Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00300
• Subject: NM_001048195.3
• Aligned Length: 1314
• Identities: 1263
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGTCACCCAAGCGCATAGCTAAAAGAAGGTCCCCCCCAGCAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAG--  72
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct    1  ATGTCACCCAAGCGCATAGCTAAAAGAAGGTCCCCCCCAGCAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAGGA  74

Query   73  -------------------------------------------------GTCTCACACAGGTCCCACAGCACAG  97
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACGAGGGCCGCTGCCTCCCGCCGCGTTCCTGGCGCCCGCTCCTGCCAAGTCTCACACAGGTCCCACAGCACAG  148

Query   98  AACCCGGCTTGGTGCTGACACTAGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGCTGGGTGAGAATGTGATGGAGAGG  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACCCGGCTTGGTGCTGACACTAGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGCTGGGTGAGAATGTGATGGAGAGG  222

Query  172  AAGAAGCCGGCCCTGGTATCCATTCCGGAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCTGGGGGCATGCACACCGTGTGTCT  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAAGCCGGCCCTGGTATCCATTCCGGAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCTGGGGGCATGCACACCGTGTGTCT  296

Query  246  AAGCAAAAGTGGCCAGGTCTATTCCTTCGGCTGCAATGATGAGGGTGCCCTGGGAAGGGACACATCAGTGGAGG  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGCAAAAGTGGCCAGGTCTATTCCTTCGGCTGCAATGATGAGGGTGCCCTGGGAAGGGACACATCAGTGGAGG  370

Query  320  GCTCGGAGATGGTCCCTGGGAAAGTGGAGCTGCAAGAGAAGGTGGTACAGGTGTCAGCAGGAGACAGTCACACA  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTCGGAGATGGTCCCTGGGAAAGTGGAGCTGCAAGAGAAGGTGGTACAGGTGTCAGCAGGAGACAGTCACACA  444

Query  394  GCAGCCCTCACCGATGATGGCCGTGTCTTCCTCTGGGGCTCCTTCCGGGACAATAACGGTGTGATTGGACTGTT  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGCCCTCACCGATGATGGCCGTGTCTTCCTCTGGGGCTCCTTCCGGGACAATAACGGTGTGATTGGACTGTT  518

Query  468  GGAGCCCATGAAGAAGAGCATGGTGCCTGTGCAGGTGCAGCTGGATGTGCCTGTGGTAAAGGTGGCCTCAGGAA  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCCCATGAAGAAGAGCATGGTGCCTGTGCAGGTGCAGCTGGATGTGCCTGTGGTAAAGGTGGCCTCAGGAA  592

Query  542  ACGACCACTTGGTGATGCTGACAGCTGATGGTGACCTCTACACCTTGGGCTGCGGGGAACAGGGCCAGCTAGGC  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGACCACTTGGTGATGCTGACAGCTGATGGTGACCTCTACACCTTGGGCTGCGGGGAACAGGGCCAGCTAGGC  666

Query  616  CGTGTGCCTGAGTTATTTGCCAACCGTGGTGGCCGGCAAGGCCTCGAACGACTCCTGGTCCCCAAGTGTGTGAT  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTGTGCCTGAGTTATTTGCCAACCGTGGTGGCCGGCAAGGCCTCGAACGACTCCTGGTCCCCAAGTGTGTGAT  740

Query  690  GCTGAAATCCAGGGGAAGCCGGGGCCACGTGAGATTCCAGGATGCCTTTTGTGGTGCCTATTTCACCTTTGCCA  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGAAATCCAGGGGAAGCCGGGGCCACGTGAGATTCCAGGATGCCTTTTGTGGTGCCTATTTCACCTTTGCCA  814

Query  764  TCTCCCATGAGGGCCACGTGTACGGCTTCGGCCTCTCCAACTACCATCAGCTTGGAACTCCGGGCACAGAATCT  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTCCCATGAGGGCCACGTGTACGGCTTCGGCCTCTCCAACTACCATCAGCTTGGAACTCCGGGCACAGAATCT  888

Query  838  TGCTTCATACCCCAGAACCTAACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTGGGTGGGCTTCTCTGGTGGCCAGCA  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCTTCATACCCCAGAACCTAACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTGGGTGGGCTTCTCTGGTGGCCAGCA  962

Query  912  CCATACAGTCTGCATGGATTCGGAAGGAAAAGCATACAGCCTGGGCCGGGCTGAGTATGGGCGGCTGGGCCTTG  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCATACAGTCTGCATGGATTCGGAAGGAAAAGCATACAGCCTGGGCCGGGCTGAGTATGGGCGGCTGGGCCTTG  1036

Query  986  GAGAGGGTGCTGAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATCTCCAGGCTGCCTGCTGTCTCCTCGGTGGCTTGTGGG  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGAGGGTGCTGAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATCTCCAGGCTGCCTGCTGTCTCCTCGGTGGCTTGTGGG  1110

Query 1060  GCCTCTGTGGGGTATGCTGTGACCAAGGATGGTCGTGTTTTCGCCTGGGGCATGGGCACCAACTACCAGCTGGG  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTCTGTGGGGTATGCTGTGACCAAGGATGGTCGTGTTTTCGCCTGGGGCATGGGCACCAACTACCAGCTGGG  1184

Query 1134  CACAGGGCAGGATGAGGACGCCTGGAGCCCTGTGGAGATGATGGGCAAACAGCTGGAGAACCGTGTGGTCTTAT  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGGGCAGGATGAGGACGCCTGGAGCCCTGTGGAGATGATGGGCAAACAGCTGGAGAACCGTGTGGTCTTAT  1258

Query 1208  CTGTGTCCAGCGGGGGCCAGCATACAGTCTTATTAGTCAAGGACAAAGAACAGAGC  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGTGTCCAGCGGGGGCCAGCATACAGTCTTATTAGTCAAGGACAAAGAACAGAGC  1314