Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00192
• Subject: XM_005253114.4
• Aligned Length: 883
• Identities: 542
• Gaps: 338

Alignment

Query   1  ATGGCACATGGGATTCCTTCTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGATGAGTACAGCTCAAACCCCACCCAGGC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCACATGGGATTCCTTCTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGATGAGTACAGCTCAAACCCCACCCAGGC  74

Query  75  ATTCACGCACTACAACATCAACCAGAGCAGATTCCAGCCTCCACATGTACATATGGTCGACCCCATCCCATATG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ATTCACGCACTACAACATCAACCAGAGCAGATTCCAGCCTCCACATGTACATATGGTCGACCCCATCCCATATG  148

Query 149  ACACTCCAAAACCAGCGGGCCACACGCGGTTTGTCTGCATCTCAGACACACACTCCAGAACAGATGGTATCCAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACACTCCAAAACCAGCGGGCCACACGCGGTTTGTCTGCATCTCAGACACACACTCCAGAACAGATGGTATCCAG  222

Query 223  ATGCCTTATGGGGACATCCTTCTCCACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCTCAGAGGTTAAGAAGTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ATGCCTTATGGGGACATCCTTCTCCACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCTCAGAGGTTAAGAAGTT  296

Query 297  TAATGACTGGTTAGGAAACCTGCCATATGAATATAAAATAGTGATTGCTGGGAATCATGAACTGACATTTGATA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TAATGACTGGTTAGGAAACCTGCCATATGAATATAAAATAGTGATTGCTGGGAATCATGAACTGACATTTGATA  370

Query 371  AGGAATTCATGGCAGACCTTGTTAAACAGGACTACTACCGTTTCCCCTCTGTGTCCAAATTGAAACCAGAGGAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGGAATTCATGGCAGACCTTGTTAAACAGGACTACTACCGTTTCCCCTCTGTGTCCAAATTGAAACCAGAGGAC  444

Query 445  TTTGACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTACTTACAAGATTCGGAGGTAACAGTGAAGGGATTCAG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TTTGACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTACTTACAAGATTCGGAGGTAACAGTGAAGGGATTCAG  518

Query 519  GATATACGGTGCACCTTG-GACCCCGTGGTTTAATGGATGGGGCTTTAACCTACCCAGAGGTCAGTCTCTGCTG  591
           |||||||||||||||||| ||||.|..|                                              
Sbjct 519  GATATACGGTGCACCTTGTGACCACAAG----------------------------------------------  546

Query 592  GACAAGTGGAACCTCATCCCTGAGGGCATTGACATACTCATGACACATGGACCTCCTCTAGGTTTTCGAGACTG  665
                                                                                     
Sbjct 547  --------------------------------------------------------------------------  546

Query 666  GGTTCCAAAGGAGCTTCAAAGAGTGGGCTGTGTGGAGCTGTTAAACACGGTTCAGAGGCGAGTCCGGCCCAAGC  739
                                                                                     
Sbjct 547  --------------------------------------------------------------------------  546

Query 740  TCCATGTGTTTGGTGGAATCCATGAAGGTTATGGCATCATGACCGACGGTTACACAACGTACATCAATGCCTCG  813
                                                                                     
Sbjct 547  --------------------------------------------------------------------------  546

Query 814  ACGTGTACAGTCAGCTTTCAACCGACCAACCCTCCAATTATATTTGACCTTCCAAACCCACAGGGTTCC  882
                                                                                
Sbjct 547  ---------------------------------------------------------------------  546