Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00322
• Subject: XM_011247444.2
• Aligned Length: 2553
• Identities: 2050
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCATGTGGCAGGGAATGAACTCAGGGAGACAGGCTTGGCCGCTGGACCATTTACCCACTGACTCATCTCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCAGCTCCCAGGGAGCTCGGAGTGGAACCCAGGACCTTACATGTTAGGAGCCATGGATAACAGAGGCTTTCATC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTGATGAAGACTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTATGGAC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGAGAAATAGAAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGTGGAAT  296

Query    1  -------------------ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATA  55
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  AGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACA  370

Query   56  CAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCA  129
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCA  444

Query  130  ACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATC  203
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  ACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATC  518

Query  204  AGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGG  277
            ||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  AGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCACTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGG  592

Query  278  GATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCA  351
            |.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  593  GGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCA  666

Query  352  GAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCAT  425
            |||||||||||.|||.|||||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACAGATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCAT  740

Query  426  GTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTG  499
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  GTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTG  814

Query  500  GCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTG  573
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct  815  GTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTGGTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTT  888

Query  574  GTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCA  647
            ||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  889  GTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCA  962

Query  648  CGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAG  721
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  CGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTGCTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAG  1036

Query  722  AGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGC  795
            |||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGC  1110

Query  796  CTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATT  869
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 1111  CTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACACTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTT  1184

Query  870  CACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGC  943
            |||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  CACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGC  1258

Query  944  ATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACA  1017
            ||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCATATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACA  1332

Query 1018  AACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGAC  1091
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.|||||
Sbjct 1333  AACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAGTTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGAC  1406

Query 1092  AGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGT  1165
            .|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATATACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGT  1480

Query 1166  TTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGT  1239
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  TCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGT  1554

Query 1240  GAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAA  1313
            ||.||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAA  1628

Query 1314  AATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTG  1387
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1629  AATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTG  1702

Query 1388  CTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAAT  1461
            ||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||..|.||||||||
Sbjct 1703  CTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAAT  1776

Query 1462  AGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGG  1535
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  AGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCTGGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGG  1850

Query 1536  TGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGC  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||||
Sbjct 1851  TGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGC  1924

Query 1610  CTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCAC  1683
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  CTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCAC  1998

Query 1684  ATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGAT  1757
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGAT  2072

Query 1758  GAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCA  1831
            |||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2073  GAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCA  2146

Query 1832  TAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTC  1905
            |||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 2147  TAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTT  2220

Query 1906  CTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCAT  1979
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCAT  2294

Query 1980  TTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATC  2053
            ||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2295  TTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATACACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACC  2368

Query 2054  TCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGG  2127
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2369  TCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGGAGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGC  2442

Query 2128  CAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACA  2201
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGAATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACA  2516

Query 2202  GATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAAC  2238
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAAC  2553