Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00361
- Subject:
- NM_001256091.1
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1461
- Gaps:
- 54
Alignment
Query 1 ATGAAATTCAAGTTACATGTGAATTCTGCCAGGCAATACAAGGACCTGTGGAATATGAGTGATGACAAACCCTT 74
||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------ATGAGTGATGACAAACCCTT 20
Query 75 TCTATGTACTGCGCCTGGATGTGGCCAGCGTTTTACCAACGAGGATCATTTGGCTGTCCATAAACATAAACATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 TCTATGTACTGCGCCTGGATGTGGCCAGCGTTTTACCAACGAGGATCATTTGGCTGTCCATAAACATAAACATG 94
Query 149 AGATGACACTGAAATTTGGTCCAGCACGTAATGACAGTGTCATTGTGGCTGATCAGACCCCAACACCAACAAGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 95 AGATGACACTGAAATTTGGTCCAGCACGTAATGACAGTGTCATTGTGGCTGATCAGACCCCAACACCAACAAGA 168
Query 223 TTCTTGAAAAACTGTGAAGAAGTGGGTTTGTTTAATGAGTTGGCGAGTCCATTTGAGAATGAATTCAAGAAAGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 TTCTTGAAAAACTGTGAAGAAGTGGGTTTGTTTAATGAGTTGGCGAGTCCATTTGAGAATGAATTCAAGAAAGC 242
Query 297 TTCAGAAGATGACATTAAAAAAATGCCTCTAGATTTATCCCCTCTTGCAACACCTATCATAAGAAGCAAAATTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 TTCAGAAGATGACATTAAAAAAATGCCTCTAGATTTATCCCCTCTTGCAACACCTATCATAAGAAGCAAAATTG 316
Query 371 AGGAGCCTTCTGTTGTAGAAACAACTCACCAGGATAGTCCTTTACCTCACCCAGAGTCTACTACCAGTGATGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 AGGAGCCTTCTGTTGTAGAAACAACTCACCAGGATAGTCCTTTACCTCACCCAGAGTCTACTACCAGTGATGAG 390
Query 445 AAGGAAGTACCATTGGCACAAACTGCACAGCCCACATCAGCTATTGTTCGTCCAGCATCATTACAGGTTCCCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 AAGGAAGTACCATTGGCACAAACTGCACAGCCCACATCAGCTATTGTTCGTCCAGCATCATTACAGGTTCCCAA 464
Query 519 TGTGCTGCTTACAAGTTCTGACTCAAGTGTAATTATTCAGCAGGCAGTACCTTCACCAACCTCAAGTACTGTAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 TGTGCTGCTTACAAGTTCTGACTCAAGTGTAATTATTCAGCAGGCAGTACCTTCACCAACCTCAAGTACTGTAA 538
Query 593 TCACCCAGGCACCATCCTCTAACAGGCCAATTGTCCCTGTACCAGGCCCATTTCCTCTTCTGTTACATCTTCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 TCACCCAGGCACCATCCTCTAACAGGCCAATTGTCCCTGTACCAGGCCCATTTCCTCTTCTGTTACATCTTCCT 612
Query 667 AATGGACAAACCATGCCTGTTGCTATTCCTGCATCAATTACAAGTTCTAATGTGCATGTTCCAGCTGCAGTCCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 AATGGACAAACCATGCCTGTTGCTATTCCTGCATCAATTACAAGTTCTAATGTGCATGTTCCAGCTGCAGTCCC 686
Query 741 ACTCGTTCGACCAGTCACCATGGTGCCTAGTGTTCCAGGAATCCCAGGTCCTTCCTCTCCCCAACCAGTACAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 ACTCGTTCGACCAGTCACCATGGTGCCTAGTGTTCCAGGAATCCCAGGTCCTTCCTCTCCCCAACCAGTACAGT 760
Query 815 CAGAAGCAAAAATGAGATTAAAAGCTGCTTTGACCCAGCAACATCCTCCAGTTACCAATGGTGATACTGTCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 CAGAAGCAAAAATGAGATTAAAAGCTGCTTTGACCCAGCAACATCCTCCAGTTACCAATGGTGATACTGTCAAA 834
Query 889 GGTCATGGTAGCGGATTGGTTAGGACTCAGTCAGAGGAATCTCGACCGCAGTCATTACAACAGCCAGCCACATC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GGTCATGGTAGCGGATTGGTTAGGACTCAGTCAGAGGAATCTCGACCGCAGTCATTACAACAGCCAGCCACATC 908
Query 963 CACTACAGAAACTCCGGCTTCTCCAGCTCACACAACTCCACAGACCCAAAGTACAAGTGGTCGTCGGAGAAGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 CACTACAGAAACTCCGGCTTCTCCAGCTCACACAACTCCACAGACCCAAAGTACAAGTGGTCGTCGGAGAAGAG 982
Query 1037 CAGCTAACGAAGATCCTGATGAAAAAAGGAGAAAGTTTTTAGAGCGAAATAGAGCAGCAGCTTCAAGATGCCGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 CAGCTAACGAAGATCCTGATGAAAAAAGGAGAAAGTTTTTAGAGCGAAATAGAGCAGCAGCTTCAAGATGCCGA 1056
Query 1111 CAAAAAAGGAAAGTCTGGGTTCAGTCTTTAGAGAAGAAAGCTGAAGACTTGAGTTCATTAAATGGTCAGCTGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 CAAAAAAGGAAAGTCTGGGTTCAGTCTTTAGAGAAGAAAGCTGAAGACTTGAGTTCATTAAATGGTCAGCTGCA 1130
Query 1185 GAGTGAAGTCACCCTGCTGAGAAATGAAGTGGCACAGCTGAAACAGCTTCTTCTGGCTCATAAAGATTGCCCTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 GAGTGAAGTCACCCTGCTGAGAAATGAAGTGGCACAGCTGAAACAGCTTCTTCTGGCTCATAAAGATTGCCCTG 1204
Query 1259 TAACCGCCATGCAGAAGAAATCTGGCTATCATACTGCTGATAAAGATGATAGTTCAGAAGACATTTCAGTGCCG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 TAACCGCCATGCAGAAGAAATCTGGCTATCATACTGCTGATAAAGATGATAGTTCAGAAGACATTTCAGTGCCG 1278
Query 1333 AGTAGTCCACATACAGAAGCTATACAGCATAGTTCGGTCAGCACATCCAATGGAGTCAGTTCAACCTCCAAGGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 AGTAGTCCACATACAGAAGCTATACAGCATAGTTCGGTCAGCACATCCAATGGAGTCAGTTCAACCTCCAAGGC 1352
Query 1407 AGAAGCTGTAGCCACTTCAGTCCTCACCCAGATGGCGGACCAGAGTACAGAGCCTGCTCTTTCACAGATCGTTA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353 AGAAGCTGTAGCCACTTCAGTCCTCACCCAGATGGCGGACCAGAGTACAGAGCCTGCTCTTTCACAGATCGTTA 1426
Query 1481 TGGCTCCTTCCTCCCAGTCACAGCCCTCAGGAAGT 1515
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1427 TGGCTCCTTCCTCCCAGTCACAGCCCTCAGGAAGT 1461