Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00303
- Subject:
- NM_001371514.1
- Aligned Length:
- 1484
- Identities:
- 1321
- Gaps:
- 163
Alignment
Query 1 ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACT---------------- 58
Query 75 GGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGA-- 146
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 ----------------------------------------GTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAAT 92
Query 147 -------------------------------------------------------------------------- 146
Sbjct 93 GGAGTTTCGCTTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGTTCACTATAACCTCCACCTCCCGGG 166
Query 147 -------------------------------GTTTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTG 189
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 167 TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTTTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTG 240
Query 190 ATTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATT 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATT 314
Query 264 TGGAAGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCA 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 TGGAAGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCA 388
Query 338 TCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATG 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 TCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATG 462
Query 412 ACGATAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCC 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 463 ACGATAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCC 536
Query 486 AGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCAC 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 AGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCAC 610
Query 560 TTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCAT 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 TTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCAT 684
Query 634 ACATTCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATG 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 ACATTCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATG 758
Query 708 TGCAGATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGC 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 TGCAGATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGC 832
Query 782 ATGTCAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTA 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 ATGTCAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTA 906
Query 856 GACATGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGA 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 GACATGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGA 980
Query 930 CCTAATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAG 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 CCTAATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAG 1054
Query 1004 ATATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCC 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 ATATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCC 1128
Query 1078 TACCCTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAA 1151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 TACCCTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAA 1202
Query 1152 ACTACTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 ACTACTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAA 1276
Query 1226 AGGAGAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGAC 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 AGGAGAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGAC 1350
Query 1300 GCCATGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTT 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 GCCATGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTT 1424
Query 1374 ATTT 1377
||||
Sbjct 1425 ATTT 1428