Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00303
- Subject:
- NM_001206602.2
- Aligned Length:
- 1395
- Identities:
- 958
- Gaps:
- 411
Alignment
Query 1 ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTGATTGT--GGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGG 220
|||.|| ||||.||| .||||| || || ||||..|.|||
Sbjct 1 ---ATGCCA-----TCCAAAGA-------------GTCTTG---GTCAGG--GAGGAAAACTA----------- 37
Query 221 AGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAAGTCAAACCAGAAA----CTTCAG--- 287
|.|| .||.|||| |.||| ||.|||||.|| |.| |.||||
Sbjct 38 ATAG--GGCTGCAG---------TTCAC------------------AAATCAAAACA-AGAGGGCCGTCAGCAA 81
Query 288 GCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGA--GAAACGCTTTGAGTCCATCCA----CGATCTGGTGACTG 355
|.|.||.| |||.|| ||| ||| |||| ||||| ||.||.| |||| || ||| |||||
Sbjct 82 GATTTATT--GATAGC-AGC-CTT-----GGGAATGAAAC----TGGGTTC-TCCAAAGTCG-TCT-GTGAC-- 137
Query 356 A---TGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGATAAACCCAATT 426
| |||| |..||| |||||| .|.|||| |
Sbjct 138 AATCTGGC------AACCTC-----TGAAAC--------------TCTTTGC---------------------T 165
Query 427 TATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCCAGTCCTGAAAGAGAC 500
|||..|||
Sbjct 166 TATTCGCA------------------------------------------------------------------ 173
Query 501 ACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAA 574
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 ------------------------------------------------GTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAA 199
Query 575 CTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATTCAGAGGGCCA 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 CTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATTCAGAGGGCCA 273
Query 649 CACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGTTT 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 CACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGTTT 347
Query 723 GAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTCAAAAAGGTGT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 GAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTCAAAAAGGTGT 421
Query 797 ACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 ACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGG 495
Query 871 GAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAATTGAAGATGT 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 GAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAATTGAAGATGT 569
Query 945 CAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATCAACATTATCA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 CAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATCAACATTATCA 643
Query 1019 CTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCCTAAGTTTATA 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 CTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCCTAAGTTTATA 717
Query 1093 GAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTACTGCCACCTGC 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 GAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTACTGCCACCTGC 791
Query 1167 TCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAGAATCTTATGA 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 TCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAGAATCTTATGA 865
Query 1241 ATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCATGGCTGCATTG 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 ATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCATGGCTGCATTG 939
Query 1315 AATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT 1377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 AATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT 1002