Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00322
• Subject: XM_006527562.3
• Aligned Length: 2484
• Identities: 2050
• Gaps: 246

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCATGTGGCAGGGGAGCTCGGAGTGGAACCCAGGACCTTACATGTTAGGAGCCATGGATAACAGAGGCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCATCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTGATGAAGACTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGACTTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGAGAAATAGAAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGT  222

Query    1  ------------------------ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTT  50
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAATAGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTT  296

Query   51  CAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAG  124
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAACACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAG  370

Query  125  AGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTT  198
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTT  444

Query  199  TTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCAC  272
            |||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  TTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCACTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTAC  518

Query  273  AGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAAT  346
            ||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||
Sbjct  519  AGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAAT  592

Query  347  GTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTAT  420
            ||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  GTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACAGATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTAC  666

Query  421  TTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGC  494
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  667  TTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGC  740

Query  495  CTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGA  568
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct  741  CTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTGGTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGA  814

Query  569  CTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTA  642
            |.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  815  CCCTTGTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTG  888

Query  643  GTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCG  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTGCTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCG  962

Query  717  CAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTAT  790
            .|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTAT  1036

Query  791  TCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCA  864
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||
Sbjct 1037  TCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACACTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCA  1110

Query  865  GCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCC  938
            ||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GCGTTCACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCC  1184

Query  939  ATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCC  1012
            .||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  GTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCATATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCC  1258

Query 1013  GCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTC  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.
Sbjct 1259  GCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAGTTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATT  1332

Query 1087  GTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGA  1160
            |||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGACGGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATATACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGA  1406

Query 1161  GCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAG  1234
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAG  1480

Query 1235  GGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATA  1308
            |.|||||.||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1481  GCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATA  1554

Query 1309  CTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGT  1382
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  CTGAAAATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGT  1628

Query 1383  TGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCT  1456
            .||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||..|.|||
Sbjct 1629  CGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCT  1702

Query 1457  TCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGC  1530
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  TCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCTGGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGC  1776

Query 1531  TTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACAT  1604
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||
Sbjct 1777  TTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATAT  1850

Query 1605  CGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATG  1678
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1851  TGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATG  1924

Query 1679  CCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGAT  1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  CCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGAT  1998

Query 1753  GTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGA  1826
            ||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1999  GTGATGAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGA  2072

Query 1827  GACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCT  1900
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2073  GACCATAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCT  2146

Query 1901  TTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCC  1974
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2147  TTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCC  2220

Query 1975  ATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCT  2048
            |||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCATTTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATACACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCT  2294

Query 2049  CGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGAC  2122
            .||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 2295  GGACCTCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGGAGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCC  2368

Query 2123  TGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATA  2196
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGCGCCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGAATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATA  2442

Query 2197  GCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAAC  2238
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCACAGATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAAC  2484