Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00427
- Subject:
- NM_001322186.2
- Aligned Length:
- 1565
- Identities:
- 1337
- Gaps:
- 205
Alignment
Query 1 ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAATCCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACAGCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGG--TGCAGAGTCGGC 146
.||||| ||||| |.||.| |.|
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGCTG-------CTGGGGATACAAA---GAC 22
Query 147 CAATGTCTGTGGCTCTCAGCAAG-GCCGGGGGCAGT----GCACAGAGGTGCGAGCCGACACAAGGCCCTGGAG 215
.|||| ||| ||| || |..|.||.|| |||| |||...||.|||
Sbjct 23 AAATG---------------AAGTGCC-------GTCTCCGTTCTGATGT-------GACA-AAGAGACTAGAG 66
Query 216 TGGTCCCTACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTGAGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAA-G 288
||| |||||.|.||.| ||.|.| |||.| |.||| |
Sbjct 67 -----------------GAA-----GATGAACATGTG--------AACACA-------CACAG----TCCAATG 99
Query 289 TGCACAGGAAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAA 362
.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 AGAAGAGGAAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGACCGGTCCCAACTGCGAGCGGAA 173
Query 363 GAAACCACCAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAG 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 GAAACCACCAGTGATTCGGCAGAACATCCATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAG 247
Query 437 ATCTCGCGAAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAAT 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 ATCTCGCGAAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCTGGGCCTGCTTGGGCCCAAT 321
Query 511 GGAACCCAGCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGA 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 GGAACCCAGCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTGTTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGA 395
Query 585 TACATTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGC 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 TACATTATTAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACATCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGC 469
Query 659 ACCGGTACCATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTAC 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 ACCGGTACCATTTGTTGTGTCTGGAAAGAGATCTCCAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCTTTGCCCTAC 543
Query 733 TGGAACTTTGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGA 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 TGGAACTTTGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTACAGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGA 617
Query 807 TCCGACTCTGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACC 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 TCCGACTCTGATTAGTCGGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGCTTGGATGACTACAACC 691
Query 881 ACCTGGTCACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAA 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 ACCTGGTCACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGGTTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAA 765
Query 955 TTGCCAACCTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTC 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 TTGCCAACCTTAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCCTTCTTCCAGAACTC 839
Query 1029 TACCTTCAGTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCC 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TACCTTCAGTTTCAGGAATGCTTTGGAAGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCC 913
Query 1103 TTCATAATTTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTT 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 TTCATAATTTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCAGCCGCCAATGATCCCATTTTT 987
Query 1177 GTGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATGCCTG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 GTGGTTCTTCATTCCTTTACTGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATGCCTG 1061
Query 1251 GCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATG 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 GCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATGGTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATG 1135
Query 1325 AAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGTTTCAGTTGAAGAAACT 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 AAGAACTCTTTTTAACCTCAGACCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGTTTCAGTTGAAGAAACT 1209
Query 1399 CCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGC 1472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 CCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACACTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGC 1283
Query 1473 TTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCAAGAGATACA 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TTTTCTTCAATATAGAAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCAAGAGATACA 1357
Query 1547 CAGAAGAAGCC 1557
|||||||||||
Sbjct 1358 CAGAAGAAGCC 1368