Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00303
- Subject:
- NM_001166603.1
- Aligned Length:
- 1378
- Identities:
- 1113
- Gaps:
- 176
Alignment
Query 1 ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACA 74
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1 ATGGCTCTGACCCTGTTCGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATACCAGCTGCAGCA 74
Query 75 GGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGT 148
||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAAGCCCCTCACCCTCGAAGGGTCACCTGCACTTGTGAGGTAGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGT 148
Query 149 TTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAG-CCGACCAGCTCTTGATTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGA 221
.|||||||||||||||.||||||| || |.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 149 ATCATGGCATGATCTCTAGAGAAG-AGACTGACCAGCTCCTGAGTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGTGA 221
Query 222 GAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAAGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACT 295
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 222 GAGCCAGCGGCAGCCAGGAACGTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAAGTCAGACCAGAAACTTCAGGCTGTACT 295
Query 296 ACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACT 369
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ACGATGGAAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACT 369
Query 370 CTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGATAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATA 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 370 CTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGATAAACCCAATTTATGAGCACATAGGATA 443
Query 444 CACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCCAGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATT 517
|||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..
Sbjct 444 CACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAACAGCACATGGCAGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAAAGAGG 517
Query 518 CTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAG 591
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 518 CTACAGGCCAGGATGGGGTATCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAATGAA 591
Query 592 CAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATTCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTG 665
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 CAAATTCCAAAATATGAAAAGGTTCACAATTTCAAGGTGCATACGTTCCGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTG 665
Query 666 TGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGT 739
|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 TGCCAACTTCATGTGGGGCCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGC----------------------------- 710
Query 740 GTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTCAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACG 813
Sbjct 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Query 814 ACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGG 887
|||
Sbjct 711 -----------------------------------------------------------------------AGG 713
Query 888 TCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACA 961
||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 714 TCTTAATTCTGAAGGACTCTACCGAGTGTCAGGATTTAGTGACCTGATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTTGATA 787
Query 962 GAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTG 1035
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 GAGATGGTGAGAAGGCGGATATTTCTGTGAACATGTATGAGGACATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTG 861
Query 1036 TACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCCTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTAT 1109
||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 862 TACTTCAGGGATCTGCCAATTCCTCTCATCACATACGATGCCTACCCCAAGTTCATTGAGTCTGCCAAAATTAT 935
Query 1110 GGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTACTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCC 1183
|||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|...|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 936 GGACCCTGACGAGCAATTGGAGACCCTTCACGAAGCACTGAGATCGCTGCCGCCTGCCCACTGCGAGACGCTCC 1009
Query 1184 GGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAGAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGA 1257
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.
Sbjct 1010 GGTACCTCATGGCGCATCTCAAGAGAGTGACCCTTCATGAGAAGGAGAATCTGATGAGTGCAGAGAACCTTGGG 1083
Query 1258 ATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCATGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCA 1331
|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|||||||.||..||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1084 ATCGTGTTTGGACCAACCCTCATGAGATCCCCAGAGCTCGACCCCATGGCCGCCCTGAACGACATACGCTATCA 1157
Query 1332 GAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 GAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT 1203