Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00180
- Subject:
- NM_001287344.1
- Aligned Length:
- 2079
- Identities:
- 1977
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCAGTTGGTCCATTCAACAAATGGTTATTGGATGCCCATTATGTGGCAGGCACTGTTCCGGGGGAGAGCA 74
Query 1 ----------------------------ATGGCCGCAGTGATTCTGGAGAGCATCTTTCTGAAGCGATCCCAAC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACAGGTGAACTCCAGAAAGAAGAAGCTATGGCCGCAGTGATTCTGGAGAGCATCTTTCTGAAGCGATCCCAAC 148
Query 47 AGAAAAAGAAAACATCACCTCTAAACTTCAAGAAGCGCCTGTTTCTCTTGACCGTGCACAAACTCTCCTACTAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAAAGAAAACATCACCTCTAAACTTCAAGAAGCGCCTGTTTCTCTTGACCGTGCACAAACTCTCCTACTAT 222
Query 121 GAGTATGACTTTGAACGTGGGAGAAGAGGCAGTAAGAAGGGTTCAATAGATGTTGAGAAGATCACTTGTGTTGA 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGTATGACTTTGAACGTGGGAGAAGAGGCAGTAAGAAGGGTTCAATAGATGTTGAGAAGATCACTTGTGTTGA 296
Query 195 AACAGTGGTTCCTGAAAAAAATCCTCCTCCAGAAAGACAGATTCCGAGAAGAGGTGAAGAGTCCAGTGAAATGG 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACAGTGGTTCCTGAAAAAAATCCTCCTCCAGAAAGACAGATTCCGAGAAGAGGTGAAGAGTCCAGTGAAATGG 370
Query 269 AGCAAATTTCAATCATTGAAAGGTTCCCTTATCCCTTCCAGGTTGTATATGATGAAGGGCCTCTCTACGTCTTC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCAAATTTCAATCATTGAAAGGTTCCCTTATCCCTTCCAGGTTGTATATGATGAAGGGCCTCTCTACGTCTTC 444
Query 343 TCCCCAACTGAAGAACTAAGGAAGCGGTGGATTCACCAGCTCAAAAACGTAATCCGGTACAACAGTGATCTGGT 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCCCCAACTGAAGAACTAAGGAAGCGGTGGATTCACCAGCTCAAAAACGTAATCCGGTACAACAGTGATCTGGT 518
Query 417 TCAGAAATATCACCCTTGCTTCTGGATCGATGGGCAGTATCTCTGCTGCTCTCAGACAGCCAAAAATGCTATGG 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGAAATATCACCCTTGCTTCTGGATCGATGGGCAGTATCTCTGCTGCTCTCAGACAGCCAAAAATGCTATGG 592
Query 491 GCTGCCAAATTTTGGAGAACAGGAATGGAAGCTTAAAACCTGGGAGTTCTCACCGGAAGACAAAAAAGCCTCTT 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTGCCAAATTTTGGAGAACAGGAATGGAAGCTTAAAACCTGGGAGTTCTCACCGGAAGACAAAAAAGCCTCTT 666
Query 565 CCCCCAACGCCTGAGGAGGACCAGATCTTGAAAAAGCCACTACCGCCTGAGCCAGCAGCAGCACCAGTCTCCAC 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCCCAACGCCTGAGGAGGACCAGATCTTGAAAAAGCCACTACCGCCTGAGCCAGCAGCAGCACCAGTCTCCAC 740
Query 639 AAGTGAGCTGAAAAAGGTTGTGGCCCTTTATGATTACATGCCAATGAATGCAAATGATCTACAGCTGCGGAAGG 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAGTGAGCTGAAAAAGGTTGTGGCCCTTTATGATTACATGCCAATGAATGCAAATGATCTACAGCTGCGGAAGG 814
Query 713 GTGATGAATATTTTATCTTGGAGGAAAGCAACTTACCATGGTGGAGAGCACGAGATAAAAATGGGCAGGAAGGC 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGATGAATATTTTATCTTGGAGGAAAGCAACTTACCATGGTGGAGAGCACGAGATAAAAATGGGCAGGAAGGC 888
Query 787 TACATTCCTAGTAACTATGTCACTGAAGCAGAAGACTCCATAGAAATGTATGAGTGGTATTCCAAACACATGAC 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACATTCCTAGTAACTATGTCACTGAAGCAGAAGACTCCATAGAAATGTATGAGTGGTATTCCAAACACATGAC 962
Query 861 TCGGAGTCAGGCTGAGCAACTGCTAAAGCAAGAGGGGAAAGAAGGAGGTTTCATTGTCAGAGACTCCAGCAAAG 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCGGAGTCAGGCTGAGCAACTGCTAAAGCAAGAGGGGAAAGAAGGAGGTTTCATTGTCAGAGACTCCAGCAAAG 1036
Query 935 CTGGCAAATATACAGTGTCTGTGTTTGCTAAATCCACAGGGGACCCTCAAGGGGTGATACGTCATTATGTTGTG 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGGCAAATATACAGTGTCTGTGTTTGCTAAATCCACAGGGGACCCTCAAGGGGTGATACGTCATTATGTTGTG 1110
Query 1009 TGTTCCACACCTCAGAGCCAGTATTACCTGGCTGAGAAGCACCTTTTCAGCACCATCCCTGAGCTCATTAACTA 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGTTCCACACCTCAGAGCCAGTATTACCTGGCTGAGAAGCACCTTTTCAGCACCATCCCTGAGCTCATTAACTA 1184
Query 1083 CCATCAGCACAACTCTGCAGGACTCATATCCAGGCTCAAATATCCAGTGTCTCAACAAAACAAGAATGCACCTT 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCATCAGCACAACTCTGCAGGACTCATATCCAGGCTCAAATATCCAGTGTCTCAACAAAACAAGAATGCACCTT 1258
Query 1157 CCACTGCAGGCCTGGGATACGGATCATGGGAAATTGATCCAAAGGACCTGACCTTCTTGAAGGAGCTGGGGACT 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCACTGCAGGCCTGGGATACGGATCATGGGAAATTGATCCAAAGGACCTGACCTTCTTGAAGGAGCTGGGGACT 1332
Query 1231 GGACAATTTGGGGTAGTGAAGTATGGGAAATGGAGAGGCCAGTACGACGTGGCCATCAAGATGATCAAAGAAGG 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGACAATTTGGGGTAGTGAAGTATGGGAAATGGAGAGGCCAGTACGACGTGGCCATCAAGATGATCAAAGAAGG 1406
Query 1305 CTCCATGTCTGAAGATGAATTCATTGAAGAAGCCAAAGTCATGATGAATCTTTCCCATGAGAAGCTGGTGCAGT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTCCATGTCTGAAGATGAATTCATTGAAGAAGCCAAAGTCATGATGAATCTTTCCCATGAGAAGCTGGTGCAGT 1480
Query 1379 TGTATGGCGTCTGCACCAAGCAGCGCCCCATCTTCATCATCACTGAGTACATGGCCAATGGCTGCCTCCTGAAC 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGTATGGCGTCTGCACCAAGCAGCGCCCCATCTTCATCATCACTGAGTACATGGCCAATGGCTGCCTCCTGAAC 1554
Query 1453 TACCTGAGGGAGATGCGCCACCGCTTCCAGACTCAGCAGCTGCTAGAGATGTGCAAGGATGTCTGTGAAGCCAT 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TACCTGAGGGAGATGCGCCACCGCTTCCAGACTCAGCAGCTGCTAGAGATGTGCAAGGATGTCTGTGAAGCCAT 1628
Query 1527 GGAATACCTGGAGTCAAAGCAGTTCCTTCACCGAGACCTGGCAGCTCGAAACTGTTTGGTAAACGATCAAGGAG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGAATACCTGGAGTCAAAGCAGTTCCTTCACCGAGACCTGGCAGCTCGAAACTGTTTGGTAAACGATCAAGGAG 1702
Query 1601 TTGTTAAAGTATCTGATTTCGGCCTGTCCAGGTATGTCCTGGATGATGAATACACAAGCTCAGTAGGCTCCAAA 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTGTTAAAGTATCTGATTTCGGCCTGTCCAGGTATGTCCTGGATGATGAATACACAAGCTCAGTAGGCTCCAAA 1776
Query 1675 TTTCCAGTCCGGTGGTCCCCACCGGAAGTCCTGATGTATAGCAAGTTCAGCAGCAAATCTGACATTTGGGCTTT 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTTCCAGTCCGGTGGTCCCCACCGGAAGTCCTGATGTATAGCAAGTTCAGCAGCAAATCTGACATTTGGGCTTT 1850
Query 1749 TGGGGTTTTGATGTGGGAAATTTACTCCCTGGGGAAGATGCCATATGAGAGATTTACTAACAGTGAGACTGCTG 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGGGTTTTGATGTGGGAAATTTACTCCCTGGGGAAGATGCCATATGAGAGATTTACTAACAGTGAGACTGCTG 1924
Query 1823 AACACATTGCCCAAGGCCTACGTCTCTACAGGCCTCATCTGGCTTCAGAGAAGGTATATACCATCATGTACAGT 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AACACATTGCCCAAGGCCTACGTCTCTACAGGCCTCATCTGGCTTCAGAGAAGGTATATACCATCATGTACAGT 1998
Query 1897 TGCTGGCATGAGAAAGCAGATGAGCGTCCCACTTTCAAAATTCTTCTGAGCAATATTCTAGATGTCATGGATGA 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCTGGCATGAGAAAGCAGATGAGCGTCCCACTTTCAAAATTCTTCTGAGCAATATTCTAGATGTCATGGATGA 2072
Query 1971 AGAATCC 1977
|||||||
Sbjct 2073 AGAATCC 2079