Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00344
• Subject: NM_016685.2
• Aligned Length: 2282
• Identities: 1929
• Gaps: 28

Alignment

Query    1  ATGGTCCCCGACACCGCCTGCGTTCTTCTGCTCACCCTGGCTGCCCT-CGGCGCGTCCGGACAGGGCCAGAGCC  73
            ||||.|||   |||.|||||||||||..|||||.||||||||..||| ||| |||.|.||.||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGCCC---CACTGCCTGCGTTCTAGTGCTCGCCCTGGCTATCCTGCGG-GCGACAGGCCAGGGCCAGATCC  70

Query   74  CGTTGGGCTCAGACCTGGGCCCGCAGATGCTTCGGGAACTGCAGGAAACCAACGCGGCGCTGCAGGACGTGCGG  147
            ||.||||...||||||||.|||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.
Sbjct   71  CGCTGGGTGGAGACCTGGCCCCACAGATGCTGCGAGAACTTCAGGAGACTAATGCGGCGCTGCAAGACGTGAGA  144

Query  148  GAGCTGCTGCGGCAGCAGGTCAGGGAGATCACGTTCCTGAAAAACACGGTGATGGAGTGTGACGCGTGCGGGAT  221
            ||||||.||||.||||||||||.|||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  145  GAGCTGTTGCGACAGCAGGTCAAGGAGATCACCTTCCTGAAGAATACGGTGATGGAATGTGATGCTTGCGGAAT  218

Query  222  GCAGCAGTCAGTACGCA---CCGGCCTACCCAGCGTGCGGCCCCTGCTCCACTGCGCGCCCGGCTTCTGCTTCC  292
            |||||   |.|.|||||   |.|||||   .|||||||||||..|||..|.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  219  GCAGC---CCGCACGCACTCCAGGCCT---GAGCGTGCGGCCAGTGCCGCTCTGCGCACCCGGCTCCTGCTTCC  286

Query  293  CCGGCGTGGCCTGCATCC-AGACGGAGAGC----GGCGCGCGCTGCGGCCCCTGCCCCGCGGGCTTCACGGGCA  361
            |||||||.|.|||| ||| ||||    |||    |||||||||||||||||||||||..|.||||.|||.||||
Sbjct  287  CCGGCGTAGTCTGC-TCCGAGAC----AGCTACGGGCGCGCGCTGCGGCCCCTGCCCTCCTGGCTACACCGGCA  355

Query  362  ACGGCTCGCACTGCACCGACGTCAACGAGTGCAACGCCCACCCCTGCTTCCCCCGAGTCCGCTGTATCAACACC  435
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  356  ACGGCTCGCACTGCACCGACGTTAATGAGTGCAATGCTCACCCCTGTTTCCCGCGGGTGCGGTGCATCAATACC  429

Query  436  AGCCCGGGGTTCCGCTGCGAGGCTTGCCCGCCGGGGTACAGCGGCCCCACCCACCAGGGCGTGGGGCTGGCTTT  509
            |||||.||.||.|.||||||.||.||.||.||.||||.||||||.|||||||||.||||||||||.|||.|.||
Sbjct  430  AGCCCTGGCTTTCACTGCGAAGCCTGTCCCCCTGGGTTCAGCGGACCCACCCACGAGGGCGTGGGACTGACCTT  503

Query  510  CGCCAAGGCCAACAAGCAGGTTTGCACGGACATCAACGAGTGTGAGACCGGGCAACATAACTGCGTCCCCAACT  583
            |||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct  504  CGCTAAGTCCAACAAACAAGTTTGCACGGATATTAATGAGTGTGAGACCGGGCAGCACAATTGCGTTCCCAACT  577

Query  584  CCGTGTGCATCAACACCCGGGGCTCCTTCCAGTGCGGCCCGTGCCAGCCCGGCTTCGTGGGCGACCAGGCGTCC  657
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.
Sbjct  578  CCGTGTGCGTCAACACCCGGGGCTCCTTCCAGTGCGGCCCCTGCCAGCCCGGTTTCGTGGGCGACCAGACGTCA  651

Query  658  GGCTGCCAGCGGCGCGCACAGCGCTTCTGCCCCGACGGCTCGCCCAGCGAGTGCCACGAGCATGCAGACTGCGT  731
            ||||||||||||||.|..||||.||||||||||||.||.||.||||||..||||||.|||.|.|||.|||||||
Sbjct  652  GGCTGCCAGCGGCGTGGGCAGCACTTCTGCCCCGATGGGTCACCCAGCCCGTGCCATGAGAAAGCAAACTGCGT  725

Query  732  CCTAGAGCGCGATGGCTCGCGGTCGTGCGTGTGTGCCGTTGGCTGGGCCGGCAACGGGATCCTCTGTGGTCGCG  805
            |||.|||||.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||
Sbjct  726  CCTGGAGCGGGATGGCTCGAGGTCTTGCGTGTGTGCAGTTGGCTGGGCCGGCAACGGGCTCCTGTGCGGCCGCG  799

Query  806  ACACTGACCTAGACGGCTTCCCGGACGAGAAGCTGCGCTGCCCGGAGCGCCAGTGCCGTAAGGACAACTGCGTG  879
            ||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  800  ACACGGACCTGGACGGTTTTCCTGACGAGAAGCTTCGCTGCTCAGAGCGCCAGTGTCGCAAGGACAACTGCGTG  873

Query  880  ACTGTGCCCAACTCAGGGCAGGAGGATGTGGACCGCGATGGCATCGGAGACGCCTGCGATCCGGATGCCGACGG  953
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct  874  ACGGTGCCCAATTCGGGGCAGGAGGATGTGGACCGGGACGGCATCGGAGATGCTTGTGACCCGGATGCGGACGG  947

Query  954  GGACGGGGTCCCCAATGAAAAGGACAACTGCCCGCTGGTGCGGAACCCAGACCAGCGCAACACGGACGAG-GAC  1026
            |||.||.|||||.||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||| || ||.
Sbjct  948  GGATGGAGTCCCTAACGAGCAAGACAATTGCCCGCTGGTTCGAAACCCAGACCAGCGTAACTCGGAC-AGTGAT  1020

Query 1027  AAGTGGGGCGATGCGTGCGACAACTGCCGGTCCCAGAAGAACGACGACCAAAAGGACACAGACCAGGACGGCCG  1100
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||.|||||||.|||.|||||
Sbjct 1021  AAGTGGGGAGATGCCTGCGACAACTGCCGGTCCAAGAAGAATGACGATCAGAAAGATACAGACCTGGATGGCCG  1094

Query 1101  GGGCGATGCGTGCGACGACGACATCGACGGCGACCGGATCCGCAACCAGGCCGACAACTGCCCTAGGGTACCCA  1174
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||....||.||||||||.||..||||.||||
Sbjct 1095  GGGCGATGCCTGCGACGACGACATAGATGGCGACCGAATACGAAATGTAGCTGACAACTGTCCCCGGGTGCCCA  1168

Query 1175  ACTCAGACCAGAAGGACAGTGATGGCGATGGTATAGGGGATGCCTGTGACAACTGTCCCCAGAAGAG-CAACCC  1247
            |||..|||||||..|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||| || .|||||
Sbjct 1169  ACTTTGACCAGAGTGACAGTGATGGTGATGGTGTTGGGGATGCCTGTGACAACTGTCCCCAGAA-AGATAACCC  1241

Query 1248  GGATCAGGCGGATGTGGACCACGACTTTGTGGGAGATGCTTGTGACAGCGATCAAGACCAGGATGGAGACGGAC  1321
            .||.|||..||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1242  AGACCAGAGGGATGTGGACCACGACTTTGTGGGTGATGCCTGTGATAGTGACCAAGACCAGGATGGGGATGGTC  1315

Query 1322  ATCAGGACTCTCGGGACAACTGTCCCACGGTGCCTAACAGTGCCCAGGAGGACTCAGACCACGATGGCCAGGGT  1395
            |.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||.||||.
Sbjct 1316  ACCAGGACTCCCGGGACAACTGCCCCACAGTACCCAACAGTGCCCAGCAGGACTCAGATCATGATGGCAAGGGC  1389

Query 1396  GATGCCTGCGACGACGACGACGACAATGACGGAGTCCCTGACAGTCGGGACAACTGCCGCCTGGTGCCTAACCC  1469
            ||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1390  GATGCCTGTGATGACGATGATGACAATGACGGAGTTCCTGATAGCCGGGACAACTGCCGCTTGGTGCCTAACCC  1463

Query 1470  CGGCCAGGAGGACGCGGACAGGGACGGCGTGGGCGACGTGTGCCAGGACGACTTTGATGCAGACAAGGTGGTAG  1543
            .|||||.||||||...|||.||||.||||||||.||||.|||.||||..|||||.|||||.||||||||..|||
Sbjct 1464  TGGCCAAGAGGACAATGACCGGGATGGCGTGGGTGACGCGTGTCAGGGTGACTTCGATGCTGACAAGGTTATAG  1537

Query 1544  ACAAGATCGACGTGTGTCCGGAGAACGCTGAAGTCACGCTCACCGACTTCAGGGCCTTCCAGACAGTCGTGCTG  1617
            ||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct 1538  ACAAGATCGATGTGTGCCCCGAGAACGCCGAGGTCACCCTCACCGACTTCAGGGCCTTCCAGACGGTTGTGTTG  1611

Query 1618  GACCCGGAGGGTGACGCGCAGATTGACCCCAACTGGGTGGTGCTCAACCAGGGAAGGGAGATCGTGCAGACAAT  1691
            |||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.||
Sbjct 1612  GACCCCGAGGGTGATGCGCAGATCGATCCCAACTGGGTGGTGCTCAATCAGGGAATGGAGATCGTTCAGACCAT  1685

Query 1692  GAACAGCGACCCAGGCCTGGCTGTGGGTTACACTGCCTTCAATGGCGTGGACTTCGAGGGCACGTTCCATGTGA  1765
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1686  GAACAGTGACCCTGGCCTGGCTGTGGGTTACACAGCCTTCAACGGCGTGGACTTCGAGGGCACATTCCATGTAA  1759

Query 1766  ACACGGTCACGGATGACGACTATGCGGGCTTCATCTTTGGCTACCAGGACAGCTCCAGCTTCTACGTGGTCATG  1839
            ||||.|.|||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1760  ACACCGCCACTGATGATGACTATGCTGGTTTCATCTTCGGCTACCAAGACAGCTCCAGTTTCTACGTAGTCATG  1833

Query 1840  TGGAAGCAGATGGAGCAAACGTATTGGCAGGCGAACCCCTTCCGTGCTGTGGCCGAGCCTGGCATCCAACTCAA  1913
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1834  TGGAAACAGATGGAGCAGACGTACTGGCAGGCCAATCCCTTCCGGGCTGTGGCTGAGCCAGGGATTCAGCTCAA  1907

Query 1914  GGCTGTGAAGTCTTCCACAGGCCCCGGGGAACAGCTGCGGAACGCTCTGTGGCATACAGGAGACACAGAGTCCC  1987
            ||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||..||||
Sbjct 1908  GGCTGTCAAGTCCTCTACAGGTCCCGGGGAACAGCTCCGAAACGCACTGTGGCACACGGGGGACACAGCATCCC  1981

Query 1988  AGGTGCGGCTGCTGTGGAAGGACCCGCGAAACGTGGGTTGGAAGGACAAGAAGTCCTATCGTTGGTTCCTGCAG  2061
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1982  AGGTGCGGCTGCTGTGGAAGGATCCTCGAAACGTGGGCTGGAAGGATAAAACATCCTACCGCTGGTTCCTGCAG  2055

Query 2062  CACCGGCCCCAAGTGGGCTACATCAGGGTGCGATTCTATGAGGGCCCTGAGCTGGTGGCCGACAGCAACGTGGT  2135
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2056  CACCGGCCTCAAGTTGGCTACATCAGGGTGCGGTTCTATGAGGGTCCTGAGCTAGTAGCTGACAGCAATGTGGT  2129

Query 2136  CTTGGACACAACCATGCGGGGTGGCCGCCTGGGGGTCTTCTGCTTCTCCCAGGAGAACATCATCTGGGCCAACC  2209
            .||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2130  GTTGGACACGGCCATGCGTGGTGGCCGCCTGGGTGTCTTCTGCTTCTCCCAAGAGAACATCATCTGGGCTAACC  2203

Query 2210  TGCGTTACCGCTGCAATGACACCATCCCAGAGGACTATGAGACCCATCAGCTGCGGCAAGCC  2271
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||..||.|.|||||.|..||.|
Sbjct 2204  TGCGCTACCGTTGCAATGATACAATCCCTGAGGACTACGAGAGTCACCGGCTGCAGAGAGTC  2265