Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00314
• Subject: XM_011521198.1
• Aligned Length: 1256
• Identities: 1117
• Gaps: 133

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCT--GTATCC---  143
                                                                  |.||...||  |||.||   
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGGTTACTGGGTACCCCCT  20

Query  144  CCCGAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATG  217
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   21  CCCCAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGACCCCAGCAGTCTATG  94

Query  218  CACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCT  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  CACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTGGCGTGGACAACCCT  168

Query  292  GGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  GGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTATTTGCTGACCTGTT  242

Query  366  TGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCA  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  TGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCACGGATCTAGATGCCA  316

Query  440  GTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGA  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  GTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTGGCCGAAGCATCCGA  390

Query  514  GGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAG  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  GGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTGGTGGATGCACTGAG  464

Query  588  TGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTA  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  TGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGAACAGCAGCAGCTTA  538

Query  662  TTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCA  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  TTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGGCTCGAGACTGGCCA  612

Query  736  GATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGT  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  GATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAGGATCATACACGGGT  686

Query  810  GATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGA  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  GATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCTCAAAGAGGTGGAGA  760

Query  884  GACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAAC  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  GACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGACCTGTCCATCTAAC  834

Query  958  CTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGAT  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  CTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGCCGCTTCCCAAAGAT  908

Query 1032  CCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGGCGGTGTCTTTGATA  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  CCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGGCGGTGTCTTTGATA  982

Query 1106  TTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTG  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  TTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATGGAGTAAACTATTTG  1056

Query 1180  ATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  ATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATCCACACCAAGCAT  1128