Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00281
- Subject:
- NM_001359991.1
- Aligned Length:
- 1392
- Identities:
- 1122
- Gaps:
- 195
Alignment
Query 1 ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG 222
|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------ATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG 42
Query 223 CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA 296
||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 43 CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAAAGTATGGCTTCTCTTTGACTA 116
Query 297 TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC 370
||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TGCTGAGCATGACCTCTGGCATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC 190
Query 371 CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG 444
||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 191 CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG 264
Query 445 CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA 518
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA 338
Query 519 CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 339 CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT 412
Query 593 GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT 666
||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||| ||||||
Sbjct 413 GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATT---------------GGGTGT 471
Query 667 ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA 545
Query 741 TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA 619
Query 815 AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT 888
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 620 AGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATTGCAGCCTTATCAAGTAT 693
Query 889 ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT 962
||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||
Sbjct 694 ATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTGCTCACTATGGACCCAAT 767
Query 963 AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT 1036
||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 768 AAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACTTCCCACGTCAGATGTTT 841
Query 1037 TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA 1110
|.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 842 TCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCCAAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCTGATGAGAAAGGAGACAAA 915
Query 1111 AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA 1184
||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct 916 AAGACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACCACACTAACGGAACTGGCCATCCGGGGAACCAGGACAGCGGCCA 989
Query 1185 CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT 1258
|.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 990 CGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTCATCATGACCT 1063
Query 1259 CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC 1332
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1064 CCGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCTTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCCCAGAGCAGC 1137
Query 1333 ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC 1197