Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00411
• Subject: NM_000765.5
• Aligned Length: 1509
• Identities: 1425
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74
            ||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATCTCATCCCAAACTTGGCCGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGATACTCCTCTATCTATA  74

Query   75  TGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATA  148
            ||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  TGGAACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATG  148

Query  149  TTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGTGTGGGGCTTT  222
            .||||||||.||.||||||||.|||.|.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||..||
Sbjct  149  CTTTGTCCTTCCGTAAGGGCTATTGGACGTTTGACATGGAATGTTATAAAAAGTATAGAAAAGTCTGGGGTATT  222

Query  223  TATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296
            |||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGACTGTCAACAGCCTATGCTGGCTATCACAGATCCCGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296

Query  297  TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATAGCTGAGGATG  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTCGGGCCAGTGGGATTTATGAAAAATGCCATCTCTATAGCTGAGGATG  370

Query  371  AAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC  444
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAATGGAAGAGAATACGATCATTGCTGTCTCCAACATTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC  444

Query  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518

Query  519  AGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  592
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  519  ACACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAGCATCGACTCTCTCAACA  592

Query  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATTCTTTCTCTCA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||...||.|||||||||.||||||||
Sbjct  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTAATCCATTAGATCCATTCGTTCTCTCA  666

Query  667  ATAACAGTCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAGAAGTTACAAA  740
            ||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||.||||||.||.
Sbjct  667  ATAAAAGTCTTTCCATTCCTTACCCCAATTCTTGAAGCATTAAATATCACTGTGTTTCCAAGAAAAGTTATAAG  740

Query  741  TTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCACCGAGTGGATTTCC  814
            ||||.|||.|||||||||||||..|||.||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTCTAACAAAATCTGTAAAACAGATAAAAGAAGGTCGCCTCAAAGAGACACAAAAGCACCGAGTGGATTTCC  814

Query  815  TTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGATCTGGAGCTCGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  815  TTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGACTCTGAGACCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTCATG  888

Query  889  GCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATGTATGAACT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATATATGAACT  962

Query  963  GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCACCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAAGTGCAGAAGGAAATTGATACAGTTTTACCCAATAAGGCACCACCCA  1036

Query 1037  CCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAATTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1037  CCTATGATACTGTGCTACAGTTGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTTGCT  1110

Query 1111  ATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAGGGGTGGTGGTGAT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAAATCAATGGGATGTTTATTCCCAAAGGGGTGGTGGTGAT  1184

Query 1185  GATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGATTCA  1258
            ||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  GATTCCAAGCTATGTTCTTCATCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGGTTCA  1258

Query 1259  GCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATTGGC  1332
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTAAAAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATTGGC  1332

Query 1333  ATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAA  1406
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGAGGTTTGCTCTCGTGAACATGAAACTTGCTCTAGTCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAA  1406

Query 1407  AGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGGAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCGTTGTTCTAAAGGTTG  1480
            |||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1407  AGAAACACAGATCCCCCTGAAATTACGCTTTGGAGGACTTCTTCTAACAGAAAAACCCATTGTTCTAAAGGCTG  1480

Query 1481  AGTCAAGGGATGGCACCGTAAGTGGAGCC  1509
            ||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTCAAGGGATGAGACCGTAAGTGGAGCC  1509