Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00302
- Subject:
- XM_017315205.1
- Aligned Length:
- 1467
- Identities:
- 1261
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGGTCCAGTCATGCCTCCCAGTAAGAAGCCAGAAAGCTCAGGAATTAGTGTCTCCAGTGGACTGAGTCAGTG 74
||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGGGTCCAGTCATGCCTGCCAGTAAGAAGGCCGAGAGCTCAGGAATCAGTGTGTCCAGTGGACTGAGTCAGCG 74
Query 75 TTACGGGGGCAGCGGTTTCTCCAAGGCCCTTCAGGAAGACGATGACCTCGACTTTTCTCTGCCTGACATCCGAT 148
||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||..|||||||.||||||||||
Sbjct 75 TTACCGGGGCAGCGGTTTCTCCAAGGCCCTCCAGGAAGACGATGATCTTGACTTCCCTCTGCCCGACATCCGAT 148
Query 149 TAGAAGAGGGGGCCATGGAAGATGAAGAGCTGACCAACCTGAACTGGCTGCACGAGAGCAAGAACTTGCTGAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAGAAGAGGGGGCCATGGAAGATGAAGAGCTGACCAACCTGAACTGGCTGCATGAGAGCAAGAACTTGCTGAAG 222
Query 223 AGCTTTGGGGAGTCGGTCCTCAGGAGTGTCAGCCCCGTCCAGGACCTGGACGATGACACCCCCCCATCCCCTGC 296
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 AGCTTTGGGGAGTCGGTCCTTAGGAGTGTCAGTCCTGTGCAGGACCTAGACGATGACACCCCACCATCCCCTGC 296
Query 297 CCACTCTGACATGCCCTACGATGCCAGGCAGAACCCCAACTGCAAACCCCCCTACTCCTTCAGCTGCCTCATAT 370
||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CCACTCGGACATGCCCTATGATGCCAGGCAGAACCCCAACTGCAAGCCCCCCTACTCCTTTAGCTGCCTCATAT 370
Query 371 TTATGGCCATCGAGGACTCTCCAACCAAGCGCCTGCCAGTGAAGGATATCTACAACTGGATCTTGGAACATTTT 444
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 TTATGGCCATCGAGGACTCTCCGACCAAGCGCCTTCCAGTGAAGGACATCTACAACTGGATCTTAGAACATTTC 444
Query 445 CCGTATTTTGCAAATGCACCTACTGGGTGGAAAAACTCAGTGAGACACAATTTATCATTGAATAAGTGTTTTAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 445 CCGTATTTTGCAAATGCACCTACTGGGTGGAAGAACTCAGTGAGACACAACTTGTCATTGAATAAGTGTTTCAA 518
Query 519 GAAAGTGGACAAAGAGAGGAGTCAGAGTATTGGGAAAGGGTCGTTGTGGTGCATAGACCCAGAGTATAGACAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAGTGGACAAAGAGAGGAGTCAGAGTATTGGGAAAGGGTCATTGTGGTGCATCGACCCAGAGTATAGACAAA 592
Query 593 ATCTAATTCAGGCTTTGAAAAAGACACCTTATCACCCACACCCACACGTGTTCAATACACCTCCCACCTGTCCT 666
||||||||||||||.||||||||||||||||.|||| |||||||.|| ||||
Sbjct 593 ATCTAATTCAGGCTCTGAAAAAGACACCTTACCACC---------------------CACCTCCTAC---TCCT 642
Query 667 CAGGCATATCAAAGCACATCAGGTCCACCCATCTGGCCGGGCAGTACCTTCTTCAAGAGAAATGGAGCCCTTCT 740
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 643 CAGGCTTATCAAAGCACATCAGGTCCACCCATCTGGCCGGGCAGTACCTTCTTCAAGAGAAACGGAGCCCTCCT 716
Query 741 CCA---------------------------------------------------------------AGTTCCTC 751
.|| ||||.|||
Sbjct 717 GCAAGATCCTGACATTGATGCTGCCAGTGCCATGATGCTTTTGAATTCTCCCCCTGAGATACAAGCAGTTTCTC 790
Query 752 CAGGAGTGATCCAAAATGGAGCGCGGGTCCTGAGCCGAGGGCTGTTTCCTGGCGTGCGGCCGCTGCCAATCACT 825
||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|.|||||||||
Sbjct 791 CAGGAGTGATACAAAATGGAGCGAGGGTTCTGAGTCGAGGGCTGTTTCCTGGTGTCCGGCCGTTACCAATCACT 864
Query 826 CCCATTGGGGTGACAGCGGCCATGAGGAATGGCATCACCAGCTGCCGGATGCGGACTGAGAGTGAGCCATCTTG 899
|||||||||.||||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||..|.||
Sbjct 865 CCCATTGGGATGACGGCAGCCATAAGGAATAGCATCACCAGTTGCAGGATGCGGACTGAGAGCGAGCCCCCATG 938
Query 900 TGGCTCCCCAGTGGTCAGCGGAGACCCCAAGGAGGATCACAACTACAGCAGTGCCAAGTCCTCCAACGCCCGGA 973
||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 939 TGGCTCCCCAGTGGTCAGTGGCGATCCGAAGGAGGACCACAACTACAGTAGTGCCAAGTCCTCCACTGCCCGGA 1012
Query 974 GCACCTCGCCCACCAGCGACTCCATCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCCGACGACCACTATGAGTTTGCCACCAAG 1047
|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1013 GCACCTCTCCCACCAGCGACTCCATCTCCTCTTCCTCCTCCTCAGCCGACGACCACTATGAGTTTGCTACGAAG 1086
Query 1048 GGGAGCCAGGAGGGCAGCGAGGGCAGCGAGGGGAGCTTCCGGAGCCACGAGAGCCCCAGCGACACGGAAGAGGA 1121
||||||||| ||||||||.|||||.|||||||.||||||.|||||||.|||.||..|.||.|||||
Sbjct 1087 GGGAGCCAG---------GAGGGCAGTGAGGGAAGCTTCCAGAGCCATGAGAGCCACAGTGAACCAGAGGAGGA 1151
Query 1122 CGACAGGAAGCACAGCCAGAAGGAGCCCAAGGATTCTCTGGGGGACAGCGGGTACGCATCCCAGCACAAGAAGC 1195
.|||.||||.|.|||||.||||||...|||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 GGACCGGAAACCCAGCCCGAAGGAAGGCAAGGATGCCCTGGGGGACAGCGGATACGCATCCCAGCACAAGAAGC 1225
Query 1196 GCCAGCACTTCGCCAAGGCCAGGAAGGTCCCCAGCGACACACTGCCCCTCAAAAAGAGACGCACCGAAAAGCCC 1269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1226 GCCAGCACTTCGCCAAGGCCAGGAAGGTCCCCAGCGACACACTGCCCCTCAAAAAGAGACGCACGGAGAAGCCG 1299
Query 1270 CCCGAGAGCGATGATGAGGAGATGAAAGAAGCGGCAGGGTCCCTCCTGCACTTAGCAGGGATCCGGTCCTGTTT 1343
||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1300 CCCGAGAGCGATGACGAGGAGATGAAGGAGGCGGCCGGTTCACTCCTGCACTTAGCAGGGATTCGGTCCTGTTT 1373
Query 1344 GAATAACATCACCAATCGGACGGCAAAGGGGCAGAAAGAGCAAAAGGAAACCACAAAAAAT 1404
|||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1374 GAACAACATCACCAATCGGACGGCCAAGGGGCAGAAAGAACAAAAGGAAACCGCAAAAAAT 1434