Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00446
- Subject:
- XM_006528023.3
- Aligned Length:
- 1627
- Identities:
- 1359
- Gaps:
- 110
Alignment
Query 1 --------------------------------------------------------------ATGGCGGATGC- 11
|.|.| ||.|
Sbjct 1 ATGCAGAAGCCACGTGGAGAACCCGAAGGGAAGCCAACACGTGCTAGAGTCATTTACCAGCCAAGCC--ATCCT 72
Query 12 -------GG-------AAGTAATTATTTTGCCAAAGAAACATAAGAAGAAAAAGGAGCGGAAGTCATTGCCAGA 71
|| ||.||||||..||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.||||.|.|||
Sbjct 73 AGTGTTTGGCCTCACAAACTAATTACATTCCCAAAGAAGCATAAGAAGAAAAAAGACCGGAAGCCATTACAAGA 146
Query 72 AGAAGATGTAGCCGAAATACAACACGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCTGAATCCAAAGTTGCTAAGTTGGACA 145
|||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|.||.||||
Sbjct 147 AGATGATGTTGCCGAAATACAACATGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCAGAATCTAAAGTGGCTCAATTAGACA 220
Query 146 CGTCTCAGTGGCCCCTTTTGCTAAAGAATTTTGATAAGCTGAATGTAAGGACAACACACTATACACCTCTTGCA 219
|.||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|.
Sbjct 221 CTTCTCAGTGGCCCTTGTTACTAAAGAATTTTGATAAGCTAAATGTAAGGACAGCACACTATACACCTCTTCCT 294
Query 220 TGTGGTTCAAATCCTCTGAAGAGAGAGATTGGGGACTATATCAGGACAGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTC 293
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 TGTGGTTCAAATCCTCTGAAGAGGGAGATTGGGGACTATATCAGGACCGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTC 368
Query 294 TAACCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATTCGACGGATACTTCGGGTGGAGAAGACAGGGCACAGTGGTA 367
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 369 TAACCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATCCGACGAATACTTCGGGTAGAGAAGACTGGCCACAGTGGCA 442
Query 368 CTCTGGATCCCAAGGTGACTGGTTGTTTAATCGTGTGCATAGAACGAGCCACTCGCTTGGTGAAGTCACAACAG 441
|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 443 CACTAGATCCCAAAGTGACTGGTTGTTTAATTGTGTGCATTGAACGAGCCACTCGTTTGGTGAAATCACAACAG 516
Query 442 AGTGCAGGCAAAGAGTATGTGGGGATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGGACCCAGCTTTCTAGGGC 515
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 517 AGTGCAGGCAAAGAGTATGTTGGAATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGTACTCAGCTTTCTAGGGC 590
Query 516 CCTAGAAACTCTGACAGGTGCCTTATTCCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTCCGAGTGA 589
||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 591 CCTAGAAACTCTGACAGGTGCCCTGTTTCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTTCGAGTGA 664
Query 590 GGACCATCTACGAGAGCAAAATGATTGAATACGATCCTGAAAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTGAGTTGTGAG 663
||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 665 GGACTATCTACGAGAGCAAAATGATAGAATATGATCCTGAGAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTAAGCTGTGAA 738
Query 664 GCTGGCACCTACATTCGGACATTATGTGTGCACCTTGGTTTGTTATTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAGCT 737
|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 739 GCTGGCACCTACATTCGGACACTATGCGTACACCTTGGCTTGTTACTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAACT 812
Query 738 TCGGAGGGTTCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTGCTTGATGCTCAGT 811
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 813 TCGGAGGGTGCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTACTCGATGCTCAGT 886
Query 812 GGCTGTATGATAACCACAAGGATGAGAGTTACCTGCGGCGAGTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCT 885
||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 GGCTGTATGATAACCATAAGGATGAGAGTTACTTGCGGCGTGTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCT 960
Query 886 CATAAACGGCTGGTTATGAAAGACAGTGCAGTAAATGCCATCTGCTATGGGGCCAAGATTATGCTTCCAGGTGT 959
||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|
Sbjct 961 CATAAACGTCTGGTTATGAAAGATAGTGCAGTGAATGCAATCTGCTATGGGGCCAAGATCATGCTTCCTGGTCT 1034
Query 960 TCTTCGATATGAGGACGGCATTGAGGTCAATCAGGAGATTGTGGTTATCACCACCAAAGGAGAAGCAATCTGCA 1033
||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1035 TCTTCGATATGAAGATGGCATTGAGGTCAACCAGGAGATTGTGGTCATTACTACTAAGGGGGAAGCTATCTGCA 1108
Query 1034 TGGCTATTGCATTAATGACCACAGCGGTCATCTCTACCTGCGACCATGGTATAGTAGCCAAGATCAAGAGAGTG 1107
||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1109 TGGCAATTGCATTGATGACTACAGCAGTGATTTCTACCTGTGACCATGGTATAGTAGCCAAAATAAAGAGGGTG 1182
Query 1108 ATCATGGAGAGAGACACTTACCCTCGGAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGCTGATGATCAA 1181
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1183 ATCATGGAGAGAGACACTTATCCTCGCAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGATGATGATCAA 1256
Query 1182 GCAGGGCCTTCTGGACAAGCATGGGAAGCCCACAGACAGCACACCTGCCACCTGGAAGCAGGAGTATGTTGACT 1255
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||..||.||||||||.|||||.|||||.||..||||||
Sbjct 1257 GCAGGGCCTTCTGGACAAGCATGGCAAACCCACAGACAATACCCCTGCCACATGGAAACAGGATTACATTGACT 1330
Query 1256 ACAGTGAGTCTGCCAA-AAAAGAGGTGGTTGCTGAAGTGGTAAAAGCCCCGCAGGTAGTTGCCGAAGCAG---- 1324
|.|||||.||||.||| ||.|.| .|||||.|.||||..|||.|||||||.|||.|||.|||.|||||||
Sbjct 1331 ATAGTGATTCTGGCAAGAACACA-CTGGTTACCGAAGCAGTACAAGCCCCTCAGTTAGCTGCTGAAGCAGTAAA 1403
Query 1325 ---CAAAAACTGCGAAGCGGAAGCGAGAGAGTGAGAGTGAAAGTGACGAGACTCCTCCAGCAGCTCCTCAGTTG 1395
||.||| || |||||||.||.|||||||||||||||||.|||| |.|||.|||.|||.|||||
Sbjct 1404 TGTCATAAA-----AA--GGAAGCGGGATAGTGAGAGTGAAAGTGATGAGA---CCCCAACAGTTCCCCAGTT- 1466
Query 1396 ATCAAGAAGGAAAAGAAGAAGAGTAAGAAGGACAAGAAGGCCAAAGCTGGTCTGGAGAGCGGGGCCGAGCCTGG 1469
|||||||||||||||| ||||||||.||||||.|||||.|||..||.||.||.||||.|||..||||
Sbjct 1467 -----GAAGGAAAAGAAGAAG---AAGAAGGATAAGAAGCCCAAAACTGTGCTAGAAAGTGGGGGCGAAACTGG 1532
Query 1470 AGATGGGGACAGTGATACCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAAAGAGGTAGAATTGGTTTCTGAG 1542
|||||||||||..||.|||||| ||.|||||.|||||||||||||.|||||.|||||||..|.|.|||||.
Sbjct 1533 AGATGGGGACAACGACACCACC---AAAAAGAAAAAGAAGAAGAAAGTAAAAGTGGTAGAAGAGATGTCTGAA 1602