Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00300
- Subject:
- NM_133878.3
- Aligned Length:
- 1264
- Identities:
- 1128
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGTCACCCAAGCGCATAGCTAAAAGAAGGTCCCCCCCAGCAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAGGT 74
|||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGCCACCCAAGCGCATAGCTAAGAGAAGGTCACCCCCAGAAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAAGT 74
Query 75 CTCACACAGGTCCCACAGCACAGAACCCGGCTTGGTGCTGACACTAGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGC 148
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCACACAGGTCCCACAACACAGAACCAGGCTTGGTGCTGACACTGGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGC 148
Query 149 TGGGTGAGAATGTGATGGAGAGGAAGAAGCCGGCCCTGGTATCCATTCCGGAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCT 222
|||||||.|.||||.||||||||||||||||||||.||||..||.|||.|.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 TGGGTGAAAGTGTGCTGGAGAGGAAGAAGCCGGCCTTGGTGCCCCTTCTGCAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCC 222
Query 223 GGGGGCATGCACACCGTGTGTCTAAGCAAAAGTGGCCAGGTCTATTCCTTCGGCTGCAATGATGAGGGTGCCCT 296
|||||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GGGGGCATGCATACTGTGTGTCTGAGCCAAAGTGGCCAGGTCTACTCCTTTGGCTGCAATGACGAGGGTGCCCT 296
Query 297 GGGAAGGGACACATCAGTGGAGGGCTCGGAGATGGTCCCTGGGAAAGTGGAGCTGCAAGAGAAGGTGGTACAGG 370
||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 297 GGGAAGGGACACTTCAGTCGAAGGCTCAGAAATGGTCCCTGGGAAAGTGGAACTGCAAGAGAAAGTGGTGCAAG 370
Query 371 TGTCAGCAGGAGACAGTCACACAGCAGCCCTCACCGATGATGGCCGTGTCTTCCTCTGGGGCTCCTTCCGGGAC 444
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 371 TGTCAGCGGGGGACAGTCACACAGCAGCCCTCACCGAAGACGGCCGTGTCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCGGGAC 444
Query 445 AATAACGGTGTGATTGGACTGTTGGAGCCCATGAAGAAGAGCATGGTGCCTGTGCAGGTGCAGCTGGATGTGCC 518
|||||.||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|||
Sbjct 445 AATAATGGTGTGATCGGGTTGTTGGAGCCCATGAAGAAGAGCATGGTACCTGTTCAAGTGCAGCTGGATGCGCC 518
Query 519 TGTGGTAAAGGTGGCCTCAGGAAACGACCACTTGGTGATGCTGAC-AGCTGATGGTGACCTCTACACCTTGGGC 591
.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|| |.| |||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 519 CGTGGTAAAGGTGGCCTCGGGGAACGACCACTTGGTGATGCTCACGAAC-GATGGCGACCTCTACACCTTGGGT 591
Query 592 TGCGGGGAACAGGGCCAGCTAGGCCGTGTGCCTGAGTTATTTGCCAACCGTGGTGGCCGGCAAGGCCTCGAACG 665
||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|..||
Sbjct 592 TGTGGGGAGCAAGGTCAGCTGGGCCGTGTACCTGAATTATTTGCCAACCGAGGTGGCCGTCAGGGCCTTGGGCG 665
Query 666 ACTCCTGGTCCCCAAGTGTGTGATGCTGAAATCCAGGGGAAGCCGGGGCCACGTGAGATTCCAGGATGCCTTTT 739
||||||||||||||..||||||.||||||||||||||||.|.||||||||..|||.|.||||||||||||||.|
Sbjct 666 ACTCCTGGTCCCCAGATGTGTGCTGCTGAAATCCAGGGGGACCCGGGGCCGTGTGCGGTTCCAGGATGCCTTCT 739
Query 740 GTGGTGCCTATTTCACCTTTGCCATCTCCCATGAGGGCCACGTGTACGGCTTCGGCCTCTCCAACTACCATCAG 813
||||.|||||||||||.|||||||||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 740 GTGGCGCCTATTTCACTTTTGCCATCTCCCGAGAGGGCCACGTGTATGGCTTTGGCCTCTCCAACTATCACCAG 813
Query 814 CTTGGAACTCCGGGCACAGAATCTTGCTTCATACCCCAGAACCTAACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTG 887
||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CTCGGGACTCCAGGCACTGGATCTTGCTTCATTCCTCAAAACTTGACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTG 887
Query 888 GGTGGGCTTCTCTGGTGGCCAGCACCATACAGTCTGCATGGATTCGGAAGGAAAAGCATACAGCCTGGGCCGGG 961
|||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 888 GGTAGGCTTCTCCGGTGGCCAGCATCACACAGTCTGCATGGATTCGGAAGGGAAGGCGTACAGCCTGGGCCGGG 961
Query 962 CTGAGTATGGGCGGCTGGGCCTTGGAGAGGGTGCTGAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATCTCCAGGCTGCCT 1035
|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.
Sbjct 962 CTGAGTACGGGCGCCTGGGCCTTGGGGAGGGTGCTGAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATTTCCCGGCTGCCC 1035
Query 1036 GCTGTCTCCTCGGTGGCTTGTGGGGCCTCTGTGGGGTATGCTGTGACCAAGGATGGTCGTGTTTTCGCCTGGGG 1109
|..||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1036 GTGGTCTCCTCAGTGGCCTGTGGGGCTTCTGTGGGTTATGCTGTGTCCAAGGATGGTCGTGTTTTTGCCTGGGG 1109
Query 1110 CATGGGCACCAACTACCAGCTGGGCACAGGGCAGGATGAGGACGCCTGGAGCCCTGTGGAGATGATGGGCAAAC 1183
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||..|||||||
Sbjct 1110 CATGGGCACCAACTACCAGCTGGGCACCGGGCAGGATGAAGATGCCTGGAGTCCTGTGGAAATGACTGGCAAAC 1183
Query 1184 AGCTGGAGAACCGTGTGGTCTTATCTGTGTCCAGCGGGGGCCAGCATACAGTCTTATTAGTCAAGGACAAAGAA 1257
|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||||||.|.|.|
Sbjct 1184 AGCTGGAGAACCGTGTGGTGTTAACTGTGTCCAGTGGGGGCCAGCACACGGTCTTACTAGTTAAGGACCAGGCA 1257
Query 1258 CAGAGC 1263
||||||
Sbjct 1258 CAGAGC 1263