Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00174
- Subject:
- XM_011241137.1
- Aligned Length:
- 2530
- Identities:
- 2027
- Gaps:
- 359
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGCTGA------------------------------------------------GCGGTGGCGGT-- 24
||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGCTGAGTGGCGGCGGTGGCAGCAGCAGCGGTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGCGGTGG 74
Query 25 -------GGTGGCGGCGCGGAGCCGGGCCAGGCTCTGTTCAACGGGGACATGGAGCCCGAGGCCGGCGCCGGCG 91
||.||||||||.||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||| |||||||
Sbjct 75 CGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGCAGGGCCAGGCTCTGTTCAATGGCGACATGGAGCCGGAG------GCCGGCG 142
Query 92 CCGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCTGCCATTCCGGAGGAGGTGTGGAATATCAAACAAATGATTAAG 165
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 143 CTGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCGGCCATTCCTGAAGAGGTATGGAATATCAAGCAAATGATTAAG 216
Query 166 TTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGGGAGCATAATCCACCATCAATATATCTGGA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 217 TTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGAGAGCATAACCCACCATCAATATACCTGGA 290
Query 240 GGCCTATGAAGAATACACCAGCAAGCTAGATGCACTCCAACAAAGAGAACAACAGTTATTGGAATCTCTGGGGA 313
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||.||||
Sbjct 291 GGCCTATGAAGAGTACACCAGCAAGCTAGATGCCCTTCAGCAAAGAGAACAGCAGCTTTTGGAATCCCTGG--- 361
Query 314 ACGGAACTGATTTTTCTGTTTCTAGCTCTGCATCAATGGATACCGTTACATCTTCTTCCTCTTCTAGCCTTTCA 387
.|||||
Sbjct 362 ---------------------------ATGCAT----------------------------------------- 367
Query 388 GTGCTACCTTCATCTCTTTCAGTTTTTCAAAATCCCACAGATGTGGCACGGAGCAACCCCAAGTCACCACAAAA 461
||||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 368 ----------------------------------------------CACGGAACAACCCCAAGTCACCACAGAA 395
Query 462 ACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCTGCAAGGTGTGGAGTTACAGTCCGAG 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 396 ACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCCGCAAGATGTGGTGTTACAGTTCGAG 469
Query 536 ACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTAATCCCAGAGTGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGG- 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 ACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTCATCCCAGAATGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGGG 543
Query 609 --------AGAGAAGAAACCAATTGGTTGGGACACTGATATTTCCTGGCTTACTGGAGAAGAATTGCATGTGGA 674
||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 544 TATGGTTTAGAGAAGAAACCAATTGGCTGGGACACGGACATTTCCTGGCTTACTGGAGAGGAGTTACATGTTGA 617
Query 675 AGTGTTGGAGAATGTTCCACTTACAACACACAACTTTGTACGAAAAACGTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACT 748
|||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 AGTACTGGAGAATGTCCCACTTACAACACACAACTTTGTACGGAAAACTTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACT 691
Query 749 TTTGTCGAAAGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGCTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGTTGTAGTACA 822
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 TTTGCCGAAAGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGTTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGTTGTAGTACA 765
Query 823 GAAGTTCCACTGATGTGTGTTAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAACACCACCC 896
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 766 GAGGTTCCACTGATGTGTGTAAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAGCATCACCC 839
Query 897 AATACCACAGGAAGAGGCGTCCTTAGCAGAGACTGCCCTAACATCTGGATCATCCCCTTCCGCACCCGCCTCGG 970
|.||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||..||||||| ||||.|||||||||||.||||.|
Sbjct 840 AGTACCACAGGAGGAGGCCTCCTTCCCAGAGACTGCCCTTCCATCTGG---ATCCTCTTCCGCACCCCCCTCAG 910
Query 971 ACTCTATTGGGCCCCAAATTCTCACCAGTCCGTCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTTCCGACCA 1044
||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 ACTCTACTGGGCCCCAAATCCTCACCAGTCCATCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTTCCGACCA 984
Query 1045 GCAGATGAAGATCATCGAAATCAATTTGGGCAACGAGACCGATCCTCATCAGCTCCCAATGTGCATATAAACAC 1118
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 985 GCAGATGAAGATCATCGCAATCAGTTTGGGCAACGAGACCGGTCCTCCTCAGCTCCCAATGTTCATATAAACAC 1058
Query 1119 AATAGAACCTGTCAATATTGAT------------------------------------GACTTGATTAGAGACC 1156
|||.||.|||||.|||||.||| ||.|||||||||||||
Sbjct 1059 AATTGAGCCTGTGAATATCGATGAAAAATTCCCAGAAGTGGAATTACAGGATCAAAGGGATTTGATTAGAGACC 1132
Query 1157 AAGGATTTCGTGGTGATG-------------------------------------------------------- 1174
|.||.|||||||||||||
Sbjct 1133 AGGGGTTTCGTGGTGATGGAGCCCCCTTGAACCAACTGATGCGCTGTCTTCGGAAATACCAATCCCGGACTCCC 1206
Query 1175 ----------------------------------------------------------------GAGGATCAAC 1184
||||.|||||
Sbjct 1207 AGCCCCCTCCTCCATTCTGTCCCCAGTGAAATAGTGTTTGATTTTGAGCCTGGCCCAGTGTTCAGAGGGTCAAC 1280
Query 1185 CACAGGTTTGTCTGCTACCCCCCCTGCCTCATTACCTGGCTCACTAACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTC 1258
||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 CACAGGCTTGTCCGCCACCCCGCCTGCCTCATTACCTGGCTCACTCACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTC 1354
Query 1259 CAGGACCTCAGCGAGAAAGGAAGTCATCT------TCATCCTCAGAAGACAGGAATCGAATGAAAACACTTGGT 1326
||||.||||||||.||||||||||||||| ||||||||.||.|||||.|.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1355 CAGGTCCTCAGCGGGAAAGGAAGTCATCTTCTTCCTCATCCTCGGAGGACAGAAGTCGGATGAAAACACTTGGT 1428
Query 1327 AGACGGGACTCGAGTGATGATTGGGAGATTCCTGATGGGCAGATTACAGTGGGACAAAGAATTGGATCTGGATC 1400
|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1429 AGAAGAGATTCAAGTGATGACTGGGAGATTCCTGATGGACAGATTACAGTGGGACAGAGAATTGGATCTGGGTC 1502
Query 1401 ATTTGGAACAGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGATGTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCTACAC 1474
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1503 ATTTGGAACTGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGATGTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCCACAC 1576
Query 1475 CTCAGCAGTTACAAGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGTACTCAGGAAAACACGACATGTGAATATCCTACTCTTC 1548
||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1577 CTCAACAGCTACAGGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGTGCTCAGGAAAACTCGACATGTGAATATCCTCCTTTTC 1650
Query 1549 ATGGGCTATTCCACAAAGCCACAACTGGCTATTGTTACCCAGTGGTGTGAGGGCTCCAGCTTGTATCACCATCT 1622
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1651 ATGGGCTATTCTACAAAGCCACAACTGGCAATTGTTACACAGTGGTGTGAGGGCTCCAGCTTATATCACCATCT 1724
Query 1623 CCATATCATTGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCACGACAGACTGCACAGGGCATGGATT 1696
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 CCACATCATTGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCTCGGCAGACTGCACAGGGCATGGATT 1798
Query 1697 ACTTACACGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAAGAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACAGTA 1770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1799 ACTTACACGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAAGAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACGGTA 1872
Query 1771 AAAATAGGTGATTTTGGTCTAGCTACAGTGAAATCTCGATGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGG 1844
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 AAAATAGGTGACTTTGGTCTAGCCACAGTGAAATCTCGGTGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGG 1946
Query 1845 ATCCATTTTGTGGATGGCACCAGAAGTCATCAGAATGCAAGATAAAAATCCATACAGCTTTCAGTCAGATGTAT 1918
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1947 ATCTATTTTGTGGATGGCACCAGAAGTAATCAGAATGCAAGATAAAAACCCGTATAGCTTTCAGTCAGACGTGT 2020
Query 1919 ATGCATTTGGAATTGTTCTGTATGAATTGATGACTGGACAGTTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGACCAG 1992
||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2021 ATGCGTTTGGGATTGTTCTGTACGAACTGATGACCGGCCAGCTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGATCAG 2094
Query 1993 ATAATTTTTATGGTGGGACGAGGATACCTGTCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCAT 2066
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 ATAATTTTTATGGTGGGACGAGGATACCTATCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCAT 2168
Query 2067 GAAGAGATTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGATGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCTA 2140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2169 GAAGAGATTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGACGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCCA 2242
Query 2141 TTGAGCTGCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCCTCCTTGAATCGGGCTGGTTTC 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 TTGAGCTGCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCTTCCTTGAATCGGGCTGGTTTC 2316
Query 2215 CAAACAGAGGATTTTAGTCTATATGCTTGTGCTTCTCCAAAAACACCCATCCAGGCAGGGGGATATGGTGCGTT 2288
||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|..||
Sbjct 2317 CAAACAGAAGATTTTAGTCTGTATGCTTGTGCTTCTCCGAAAACACCCATCCAAGCAGGGGGATATGGAGAATT 2390
Query 2289 T----CCTGTCCAC 2298
| ||| ||.|.
Sbjct 2391 TGCAGCCT-TCAAG 2403