Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00344
- Subject:
- XM_006509539.1
- Aligned Length:
- 2274
- Identities:
- 1647
- Gaps:
- 345
Alignment
Query 1 ATGGTCCCCGACACCGCCTGCGTTCTTCTGCTCACCCTGGCTGCCCTCGGCGCGTCCGGACAGGGCCAGAGCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTGGGCTCAGACCTGGGCCCGCAGATGCTTCGGGAACTGCAGGAAACCAACGCGGCGCTGCAGGACGTGCGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGCTGCTGCGGCAGCAGGTCAGGGAGATCACGTTCCTGAAAAACACGGTGATGGAGTGTGACGCGTGCGGGATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGCAGTCAGTACGCACCGGCCTACCCAGCGTGCGGCCCCTGCTCCACTGCGCGCCCGGCTTCTGC-TTCCCCG 295
.|| ||.| ||||| |||
Sbjct 1 ---------------------------------------ATG-TCAA--------------TCTGCATTC---- 16
Query 296 GCGTGGCCTGCATCCAGACGGAGAGCGGCGCGCGCTGCGGCCCCTGCCCCGCGGGCTTCACGGGCAACGGCTCG 369
.||||||..|| |.||..|||.||
Sbjct 17 ------TCTGCATTGAG------------------TTCGAGCCCAGC--------------------------- 39
Query 370 CACTGCACCGACGTCAACGAGTGCAACGCCCACCCCTGCTTCCCCCGAGTCCGCTGTATCAACACCAGCCCGGG 443
||| ||..||..||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 40 --CTG-------GTATACATGTGCAATGCTCACCCCTGTTTCCCGCGGGTGCGGTGCATCAATACCAGCCCTGG 104
Query 444 GTTCCGCTGCGAGGCTTGCCCGCCGGGGTACAGCGGCCCCACCCACCAGGGCGTGGGGCTGGCTTTCGCCAAGG 517
.||.|.||||||.||.||.||.||.||||.||||||.|||||||||.||||||||||.|||.|.|||||.|||.
Sbjct 105 CTTTCACTGCGAAGCCTGTCCCCCTGGGTTCAGCGGACCCACCCACGAGGGCGTGGGACTGACCTTCGCTAAGT 178
Query 518 CCAACAAGCAGGTTTGCACGGACATCAACGAGTGTGAGACCGGGCAACATAACTGCGTCCCCAACTCCGTGTGC 591
|||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 179 CCAACAAACAAGTTTGCACGGATATTAATGAGTGTGAGACCGGGCAGCACAATTGCGTTCCCAACTCCGTGTGC 252
Query 592 ATCAACACCCGGGGCTCCTTCCAGTGCGGCCCGTGCCAGCCCGGCTTCGTGGGCGACCAGGCGTCCGGCTGCCA 665
.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct 253 GTCAACACCCGGGGCTCCTTCCAGTGCGGCCCCTGCCAGCCCGGTTTCGTGGGCGACCAGACGTCAGGCTGCCA 326
Query 666 GCGGCGCGCACAGCGCTTCTGCCCCGACGGCTCGCCCAGCGAGTGCCACGAGCATGCAGACTGCGTCCTAGAGC 739
||||||.|..||||.||||||||||||.||.||.||||||..||||||.|||.|.|||.||||||||||.||||
Sbjct 327 GCGGCGTGGGCAGCACTTCTGCCCCGATGGGTCACCCAGCCCGTGCCATGAGAAAGCAAACTGCGTCCTGGAGC 400
Query 740 GCGATGGCTCGCGGTCGTGCGTGTGTGCCGTTGGCTGGGCCGGCAACGGGATCCTCTGTGGTCGCGACACTGAC 813
|.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 401 GGGATGGCTCGAGGTCTTGCGTGTGTGCAGTTGGCTGGGCCGGCAACGGGCTCCTGTGCGGCCGCGACACGGAC 474
Query 814 CTAGACGGCTTCCCGGACGAGAAGCTGCGCTGCCCGGAGCGCCAGTGCCGTAAGGACAACTGCGTGACTGTGCC 887
||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 475 CTGGACGGTTTTCCTGACGAGAAGCTTCGCTGCTCAGAGCGCCAGTGTCGCAAGGACAACTGCGTGACGGTGCC 548
Query 888 CAACTCAGGGCAGGAGGATGTGGACCGCGATGGCATCGGAGACGCCTGCGATCCGGATGCCGACGGGGACGGGG 961
|||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 549 CAATTCGGGGCAGGAGGATGTGGACCGGGACGGCATCGGAGATGCTTGTGACCCGGATGCGGACGGGGATGGAG 622
Query 962 TCCCCAATGAAAAGGACAACTGCCCGCTGGTGCGGAACCCAGACCAGCGCAACACGGACGAG-GACAAGTGGGG 1034
||||.||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||| || ||.||||||||
Sbjct 623 TCCCTAACGAGCAAGACAATTGCCCGCTGGTTCGAAACCCAGACCAGCGTAACTCGGAC-AGTGATAAGTGGGG 695
Query 1035 CGATGCGTGCGACAACTGCCGGTCCCAGAAGAACGACGACCAAAAGGACACAGACCAGGACGGCCGGGGCGATG 1108
.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||.|||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 696 AGATGCCTGCGACAACTGCCGGTCCAAGAAGAATGACGATCAGAAAGATACAGACCTGGATGGCCGGGGCGATG 769
Query 1109 CGTGCGACGACGACATCGACGGCGACCGGATCCGCAACCAGGCCGACAACTGCCCTAGGGTACCCAACTCAGAC 1182
|.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||....||.||||||||.||..||||.|||||||..|||
Sbjct 770 CCTGCGACGACGACATAGATGGCGACCGAATACGAAATGTAGCTGACAACTGTCCCCGGGTGCCCAACTTTGAC 843
Query 1183 CAGAAGGACAGTGATGGCGATGGTATAGGGGATGCCTGTGACAACTGTCCCCAGAAGAG-CAACCCGGATCAGG 1255
||||..|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||| || .|||||.||.|||.
Sbjct 844 CAGAGTGACAGTGATGGTGATGGTGTTGGGGATGCCTGTGACAACTGTCCCCAGAA-AGATAACCCAGACCAGA 916
Query 1256 CGGATGTGGACCACGACTTTGTGGGAGATGCTTGTGACAGCGATCAAGACCAGGATGGAGACGGACATCAGGAC 1329
.||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 917 GGGATGTGGACCACGACTTTGTGGGTGATGCCTGTGATAGTGACCAAGACCAGGATGGGGATGGTCACCAGGAC 990
Query 1330 TCTCGGGACAACTGTCCCACGGTGCCTAACAGTGCCCAGGAGGACTCAGACCACGATGGCCAGGGTGATGCCTG 1403
||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||.||||.||||||||
Sbjct 991 TCCCGGGACAACTGCCCCACAGTACCCAACAGTGCCCAGCAGGACTCAGATCATGATGGCAAGGGCGATGCCTG 1064
Query 1404 CGACGACGACGACGACAATGACGGAGTCCCTGACAGTCGGGACAACTGCCGCCTGGTGCCTAACCCCGGCCAGG 1477
.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1065 TGATGACGATGATGACAATGACGGAGTTCCTGATAGCCGGGACAACTGCCGCTTGGTGCCTAACCCTGGCCAAG 1138
Query 1478 AGGACGCGGACAGGGACGGCGTGGGCGACGTGTGCCAGGACGACTTTGATGCAGACAAGGTGGTAGACAAGATC 1551
|||||...|||.||||.||||||||.||||.|||.||||..|||||.|||||.||||||||..|||||||||||
Sbjct 1139 AGGACAATGACCGGGATGGCGTGGGTGACGCGTGTCAGGGTGACTTCGATGCTGACAAGGTTATAGACAAGATC 1212
Query 1552 GACGTGTGTCCGGAGAACGCTGAAGTCACGCTCACCGACTTCAGGGCCTTCCAGACAGTCGTGCTGGACCCGGA 1625
||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||
Sbjct 1213 GATGTGTGCCCCGAGAACGCCGAGGTCACCCTCACCGACTTCAGGGCCTTCCAGACGGTTGTGTTGGACCCCGA 1286
Query 1626 GGGTGACGCGCAGATTGACCCCAACTGGGTGGTGCTCAACCAGGGAAGGGAGATCGTGCAGACAATGAACAGCG 1699
||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1287 GGGTGATGCGCAGATCGATCCCAACTGGGTGGTGCTCAATCAGGGAATGGAGATCGTTCAGACCATGAACAGTG 1360
Query 1700 ACCCAGGCCTGGCTGTGGGTTACACTGCCTTCAATGGCGTGGACTTCGAGGGCACGTTCCATGTGAACACGGTC 1773
||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|
Sbjct 1361 ACCCTGGCCTGGCTGTGGGTTACACAGCCTTCAACGGCGTGGACTTCGAGGGCACATTCCATGTAAACACCGCC 1434
Query 1774 ACGGATGACGACTATGCGGGCTTCATCTTTGGCTACCAGGACAGCTCCAGCTTCTACGTGGTCATGTGGAAGCA 1847
||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1435 ACTGATGATGACTATGCTGGTTTCATCTTCGGCTACCAAGACAGCTCCAGTTTCTACGTAGTCATGTGGAAACA 1508
Query 1848 GATGGAGCAAACGTATTGGCAGGCGAACCCCTTCCGTGCTGTGGCCGAGCCTGGCATCCAACTCAAGGCTGTGA 1921
|||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1509 GATGGAGCAGACGTACTGGCAGGCCAATCCCTTCCGGGCTGTGGCTGAGCCAGGGATTCAGCTCAAGGCTGTCA 1582
Query 1922 AGTCTTCCACAGGCCCCGGGGAACAGCTGCGGAACGCTCTGTGGCATACAGGAGACACAGAGTCCCAGGTGCGG 1995
||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||..||||||||||||
Sbjct 1583 AGTCCTCTACAGGTCCCGGGGAACAGCTCCGAAACGCACTGTGGCACACGGGGGACACAGCATCCCAGGTGCGG 1656
Query 1996 CTGCTGTGGAAGGACCCGCGAAACGTGGGTTGGAAGGACAAGAAGTCCTATCGTTGGTTCCTGCAGCACCGGCC 2069
||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1657 CTGCTGTGGAAGGATCCTCGAAACGTGGGCTGGAAGGATAAAACATCCTACCGCTGGTTCCTGCAGCACCGGCC 1730
Query 2070 CCAAGTGGGCTACATCAGGGTGCGATTCTATGAGGGCCCTGAGCTGGTGGCCGACAGCAACGTGGTCTTGGACA 2143
.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1731 TCAAGTTGGCTACATCAGGGTGCGGTTCTATGAGGGTCCTGAGCTAGTAGCTGACAGCAATGTGGTGTTGGACA 1804
Query 2144 CAACCATGCGGGGTGGCCGCCTGGGGGTCTTCTGCTTCTCCCAGGAGAACATCATCTGGGCCAACCTGCGTTAC 2217
|..|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1805 CGGCCATGCGTGGTGGCCGCCTGGGTGTCTTCTGCTTCTCCCAAGAGAACATCATCTGGGCTAACCTGCGCTAC 1878
Query 2218 CGCTGCAATGACACCATCCCAGAGGACTATGAGACCCATCAGCTGCGGCAAGCC 2271
||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||..||.|.|||||.|..||.|
Sbjct 1879 CGTTGCAATGATACAATCCCTGAGGACTACGAGAGTCACCGGCTGCAGAGAGTC 1932