Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00361
• Subject: NM_009715.3
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1259
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGAAATTCAAGTTACATGTGAATTCTGCCAGGCAATACAAGGACCTGTGGAATATGAGTGATGACAAACCCTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTATGTACTGCGCCTGGATGTGGCCAGCGTTTTACCAACGAGGATCATTTGGCTGTCCATAAACATAAACATG  148
               |||.|||||.|||||.||||||||                                               
Sbjct    1  ---ATGCACTGCCCCTGGGTGTGGCCA-----------------------------------------------  24

Query  149  AGATGACACTGAAATTTGGTCCAGCACGTAATGACAGTGTCATTGTGGCTGATCAGACCCCAACACCAACAAGA  222
                                                              ||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct   25  --------------------------------------------------GATCAGACTCCAACGCCAACAAGA  48

Query  223  TTCTTGAAAAACTGTGAAGAAGTGGGTTTGTTTAATGAGTTGGCGAGTCCATTTGAGAATGAATTCAAGAAAGC  296
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct   49  TTCCTAAAAAACTGTGAAGAAGTGGGTTTGTTCAATGAGTTGGCAAGTCCATTTGAAAATGAATTCAAGAAGGC  122

Query  297  TTCAGAAGATGACATTAAAAAAATGCCTCTAGATTTATCCCCTCTTGCAACACCTATCATAAGAAGCAAAATTG  370
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  123  TTCCGAAGATGACATTAAAAAAATGCCTCTAGATTTGTCCCCTCTTGCAACACCCATCATAAGAAGCAAAATTG  196

Query  371  AGGAGCCTTCTGTTGTAGAAACAACTCACCAGGATAGTCCTTTACCTCACCCAGAGTCTACTACCAGTGATGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  197  AGGAGCCTTCTGTTGTAGAAACAACTCACCAGGACAGCCCTTTACCTCACCCCGAGTCGACTACCAGTGATGAA  270

Query  445  AAGGAAGTACCATTGGCACAAACTGCACAGCCCACATCAGCTATTGTTCGTCCAGCATCATTACAGGTTCCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  AAGGAAGTACCATTGGCACAAACTGCACAGCCCACATCAGCTATCGTTCGTCCAGCATCATTACAGGTTCCCAA  344

Query  519  TGTGCTGCTTACAAGTTCTGACTCAAGTGTAATTATTCAGCAGGCAGTACCTTCACCAACCTCAAGTACTGTAA  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  TGTGCTGCTCACAAGTTCTGACTCAAGTGTAATTATTCAACAAGCAGTACCTTCACCAACCTCAAGTACTGTAA  418

Query  593  TCACCCAGGCACCATCCTCTAACAGGCCAATTGTCCCTGTACCAGGCCCATTTCCTCTTCTGTTACATCTTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  419  TCACCCAGGCACCATCCTCTAACAGGCCAATTGTTCCTGTACCAGGCCCATTTCCTCTTCTCTTACATCTTCCT  492

Query  667  AATGGACAAACCATGCCTGTTGCTATTCCTGCATCAATTACAAGTTCTAATGTGCATGTTCCAGCTGCAGTCCC  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  AATGGACAAACCATGCCCGTTGCTATTCCTGCATCAATTACAAGTTCTAATGTGCATGTTCCAGCTGCAGTCCC  566

Query  741  ACTCGTTCGACCAGTCACCATGGTGCCTAGTGTTCCAGGAATCCCAGGTCCTTCCTCTCCCCAACCAGTACAGT  814
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  567  ACTTGTTCGGCCAGTCACCATGGTGCCTAGTGTTCCAGGAATCCCAGGCCCTTCCTCTCCTCAACCAGTCCAGT  640

Query  815  CAGAAGCAAAAATGAGATTAAAAGCTGCTTTGACCCAGCAACATCCTCCAGTTACCAATGGTGATACTGTCAAA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  641  CAGAAGCAAAAATGAGATTAAAAGCTGCTTTGACCCAGCAACACCCTCCAGTTACCAATGGTGATACTGTAAAA  714

Query  889  GGTCATGGTAGCGGATTGGTTAGGACTCAGTCAGAGGAATCTCGACCGCAGTCATTACAACAGCCAGCCACATC  962
            ||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  715  GGCCATGGCAGTGGATTGGTTAGGACTCAGTCAGAAGAGTCTCGCCCACAGTCCTTGCAGCAGCCAGCCACCTC  788

Query  963  CACTACAGAAACTCCGGCTTCTCCAGCTCACACAACTCCACAGACCCAAAGTACAAGTGGTCGTCGGAGAAGAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  789  CACTACAGAAACTCCGGCTTCTCCAGCTCACACAACTCCTCAGACCCAAAATACAAGTGGCCGTCGAAGAAGAG  862

Query 1037  CAGCTAACGAAGATCCTGATGAAAAAAGGAGAAAGTTTTTAGAGCGAAATAGAGCAGCAGCTTCAAGATGCCGA  1110
            |||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  CAGCTAATGAAGATCCTGATGAGAAAAGGAGGAAGTTTCTAGAACGAAATAGAGCAGCAGCTTCAAGATGCCGA  936

Query 1111  CAAAAAAGGAAAGTCTGGGTTCAGTCTTTAGAGAAGAAAGCTGAAGACTTGAGTTCATTAAATGGTCAGCTGCA  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  937  CAAAAAAGGAAAGTGTGGGTTCAGTCCTTAGAGAAGAAAGCAGAAGACTTGAGTTCACTAAATGGCCAGCTGCA  1010

Query 1185  GAGTGAAGTCACCCTGCTGAGAAATGAAGTGGCACAGCTGAAACAGCTTCTTCTGGCTCATAAAGATTGCCCTG  1258
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  GAGCGAAGTCACCCTGCTGAGAAATGAAGTGGCCCAGCTGAAACAGCTTCTTCTGGCTCATAAAGATTGCCCTG  1084

Query 1259  TAACCGCCATGCAGAAGAAATCTGGCTATCATACTGCTGATAAAGATGATAGTTCAGAAGACATTTCAGTGCCG  1332
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.
Sbjct 1085  TAACTGCCATGCAGAAGAAGTCTGGCTATCATACTGCTGATAAAGATGACAGTTCAGAAGACCTTTCTGTGCCA  1158

Query 1333  AGTAGTCCACATACAGAAGCTATACAGCATAGTTCGGTCAGCACATCCAATGGAGTCAGTTCAACCTCCAAGGC  1406
            ||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1159  AGCAGTCCACATACAGAAGCGATCCAGCACAGCTCTGTCAGCACATCCAATGGAGTCAGTTCAACATCAAAAGC  1232

Query 1407  AGAAGCTGTAGCCACTTCAGTCCTCACCCAGATGGCGGACCAGAGTACAGAGCCTGCTCTTTCACAGATCGTTA  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1233  AGAAGCTGTAGCCACTTCAGTCCTCACCCAGATGGCGGACCAGAGCACGGAGCCTGCACTTTCACAGATTGTCA  1306

Query 1481  TGGCTCCTTCCTCCCAGTCACAGCCCTCAGGAAGT  1515
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1307  TGGCTCCTCCCTCCCAGGCACAGCCCTCAGGAAGT  1341