Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00314
- Subject:
- NM_001321929.1
- Aligned Length:
- 1251
- Identities:
- 772
- Gaps:
- 477
Alignment
Query 1 ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCTGTATCCCCCGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATGCACGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCTGGCCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTTTGACC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCAGTAAA 444
|||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGCCAGTAAA 11
Query 445 ATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGAGGACT 518
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 --------------------------------------------AGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGAGGACT 41
Query 519 CAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAGTGGCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAGTGGCC 115
Query 593 TGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTATTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 TGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTATTGAT 189
Query 667 GACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCAGATGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 GACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCAGATGC 263
Query 741 TCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGTGATCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGTGATCT 337
Query 815 CCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGAGACTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 CCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGAGACTT 411
Query 889 ATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAACCTGGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 ATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAACCTGGG 485
Query 963 CACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGATCCTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 CACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGATCCTGG 559
Query 1037 AGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGGCGGTGTCTTTGATATTTCT 1110
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 AGAACCTAAGACTCCAAAAGCGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCCACAGGCGGTGTCTTTGATATTTCT 633
Query 1111 AATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTGATTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 AATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTGATTGA 707
Query 1185 TTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT 1251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 TTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT 774