Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00427
• Subject: NM_001129889.2
• Aligned Length: 1656
• Identities: 1557
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAATCCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAATCCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTT  74

Query   75  CCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACAGCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGGTGCAGAGTCGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACAGCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGGTGCAGAGTCGGCCA  148

Query  149  ATGTCTGTGGCTCTCAGCAAGGCCGGGGGCAGTGCACAGAGGTGCGAGCCGACACAAGGCCCTGGAGTGGTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTCTGTGGCTCTCAGCAAGGCCGGGGGCAGTGCACAGAGGTGCGAGCCGACACAAGGCCCTGGAGTGGTCCC  222

Query  223  TACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTGAGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAAGTGCACAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTGAGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAAGTGCACAGG  296

Query  297  AAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAAGAAACCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAAGAAACCAC  370

Query  371  CAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAGATCTCGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAGATCTCGCG  444

Query  445  AAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAATGGAACCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAATGGAACCCA  518

Query  519  GCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGATACATTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGATACATTAT  592

Query  593  TAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGCACCGGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGCACCGGTAC  666

Query  667  CATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTACTGGAACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTACTGGAACTT  740

Query  741  TGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGATCCGACTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGATCCGACTC  814

Query  815  TGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACCACCTGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACCACCTGGTC  888

Query  889  ACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAATTGCCAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAATTGCCAAC  962

Query  963  CTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTCTACCTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTCTACCTTCA  1036

Query 1037  GTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCCTTCATAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCCTTCATAAT  1110

Query 1111  TTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTTG-------  1177
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 1111  TTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTTGTGGTGAT  1184

Query 1178  --------------------------------------------------------------------------  1177
                                                                                      
Sbjct 1185  TTCTAATCGTTTGCTTTACAATGCTACAACAAACATCCTTGAACATGTAAGAAAAGAGAAAGCGACCAAGGAAC  1258

Query 1178  ------------------TGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAAT  1233
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCTTCCCTGCATGTGCTGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAAT  1332

Query 1234  CCTCCTGCAGATGCCTGGCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTT  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTCCTGCAGATGCCTGGCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTT  1406

Query 1308  CCCTCCAGTGACTAATGAAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAG  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCTCCAGTGACTAATGAAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAG  1480

Query 1382  TTTCAGTTGAAGAAACTCCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGT  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTCAGTTGAAGAAACTCCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGT  1554

Query 1456  CTTTTTGTGCTGTTGGCTTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTT  1529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTTTTGTGCTGTTGGCTTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTT  1628

Query 1530  AAGCAGCAAGAGATACACAGAAGAAGCC  1557
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGCAGCAAGAGATACACAGAAGAAGCC  1656