Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00235
- Subject:
- NM_001350683.1
- Aligned Length:
- 2208
- Identities:
- 2208
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGGAAATCCAGAAAACATAGAAGATGCATATGTTGCTGTTATTCGTCCAAAGAATACTGCCAGTCTCAATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAAATCCAGAAAACATAGAAGATGCATATGTTGCTGTTATTCGTCCAAAGAATACTGCCAGTCTCAATTC 74
Query 75 TCGGGAATACAGAGCTAAGTCATATGAAATTTTGTTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGAGAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGGGAATACAGAGCTAAGTCATATGAAATTTTGTTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGAGAA 148
Query 149 AGAAAGTTTTATTGGAAACGAAACTTCAAGGCAACAGTGAAATAACACAAGGCATATTGGATTACGTAGTAGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAGTTTTATTGGAAACGAAACTTCAAGGCAACAGTGAAATAACACAAGGCATATTGGATTACGTAGTAGAA 222
Query 223 ACCACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGTATCAGAGGAAAACGAGTTGTACTAATGAAAAAATTTCCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGTATCAGAGGAAAACGAGTTGTACTAATGAAAAAATTTCCTCT 296
Query 297 GGATGGAGAGAAGATGGGCAGAGAAGCATCATTATTTATTGTTCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGATGGAGAGAAGATGGGCAGAGAAGCATCATTATTTATTGTTCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATACA 370
Query 371 CATATACCCCAGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGCGAGTCTGTAGTGAATCCAGTACTCAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CATATACCCCAGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGCGAGTCTGTAGTGAATCCAGTACTCAT 444
Query 445 TTTGCTACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCACAATCTCACTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGCTACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCACAATCTCACTT 518
Query 519 TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCTCTTGAGCGGATAAAAACTAATGTCATAAATCCTGCATATGCTACTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCTCTTGAGCGGATAAAAACTAATGTCATAAATCCTGCATATGCTACTG 592
Query 593 AATCAGGTCAGACAGAAAACTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGTTAGCCCTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AATCAGGTCAGACAGAAAACTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGTTAGCCCTA 666
Query 667 GAGAAAGCAGATACCTGTATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGATCTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAAAGCAGATACCTGTATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGATCTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAGT 740
Query 741 GGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGGC 814
Query 815 AGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAAGGAACGACAGTGGGTAGATGATTTTCCTCTCCACCGAAGCGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAAGGAACGACAGTGGGTAGATGATTTTCCTCTCCACCGAAGCGCC 888
Query 889 TGTGAAGGAGATTCAGAATTACTAAGCCGTCTTCTCAGTGAAAGATTTTCAGTCAACCAGTTAGATAGTGACCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGAAGGAGATTCAGAATTACTAAGCCGTCTTCTCAGTGAAAGATTTTCAGTCAACCAGTTAGATAGTGACCA 962
Query 963 CTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAGT 1036
Query 1037 GCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAATA 1110
Query 1111 GTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATAT 1184
Query 1185 TTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATATG 1258
Query 1259 AAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGTG 1332
Query 1333 CAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAAA 1406
Query 1407 CCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAAT 1480
Query 1481 TGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGTT 1554
Query 1555 GAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCTT 1628
Query 1629 TTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAGA 1702
Query 1703 GTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAGT 1776
Query 1777 AAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAGA 1850
Query 1851 AATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACAG 1924
Query 1925 GACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGGA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGGA 1998
Query 1999 CTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGGG 2072
Query 2073 AGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCTG 2146
Query 2147 GTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA 2208