GATCATCGAAATCAATTTGGGCAACGAGACCGATCCTCATCAGCTCCCAATGTGCATATAAACACAATAGAACC 1127
||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1003 GATCATCGCAATCAGTTTGGGCAACGAGACCGGTCCTCCTCAGCTCCCAATGTTCATATAAACACAATTGAGCC 1076
Query 1128 TGTCAATATTGAT------------------------------------GACTTGATTAGAGACCAAGGATTTC 1165
|||.|||||.||| ||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1077 TGTGAATATCGATGAAAAATTCCCAGAAGTGGAATTACAGGATCAAAGGGATTTGATTAGAGACCAGGGGTTTC 1150
Query 1166 GTGGTGATG----------------------------------------------------------------- 1174
|||||||||
Sbjct 1151 GTGGTGATGGAGCCCCCTTGAACCAACTGATGCGCTGTCTTCGGAAATACCAATCCCGGACTCCCAGCCCCCTC 1224
Query 1175 -------------------------------------------------------GAGGATCAACCACAGGTTT 1193
||||.|||||||||||.||
Sbjct 1225 CTCCATTCTGTCCCCAGTGAAATAGTGTTTGATTTTGAGCCTGGCCCAGTGTTCAGAGGGTCAACCACAGGCTT 1298
Query 1194 GTCTGCTACCCCCCCTGCCTCATTACCTGGCTCACTAACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGACCTC 1267
|||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1299 GTCCGCCACCCCGCCTGCCTCATTACCTGGCTCACTCACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGTCCTC 1372
Query 1268 AGCGAGAAAGGAAGTCATCT------TCATCCTCAGAAGACAGGAATCGAATGAAAACACTTGGTAGACGGGAC 1335
||||.||||||||||||||| ||||||||.||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||.|.||.
Sbjct 1373 AGCGGGAAAGGAAGTCATCTTCTTCCTCATCCTCGGAGGACAGAAGTCGGATGAAAACACTTGGTAGAAGAGAT 1446
Query 1336 TCGAGTGATGATTGGGAGATTCCTGATGGGCAGATTACAGTGGGACAAAGAATTGGATCTGGATCATTTGGAAC 1409
||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1447 TCAAGTGATGACTGGGAGATTCCTGATGGACAGATTACAGTGGGACAGAGAATTGGATCTGGGTCATTTGGAAC 1520
Query 1410 AGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGATGTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCTACACCTCAGCAGT 1483
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1521 TGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGATGTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCCACACCTCAACAGC 1594
Query 1484 TACAAGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGTACTCAGGAAAACACGACATGTGAATATCCTACTCTTCATGGGCTAT 1557
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1595 TACAGGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGTGCTCAGGAAAACTCGACATGTGAATATCCTCCTTTTCATGGGCTAT 1668
Query 1558 TCCACAAAGCCACAACTGGCTATTGTTACCCAGTGGTGTGAGGGCTCCAGCTTGTATCACCATCTCCATATCAT 1631
||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1669 TCTACAAAGCCACAACTGGCAATTGTTACACAGTGGTGTGAGGGCTCCAGCTTATATCACCATCTCCACATCAT 1742
Query 1632 TGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCACGACAGACTGCACAGGGCATGGATTACTTACACG 1705
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743 TGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCTCGGCAGACTGCACAGGGCATGGATTACTTACACG 1816
Query 1706 CCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAAGAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACAGTAAAAATAGGT 1779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1817 CCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAAGAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACGGTAAAAATAGGT 1890
Query 1780 GATTTTGGTCTAGCTACAGTGAAATCTCGATGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCCATTTT 1853
||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1891 GACTTTGGTCTAGCCACAGTGAAATCTCGGTGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCTATTTT 1964
Query 1854 GTGGATGGCACCAGAAGTCATCAGAATGCAAGATAAAAATCCATACAGCTTTCAGTCAGATGTATATGCATTTG 1927
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1965 GTGGATGGCACCAGAAGTAATCAGAATGCAAGATAAAAACCCGTATAGCTTTCAGTCAGACGTGTATGCGTTTG 2038
Query 1928 GAATTGTTCTGTATGAATTGATGACTGGACAGTTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGACCAGATAATTTTT 2001
|.|||||||||||.|||.|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2039 GGATTGTTCTGTACGAACTGATGACCGGCCAGCTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGATCAGATAATTTTT 2112
Query 2002 ATGGTGGGACGAGGATACCTGTCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCATGAAGAGATT 2075
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 ATGGTGGGACGAGGATACCTATCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCATGAAGAGATT 2186
Query 2076 AATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGATGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCTATTGAGCTGC 2149
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2187 AATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGACGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCCATTGAGCTGC 2260
Query 2150 TGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCCTCCTTGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAGAG 2223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2261 TGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCTTCCTTGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAGAA 2334
Query 2224 GATTTTAGTCTATATGCTTGTGCTTCTCCAAAAACACCCATCCAGGCAGGGGGATATGGTGCGTTT----CCTG 2293
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|..||| |||
Sbjct 2335 GATTTTAGTCTGTATGCTTGTGCTTCTCCGAAAACACCCATCCAAGCAGGGGGATATGGAGAATTTGCAGCCT- 2407
Query 2294 TCCAC 2298
||.|.
Sbjct 2408 TCAAG 2412