Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00235
• Subject: NM_030675.3
• Aligned Length: 2208
• Identities: 1991
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGAAATCCAGAAAACATAGAAGATGCATATGTTGCTGTTATTCGTCCAAAGAATACTGCCAGTCTCAATTC  74
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGAAATCCAGAAAACATCGAAGATGCTTACGTTGCAGTTATTCGTCCAAAGAACACTGCTAGTCTCAACTC  74

Query   75  TCGGGAATACAGAGCTAAGTCATATGAAATTTTGTTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGAGAA  148
            .|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  CCGGGAGTATAGAGCTAAGTCCTATGAAATTTTATTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGCGAA  148

Query  149  AGAAAGTTTTATTGGAAACGAAACTTCAAGGCAACAGTGAAATAACACAAGGCATATTGGATTACGTAGTAGAA  222
            ||||||||||..|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  AGAAAGTTTTGCTGGAAACTAAACTTCAAAGCAACAGTGAAATAGCACAAGGCATATTGGACTATGTAGTAGAA  222

Query  223  ACCACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGTATCAGAGGAAAACGAGTTGTACTAATGAAAAAATTTCCTCT  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||.||||||||.||.||.||||..||.||||||||
Sbjct  223  ACTACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGGATTAAAGGGAAACGAGTGGTGCTGATGAGGAAGTTTCCTCT  296

Query  297  GGATGGAGAGAAGATGGGCAGAGAAGCATCATTATTTATTGTTCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATACA  370
            |||.||||||||||..||||||||||||.||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  297  GGACGGAGAGAAGACAGGCAGAGAAGCAGCACTGTTTATCGTGCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATATG  370

Query  371  CATATACCCCAGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGCGAGTCTGTAGTGAATCCAGTACTCAT  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CATATACTCCTGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGAGAGTTTGTAGTGAATCCAGTACTCAC  444

Query  445  TTTGCTACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCACAATCTCACTT  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  TTTGCAACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCGCAGTCTCACTT  518

Query  519  TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCTCTTGAGCGGATAAAAACTAATGTCATAAATCCTGCATATGCTACTG  592
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|||
Sbjct  519  TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCCCTTGAACGGATAAAGACAAATGTCATAAACCCTGCGTATGCTGCTG  592

Query  593  AATCAGGTCAGACAGAAAACTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGTTAGCCCTA  666
            |||.|||.|||..|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  593  AATTAGGCCAGGTAGACAATTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGCTAGCCCTA  666

Query  667  GAGAAAGCAGATACCTGTATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGATCTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAGT  740
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAAAGCAGACACCTGCATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGATCTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAGT  740

Query  741  GGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTAATAAATCCATACTTTGGTCTCGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATTCCCAAACAGGAAAAATGGC  814

Query  815  AGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAAGGAACGACAGTGGGTAGATGATTTTCCTCTCCACCGAAGCGCC  888
            ||.|||||||||||||.||....||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.||.||||..|||
Sbjct  815  AGCGAAGCATGAGCAGCGTTGTGGAAGACAAAGAACGACAGTGGGTTGATGACTTTCCTTTACATCGAAATGCC  888

Query  889  TGTGAAGGAGATTCAGAATTACTAAGCCGTCTTCTCAGTGAAAGATTTTCAGTCAACCAGTTAGATAGTGACCA  962
            |||||||||||||||||||||||.||||.|||||||..|.||.||.|||||||||||||..||||||.||||||
Sbjct  889  TGTGAAGGAGATTCAGAATTACTGAGCCATCTTCTCGATAAAGGACTTTCAGTCAACCAACTAGATAATGACCA  962

Query  963  CTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAGT  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTATTAGAGAAAGGAAAGT  1036

Query 1037  GCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAATA  1110
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  GCAATCCAAACCTTTTAAATGGGCAGCTCAGCTCACCGCTTCACTTTGCTGCTGGAGGCGGCCATGCTGAAATA  1110

Query 1111  GTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATAT  1184
            ||.|||||.|||||.|..||||||||.|..||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1111  GTGCAGATCCTCCTGACTCACCCAGACATTGACAGGCACATAACAGATCAACAAGGAAGATCCCCATTAAATGT  1184

Query 1185  TTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATATG  1258
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1185  TTGTGAAGAAAACAAACAAAATAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAAGACGCCATTAACAAGCCATATG  1258

Query 1259  AAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGTG  1332
            |||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||..
Sbjct 1259  AAAAAGTTCGAATCTATAGAATGGATGGATCATACCGTTCTGTTGAACTAAAGCATGGCAATAATACCACAGCA  1332

Query 1333  CAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAAA  1406
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CAGCAGATAATGGAGGGAATGCGGCTCTCTCAGGAAACTCAGCGATATTTCACTATTTGGATCTGTTCAGAAAA  1406

Query 1407  CCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAAT  1480
            .||.||.|||||..||||.||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCTTAGTCTTCAGTTCAAGCCTTATCATAAACCCTTGCAACAAGTTCATGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAAT  1480

Query 1481  TGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGTT  1554
            ||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1481  TGACTAATTTGGATCCACAAAGAGAAACACCACAGCTTTTCCTAAGAAGAGATGTGGGACTTCCTTTAGAAGTT  1554

Query 1555  GAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCTT  1628
            ||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1555  GAGAAAAAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTACTGAAGGGCTT  1628

Query 1629  TTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAGA  1702
            |||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1629  TTATACAGCTCCTGATGCTAAACTGATAACACTGGCAAGTCTACTGTTACAAATAGTTTATGGGAATTATGAGA  1702

Query 1703  GTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAGT  1776
            |||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1703  GTAAAAAGCACAAACAAGGTTTCTTAAATGAAGAAACTCTGAAATCCATCGTACCTATTACTAAACTGAAAAGT  1776

Query 1777  AAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAGA  1850
            |||||.||||||||||.|||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||...|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1777  AAGGCGCCTCACTGGATAAACCGAATACTCCATGAGTACAAGAATCTGAGTCTGAGTGAGGGCGTCAGTAAGGA  1850

Query 1851  AATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACAG  1924
            ||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1851  AATGCACCACCTGCAGCGCATGTTCCTACAGAACTGCTGGGAGATCCCTACGTACGGAGCCGCCTTCTTCACAG  1924

Query 1925  GACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGGA  1998
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCAAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGGA  1998

Query 1999  CTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGGG  2072
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.||||.||||||..||||
Sbjct 1999  CTTCATCTCCTGAACATGGAAACTAAGGCATTACTCATCAGTCTCAAGTACTGTTGCTTTACGTGGCAGCTGGG  2072

Query 2073  AGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCTG  2146
            ||||.|||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2073  AGATGCTGGTACTTGTTTTCAAATCCATAGTATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACACACAAAACAGGCTG  2146

Query 2147  GTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA  2208
            |.||.||||||||.|||.||||||||.||||||||||..||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2147  GCCTTGTGGTAAAGCTGCTAATGAAGTTAAATGGACAACTAATGCCCTCTGAAAGAAATTCA  2208