Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00322
- Subject:
- XM_011247445.2
- Aligned Length:
- 2517
- Identities:
- 2050
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCATGTGGCAGGGAATGAACTCAGGGAGACAGGCTTGGCCGCTGGACCATTTACCCACTGACTCATCTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCAGCTCCCAGGAGCCATGGATAACAGAGGCTTTCATCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATGAAGACTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTATGGACTTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGA 222
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGACTTCTTGGAGGA 17
|||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAATAGAAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGTGGAATAGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGA 296
Query 18 GCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGG 91
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 297 GCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAG 370
Query 92 ATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTT 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 ATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTC 444
Query 166 TCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCA 239
||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCA 518
Query 240 TTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACT 313
.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 519 CTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATT 592
Query 314 CTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACA 387
||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||..|||
Sbjct 593 CTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACA 666
Query 388 GATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGC 461
|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 667 GATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGC 740
Query 462 CGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTG 535
.||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct 741 TGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTG 814
Query 536 GTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCG 609
|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.
Sbjct 815 GTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTTGTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCA 888
Query 610 TCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTG 683
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 889 TCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTG 962
Query 684 CTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTG 757
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 963 CTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTG 1036
Query 758 TAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACA 831
||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACA 1110
Query 832 TTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCG 905
.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1111 CTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTTCACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCG 1184
Query 906 CCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCA 979
|.|.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||
Sbjct 1185 CTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCA 1258
Query 980 TATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAG 1053
||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1259 TATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAG 1332
Query 1054 TTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATA 1127
|||||||||||||||||..|.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGACGGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATA 1406
Query 1128 CACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCT 1201
.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCT 1480
Query 1202 GTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTAC 1275
|||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 1481 GTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTAC 1554
Query 1276 AGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGAT 1349
|||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAAAATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGAT 1628
Query 1350 CCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAAC 1423
.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.|
Sbjct 1629 TCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGC 1702
Query 1424 AGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCC 1497
|.|||||||||||||||||.||.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1703 AACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCT 1776
Query 1498 GGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCAT 1571
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCAT 1850
Query 1572 AATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGG 1645
||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGG 1924
Query 1646 CAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAA 1719
|.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAA 1998
Query 1720 GAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCT 1793
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||
Sbjct 1999 GAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGATGAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCT 2072
Query 1794 TACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGG 1867
||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 2073 TACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCATAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGG 2146
Query 1868 TGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCT 1941
|.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCT 2220
Query 1942 CGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATA 2015
||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||
Sbjct 2221 CGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATA 2294
Query 2016 CACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGG 2089
|||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 2295 CACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACCTCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGG 2368
Query 2090 AGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGA 2163
|||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2369 AGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGCCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGA 2442
Query 2164 ATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAA 2237
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAA 2516
Query 2238 C 2238
|
Sbjct 2517 C 2517