Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00328
• Subject: XM_006510739.3
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1363
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC  74
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGTTCCCCAGAGCCAGACCCATACCTGAGCTACCGCTGGAAGAGGAGGCGGTC  74

Query   75  CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA  148
            .|||||||||||.||||||||..||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  TTACAGTCGGGAGCATGAAGGTCGACTACGATACCCATCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGGAGATCACGGTCCA  148

Query  149  GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG  222
            ||||||||||.||..|.|||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  GAAGCCATGATCGTATACCCTACCAGCGGAGGTACCGGGAACACCGTGACAGTGATACGTATCGGTGTGAAGAG  222

Query  223  CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG  296
            |||||||||||.|||||||||||||.||||||..|||||||||||||.|||||..|.||.||.||.|||||||.
Sbjct  223  CGGAGCCCATCTTTTGGAGAGGACTGCTATGGGTCTTCACGTTCTCGACATCGGAGACGGTCACGAGAGAGGGC  296

Query  297  GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GCCGTACCGTACCCGCAAGCATGCCCACCACTGTCACAAACGCCGTACCAGGTCTTGTAGCAGTGCTTCCTCGA  370

Query  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGCCACCTGGTGTGCCGGATC  444

Query  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATTGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATCGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG  518

Query  519  CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCACAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGTAATGTGGGCAAGTATCGGGAAGCTG  592

Query  593  CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG  666
            |.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct  593  CTCGTCTAGAAATTAATGTTCTCAAGAAAATCAAGGAGAAAGACAAGGAAAATAAGTTCCTTTGTGTCCTGATG  666

Query  667  TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  740
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGACTGGTTCAACTTCCATGGTCATATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  740

Query  741  GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA  814
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  GAAGGAGAACAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGTCATGCCCTTA  814

Query  815  GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  888
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTTCTACACGAGAACCAGCTGACCCACACAGACTTGAAGCCAGAGAACATCTTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  888

Query  889  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGCGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCAGACTT  962

Query  963  TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA  1036
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  TGGCAGTGCCACGTTTGACCATGAACATCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTACCGCCCACCTGAGGTGA  1036

Query 1037  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGATGTCTGGAGTATCGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGTGGC  1110

Query 1111  TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC  1184
            ||.|||||||||||||||||.|||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111  TTTACACTCTTCCAGACCCATGAAAATAGAGAACACTTGGTTATGATGGAGAAGATTCTAGGACCCATCCCATC  1184

Query 1185  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTGGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1258

Query 1259  ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG  1332
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  ATGGGCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTGCAGGACTCCCTGGAGCATGTGCAG  1332

Query 1333  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||.||.|||.|||||||
Sbjct 1333  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAGTTCGACCCTGCTCAGCGCATCACATTGGCAGAAGCCTTGCTGCA  1406

Query 1407  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGA  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||
Sbjct 1407  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACAGCAGCCGTAACCCCAGCAGA  1470