Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00314
- Subject:
- NM_001321928.1
- Aligned Length:
- 1344
- Identities:
- 1249
- Gaps:
- 93
Alignment
Query 1 ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC 74
Query 75 TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCTGTATCCCCCG- 147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCTGTATCCCCCGA 148
Query 148 -------------------------------------------------------------------------- 147
Sbjct 149 GCCAGACATGGCCAACTGGACAGCTCCCAGGTAACTGCACTAGGTCTAGGCGTCTGTGCCCTCCCTCCATGGTT 222
Query 148 ------------------AGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGAC 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGGGTACCCCCTCCCCAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGAC 296
Query 204 CCCAGCAGTCTATGCACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTG 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCAGCAGTCTATGCACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTG 370
Query 278 GCGTGGACAACCCTGGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCGTGGACAACCCTGGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTA 444
Query 352 TTTGCTGACCTGTTTGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCAC 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGCTGACCTGTTTGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCAC 518
Query 426 GGATCTAGATGCCAGTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGATCTAGATGCCAGTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTG 592
Query 500 GCCGAAGCATCCGAGGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTG 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCGAAGCATCCGAGGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTG 666
Query 574 GTGGATGCACTGAGTGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGA 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGGATGCACTGAGTGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGA 740
Query 648 ACAGCAGCAGCTTATTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGG 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGCAGCAGCTTATTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGG 814
Query 722 CTCGAGACTGGCCAGATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAG 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCGAGACTGGCCAGATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAG 888
Query 796 GATCATACACGGGTGATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCT 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATCATACACGGGTGATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCT 962
Query 870 CAAAGAGGTGGAGAGACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAAGAGGTGGAGAGACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGA 1036
Query 944 CCTGTCCATCTAACCTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGC 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCTGTCCATCTAACCTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGC 1110
Query 1018 CGCTTCCCAAAGATCCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGG 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 CGCTTCCCAAAGATCCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAGCGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCCACAGG 1184
Query 1092 CGGTGTCTTTGATATTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGGTGTCTTTGATATTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATG 1258
Query 1166 GAGTAAACTATTTGATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATC 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGTAAACTATTTGATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATC 1332
Query 1240 CACACCAAGCAT 1251
||||||||||||
Sbjct 1333 CACACCAAGCAT 1344