Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00454
• Subject: XM_011532666.2
• Aligned Length: 2767
• Identities: 2161
• Gaps: 590

Alignment

Query    1  ATGCCCGCCATGCCCTCCAGCGGCCCCGGGGACACCAGCAGCTCTGCTGCGGAGCGGGAGGAGGACCGAAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGAGAGGAGCAGGAGGAGCCGCGTGGCAAGGAGGAGCGCCAAGAGCCCAGCACCACGGCACGGAAGGTGGGGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCTGGGAGGAAGCGCAAGCACCCCCCGGTGGAAAGCGGTGACACGCCAAAGGACCCTGCGGTGATCTCCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCCCATCCATGGCCCAGGACTCAGGCGCCTCAGAGCTATTACCCAATGGGGACTTGGAGAAGCGGAGTGAGCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCAGCCAGAGGAGGGGAGCCCTGCTGGGGGGCAGAAGGGCGGGGCCCCAGCAGAGGGAGAGGGTGCAGCTGAGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTGCCTGAAGCCTCAAGAGCAGTGGAAAATGGCTGCTGCACCCCCAAGGAGGGCCGAGGAGCCCCTGCAGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GCGGGCAAAGAACAGAAGGAGACCAACATCGAATCCATGAAAATGGAGGGCTCCCGGGGCCGGCTGCGGGGTGG  518
                                                      |||  |||.|||.||.||.||.||.|.|..||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATG--GGGATCCTGGAGCGGGTTGTGAGAAGG  30

Query  519  CTTGGGCTGGGAGTCCAGCCTCCGTCAGCGGCCCATGCCGAGGCTCACCTTCCAGGCGGGGGACCCCTACTACA  592
            ..|||||                                                |||.||            |
Sbjct   31  AATGGGC------------------------------------------------GCGTGG------------A  44

Query  593  TC--AGC----AAGCGCAAGCGGGACGAGT--------------GGCTGGCACGCTG-GAAAAGGGA-------  638
            ||  |||    ||          |||||||              ||.||| |.|||| |.||.||||       
Sbjct   45  TCGTAGCCTGAAA----------GACGAGTGTGATACGGTGAAAGGATGG-AGGCTGTGCAATGGGAGAATAAC  107

Query  639  ---GGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTCATTGCAGGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTC  709
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  108  TGGGGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTCATTGCAGGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTC  181

Query  710  AGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGTGCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  182  AGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGTGCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACG  255

Query  784  CCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACAAGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGA  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  256  CCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACAAGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGA  329

Query  858  CGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTGTGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  330  CGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTGTGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTG  403

Query  932  TGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGCAGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAA  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  TGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGCAGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAA  477

Query 1006  TTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGCCGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  TTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGCCGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAA  551

Query 1080  CAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTACGAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCC  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  552  CAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTACGAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCC  625

Query 1154  CGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACACTGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  CGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACACTGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGG  699

Query 1228  GCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTAAGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGA  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  GCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTAAGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGA  773

Query 1302  AGTGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAGGCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGA  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  AGTGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAGGCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGA  847

Query 1376  AGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGAGATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTG  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  AGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGAGATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTG  921

Query 1450  CGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCTGCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCT  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  CGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCTGCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCT  995

Query 1524  CTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAGAACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCT  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  CTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAGAACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCT  1069

Query 1598  ACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGGCCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGC  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  ACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGGCCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGC  1143

Query 1672  TTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGGGGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAA  1745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  TTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGGGGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAA  1217

Query 1746  CTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTACGGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGA  1819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218  CTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTACGGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGA  1291

Query 1820  TGTTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATTTGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGG  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292  TGTTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATTTGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGG  1365

Query 1894  AAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCA  1967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366  AAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATGGAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCA  1439

Query 1968  GGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGTGAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGA  2041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440  GGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGTGAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGA  1513

Query 2042  TCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATT  2115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514  TCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCACACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATT  1587

Query 2116  GGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCGTCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCT  2189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588  GGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCGTCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCT  1661

Query 2190  CTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGATGCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCT  2263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662  CTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGATGCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCT  1735

Query 2264  TTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGACAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATG  2337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736  TTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGACAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATG  1809

Query 2338  ATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACAGGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCC  2411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810  ATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACAGGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCC  1883

Query 2412  GTTGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAGCTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCA  2485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884  GTTGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAGCTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCA  1957

Query 2486  AAGTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTCCATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAAT  2559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1958  AAGTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTCCATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAAT  2031

Query 2560  GAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAATGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTC  2633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032  GAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAATGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTC  2105

Query 2634  CAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTGCTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCG  2707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106  CAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTGCTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCG  2179

Query 2708  CTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG  2736
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180  CTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG  2208