Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00180
- Subject:
- NM_001287345.1
- Aligned Length:
- 1977
- Identities:
- 1449
- Gaps:
- 528
Alignment
Query 1 ATGGCCGCAGTGATTCTGGAGAGCATCTTTCTGAAGCGATCCCAACAGAAAAAGAAAACATCACCTCTAAACTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGCAGTGATTCTGGAGAGCATCTTTCTGAAGCGATCCCAACAGAAAAAGAAAACATCACCTCTAAACTT 74
Query 75 CAAGAAGCGCCTGTTTCTCTTGACCGTGCACAAACTCTCCTACTATGAGTATGACTTTGAACGTGGGAGAAGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAGAAGCGCCTGTTTCTCTTGACCGTGCACAAACTCTCCTACTATGAGTATGACTTTGAACGTGGGAGAAGAG 148
Query 149 GCAGTAAGAAGGGTTCAATAGATGTTGAGAAGATCACTTGTGTTGAAACAGTGGTTCCTGAAAAAAATCCTCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAGTAAGAAGGGTTCAATAGATGTTGAGAAGATCACTTGTGTTGAAACAGTGGTTCCTGAAAAAAATCCTCCT 222
Query 223 CCAGAAAGACAGATTCCGAGAAGAGGTGAAGAGTCCAGTGAAATGGAGCAAATTTCAATCATTGAAAGGTTCCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAGAAAGACAGATTCCGAGAAGAGGTGAAGAGTCCAGTGAAATGGAGCAAATTTCAATCATTGAAAGGTTCCC 296
Query 297 TTATCCCTTCCAGGTTGTATATGATGAAGGGCCTCTCTACGTCTTCTCCCCAACTGAAGAACTAAGGAAGCGGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTATCCCTTCCAGGTTGTATATGATGAAGGGCCTCTCTACGTCTTCTCCCCAACTGAAGAACTAAGGAAGCGGT 370
Query 371 GGATTCACCAGCTCAAAAACGTAATCCGGTACAACAGTGATCTGGTTCAGAAATATCACCCTTGCTTCTGGATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGATTCACCAGCTCAAAAACGTAATCCGGTACAACAGTGATCTGGTTCAGAAATATCACCCTTGCTTCTGGATC 444
Query 445 GATGGGCAGTATCTCTGCTGCTCTCAGACAGCCAAAAATGCTATGGGCTGCCAAATTTTGGAGAACAGGAATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGGGCAGTATCTCTGCTGCTCTCAGACAGCCAAAAATGCTATGGGCTGCCAAATTTTGGAGAACAGGAATGG 518
Query 519 AAGCTTAAAACCTGGGAGTTCTCACCGGAAGACAAAAAAGCCTCTTCCCCCAACGCCTGAGGAGGACCAGATCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGCTTAAAACCTGGGAGTTCTCACCGGAAGACAAAAAAGCCTCTTCCCCCAACGCCTGAGGAGGACCAGATCT 592
Query 593 TGAAAAAGCCACTACCGCCTGAGCCAGCAGCAGCACCAGTCTCCACAAGTGAGCTGAAAAAGGTTGTGGCCCTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAAAAAGCCACTACCGCCTGAGCCAGCAGCAGCACCAGTCTCCACAAGTGAGCTGAAAAAGGTTGTGGCCCTT 666
Query 667 TATGATTACATGCCAATGAATGCAAATGATCTACAGCTGCGGAAGGGTGATGAATATTTTATCTTGGAGGAAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGATTACATGCCAATGAATGCAAATGATCTACAGCTGCGGAAGGGTGATGAATATTTTATCTTGGAGGAAAG 740
Query 741 CAACTTACCATGGTGGAGAGCACGAGATAAAAATGGGCAGGAAGGCTACATTCCTAGTAACTATGTCACTGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACTTACCATGGTGGAGAGCACGAGATAAAAATGGGCAGGAAGGCTACATTCCTAGTAACTATGTCACTGAAG 814
Query 815 CAGAAGACTCCATAGAAATGTATGAGTGGTATTCCAAACACATGACTCGGAGTCAGGCTGAGCAACTGCTAAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAAGACTCCATAGAAATGTATGAGTGGTATTCCAAACACATGACTCGGAGTCAGGCTGAGCAACTGCTAAAG 888
Query 889 CAAGAGGGGAAAGAAGGAGGTTTCATTGTCAGAGACTCCAGCAAAGCTGGCAAATATACAGTGTCTGTGTTTGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGAGGGGAAAGAAGGAGGTTTCATTGTCAGAGACTCCAGCAAAGCTGGCAAATATACAGTGTCTGTGTTTGC 962
Query 963 TAAATCCACAGGGGACCCTCAAGGGGTGATACGTCATTATGTTGTGTGTTCCACACCTCAGAGCCAGTATTACC 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAATCCACAGGGGACCCTCAAGGGGTGATACGTCATTATGTTGTGTGTTCCACACCTCAGAGCCAGTATT--- 1033
Query 1037 TGGCTGAGAAGCACCTTTTCAGCACCATCCCTGAGCTCATTAACTACCATCAGCACAACTCTGCAGGACTCATA 1110
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1111 TCCAGGCTCAAATATCCAGTGTCTCAACAAAACAAGAATGCACCTTCCACTGCAGGCCTGGGATACGGATCATG 1184
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1185 GGAAATTGATCCAAAGGACCTGACCTTCTTGAAGGAGCTGGGGACTGGACAATTTGGGGTAGTGAAGTATGGGA 1258
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1259 AATGGAGAGGCCAGTACGACGTGGCCATCAAGATGATCAAAGAAGGCTCCATGTCTGAAGATGAATTCATTGAA 1332
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1333 GAAGCCAAAGTCATGATGAATCTTTCCCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGGCGTCTGCACCAAGCAGCGCCC 1406
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1407 CATCTTCATCATCACTGAGTACATGGCCAATGGCTGCCTCCTGAACTACCTGAGGGAGATGCGCCACCGCTTCC 1480
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1481 AGACTCAGCAGCTGCTAGAGATGTGCAAGGATGTCTGTGAAGCCATGGAATACCTGGAGTCAAAGCAGTTCCTT 1554
Sbjct 1034 -------------------------------------------------------------------------- 1033
Query 1555 CACCGAGACCTGGCAGCTCGAAACTGTTTGGTAAACGATCAAGGAGTTGTTAAAGTATCTGATTTCGGCCTGTC 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 -------ACCTGGCAGCTCGAAACTGTTTGGTAAACGATCAAGGAGTTGTTAAAGTATCTGATTTCGGCCTGTC 1100
Query 1629 CAGGTATGTCCTGGATGATGAATACACAAGCTCAGTAGGCTCCAAATTTCCAGTCCGGTGGTCCCCACCGGAAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 CAGGTATGTCCTGGATGATGAATACACAAGCTCAGTAGGCTCCAAATTTCCAGTCCGGTGGTCCCCACCGGAAG 1174
Query 1703 TCCTGATGTATAGCAAGTTCAGCAGCAAATCTGACATTTGGGCTTTTGGGGTTTTGATGTGGGAAATTTACTCC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 TCCTGATGTATAGCAAGTTCAGCAGCAAATCTGACATTTGGGCTTTTGGGGTTTTGATGTGGGAAATTTACTCC 1248
Query 1777 CTGGGGAAGATGCCATATGAGAGATTTACTAACAGTGAGACTGCTGAACACATTGCCCAAGGCCTACGTCTCTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 CTGGGGAAGATGCCATATGAGAGATTTACTAACAGTGAGACTGCTGAACACATTGCCCAAGGCCTACGTCTCTA 1322
Query 1851 CAGGCCTCATCTGGCTTCAGAGAAGGTATATACCATCATGTACAGTTGCTGGCATGAGAAAGCAGATGAGCGTC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 CAGGCCTCATCTGGCTTCAGAGAAGGTATATACCATCATGTACAGTTGCTGGCATGAGAAAGCAGATGAGCGTC 1396
Query 1925 CCACTTTCAAAATTCTTCTGAGCAATATTCTAGATGTCATGGATGAAGAATCC 1977
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 CCACTTTCAAAATTCTTCTGAGCAATATTCTAGATGTCATGGATGAAGAATCC 1449