Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00310
- Subject:
- XM_017021887.1
- Aligned Length:
- 1498
- Identities:
- 1374
- Gaps:
- 113
Alignment
Query 1 ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGCGCGGGAACTGCCGCGTGGCCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGCGCGGGAACTGCCGCGTGGCCAA 74
Query 75 TGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT 148
Query 149 CCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCAGCGTGAATGAGCGAGAGCAGATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCAGCGTGAATGAGCGAGAGCAGATC 222
Query 223 ATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTACGAGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTACGAGGG 296
Query 297 TGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCGACGGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCGACGGGA 370
Query 371 CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATC 444
Query 445 TACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCCGCTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCCGCTC 518
Query 519 CTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCA 592
Query 593 GTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACGTG 666
Query 667 ACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCAC 740
Query 741 CTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC 814
Query 815 TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGC 888
Query 889 AAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCA 962
Query 963 CCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCTTCCTCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCTTCCTCT 1036
Query 1037 TCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCAGCAAGTCATGCGTGACCAAGCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCAGCAAGTCATGCGTGACCAAGCCC 1110
Query 1111 GAGGCCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTACTTTGTGAACCCCGCCTCTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGGCCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTACTTTGTGAACCCCGCCTCTGC 1184
Query 1185 AGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGT 1258
Query 1259 TCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACATGAAGAATGACGATGAAGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACATGAAGAATGACGATGAAGAC 1332
Query 1333 CAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAG--TACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTCCTGTGGGTGTTCA--TGT 1402
|||||||| |..|..|||| .|| ||.|.|.||| |||| .|||||| || ||.
Sbjct 1333 CAGAGTGT------GTCCCAGAAGCAAAC---GCCAAGATGG-GGAC-----------TTGGGTG--CAGGTGG 1383
Query 1403 TTGTGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCATGCAGCTTCTGAGGGGCCC 1476
|| |.||
Sbjct 1384 TT-------TACT------------------------------------------------------------- 1389
Query 1477 TACGCTGCCCAGCGTGAC 1494
Sbjct 1390 ------------------ 1389