Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00310
- Subject:
- XM_011242655.2
- Aligned Length:
- 1514
- Identities:
- 1196
- Gaps:
- 136
Alignment
Query 1 ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGCGCGGGAACTGCCGCGTGGCCAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT 148
|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------ATGGATGATCTCCTGAACAAAACCCGCTACAACAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT 58
Query 149 CCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCAGCGTGAATGAGCGAGAGCAGATC 222
||||.|||||||||||||||...|||.||||.||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 59 CCTCCCAGCTCATCTCCATCCGCCTGGAGCTATCACTGTCCCAGCTCATCAGTGTGAATGAGCGAGAACAGATC 132
Query 223 ATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTACGAGGG 296
||||||||||...|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 133 ATGACCACCAGCATCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGACTACCGCCTGGCCTGGAACAGCTCCTGCTATGAAGG 206
Query 297 TGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCGACGGGA 370
.||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||
Sbjct 207 GGTGAACATTCTGAGGATTCCTGCAAAGCGAGTCTGGTTGCCTGACATCGTGTTGTACAACAATGCCGATGGGA 280
Query 371 CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATC 444
||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 281 CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACGTGATCGTGCGTTCCAACGGCAGCATCCAGTGGCTGCCCCCTGCCATC 354
Query 445 TACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCCGCTC 518
||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 355 TACAAGAGTGCCTGCAAGATAGAGGTGAAGCACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAATTTCGCTC 428
Query 519 CTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCA 592
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|...|.||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct 429 CTGGACCTATGACCACACAGAGATTGACATGGTTCTTAAATCACCCACAGCCATCATGGATGACTTTACCCCCA 502
Query 593 GTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACGTG 666
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 503 GCGGTGAATGGGACATTGTGGCCCTCCCGGGTCGAAGGACAGTGAACCCACAGGACCCCAGCTATGTGGACGTG 576
Query 667 ACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCAC 740
||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||.|||
Sbjct 577 ACCTATGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCACTCTTCTACACCATCAATCTGATCATCCCTTGTGTGCTCATCAC 650
Query 741 CTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC 814
.|.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 651 GTCGCTGGCTATCCTGGTCTTCTACCTGCCCTCCGACTGTGGGGAGAAGATGACGCTCTGCATCTCAGTGCTGC 724
Query 815 TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGC 888
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||||.|||
Sbjct 725 TGGCACTCACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCTCCCACCTCCCTTGACATTCCCCTCATTGGC 798
Query 889 AAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCA 962
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 799 AAGTACCTCTTGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTTTCCATCGTCACCACTGTGTGTGTCCTCAATGTGCACCA 872
Query 963 CCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCTTCCTCT 1036
|||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||...||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 873 CCGTTCACCCAGCACTCACACCATGGCATCCTGGGTCAAGGAGTGCTTCCTGCACAAGCTGCCCACCTTCCTCT 946
Query 1037 TCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAG-CAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGC---CCAGCAAGTCATG--CGTGACC 1104
||||||||||||||||.|..|| || ||||||.|||||.| ||||.| |||||.|| .|| |.|||||
Sbjct 947 TCATGAAGCGCCCTGGTCTGGA-AGTCAGCCCCGCCAGGG---TCCCTCATTCCAGCCAG--CTGCACTTGACC 1014
Query 1105 A-AGCCCGAGGCCACCGCCACCT------------CCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTACT 1165
| || |.||.||.||..|||||| |||.||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1015 ACAG-CTGAAGCTACGTCCACCTCTGCCTTAGGCCCCAGCAGCCCATCCAACCTCTATGGGAATTCCATGTACT 1087
Query 1166 TTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCT-CTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTG 1238
||||||||||.|.|.||||..||.|.||||||.|||.|.||| |.||.|.|..||| .|||||||||||..|.|
Sbjct 1088 TTGTGAACCCTGTCCCTGCCACTCCTAAGTCTGCAGTCAGCTCCCACACGGCAGGC-CTCCCCAGGGATGCCCG 1160
Query 1239 GCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACA 1312
||||.|||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||..
Sbjct 1161 GCTGAGGTCCTCTGGGAGGTTCCGGCAAGATCTACAGGAAGCATTAGAGGGCGTCAGCTTCATCGCACAGCATT 1234
Query 1313 TGAAGAATGACGATGAAGACCAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTC 1386
||.|||.|||.|||..|||.|||||||||.|.|||||||||||.|.|||.||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1235 TGGAGAGTGATGATCGAGATCAGAGTGTCATCGAGGACTGGAAATTCGTCGCAATGGTCGTCGACCGCCTGTTC 1308
Query 1387 CTGTGGGTGTTCATGTTTGTGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCATGC 1460
||||||||||||.||.|||||||..|.||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||||.|||.||
Sbjct 1309 CTGTGGGTGTTCGTGATTGTGTGTATTCTGGGCACCATGGGGCTCTTCCTGCCACCCCTCTTCCAGATCCACGC 1382
Query 1461 AGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC 1494
|.|.||..||||.|.|
Sbjct 1383 ACCCTCCAAGGGCCTC------------------ 1398