Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00499
• Subject: NM_013508.2
• Aligned Length: 1227
• Identities: 1094
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGAGAGTGCAATCACGCTGTGGCAGTTCCTGTTGCAGTTGCTGCTGGATCAGAAACATGAGCATTTGATCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.|||||
Sbjct    1  ATGGAGAGTGCAATCACGCTGTGGCAGTTCCTCTTGCACTTGCTGCTGGACCAGAAACATGAGCACCTCATCTG  74

Query   75  CTGGACCTCGAACGATGGTGAATTCAAGCTCCTCAAAGCAGAAGAAGTGGCCAAGCTGTGGGGACTCCGAAAAA  148
            ||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct   75  CTGGACATCGAACGATGGCGAGTTCAAGCTCCTCAAGGCGGAAGAAGTGGCCAAGCTGTGGGGCCTCCGCAAGA  148

Query  149  ACAAAACAAATATGAACTATGATAAGCTGAGCAGAGCCCTGCGATACTATTATGACAAGAACATCATCAAGAAG  222
            ||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ACAAGACCAACATGAACTACGACAAGCTGAGCAGAGCGCTGAGATACTATTACGACAAGAACATCATCAAGAAA  222

Query  223  GTGATCGGGCAGAAGTTTGTGTACAAGTTTGTCTCTTTCCCGGAGATCCTGAAGATGGATCCTCACGCGGTGGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GTGATCGGGCAGAAGTTTGTGTACAAGTTCGTCTCTTTCCCGGATATCCTGAAAATGGATCCTCACGCGGTAGA  296

Query  297  GATCAGCCGGGAGAGCCTTCTGCTGCAGGACAGCGACTGCAAGGCGTCTCCGGAGGGCCGCGAGGCCCACAAAC  370
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||.|||.|||||.|||||.||||.|||||..|
Sbjct  297  GATCAGCCGGGAGAGCCTCCTGCTGCAGGACGGCGACTGTAAGGTGTCCCCGGAAGGCCGAGAGGTCCACAGGC  370

Query  371  ACGGCCTGGCCGCCCTCAGAAGCACGAGCCGCAACGAATACATCCACTCAGGCCTGTACTCGTCCTTCACCATT  444
            |||||.||.||.|.||||.|||..|.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  ACGGCTTGTCCTCTCTCAAAAGTGCCAGCCGCAACGAGTACCTCCACTCGGGCCTCTACTCGTCCTTCACCATC  444

Query  445  AATTCCCTGCAGAACCCACCAGACGCCTTCAAGGCCATCAAGACGGAGAAGCTGGAGGAGCCGCCCGAAGACAG  518
            ||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||....||.|||||
Sbjct  445  AACTCCCTGCAGAACGCTCCAGAGGCCTTCAAGGCCATCAAGACGGAGAAGCTGGAGGAGCCCTGTGATGACAG  518

Query  519  CCCCCCCGTGGAAGAAGTCAGGACTGTGATCAGGTTTGTGACCAATAAAACCGACAAGCACGTCACCAGGCCGG  592
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct  519  TCCCCCTGTGGAAGAAGTCAGGACTGTGATCAGGTTTGTGACCAATAAAACCGACAAGCACATCACCAGGCCTG  592

Query  593  TGGTGTCCCTGCCTTCCACGTCAGAG---GCTGCG---GCGGCGTCCGCCTTCCTGGCCTCGTCCGTCTCGGCC  660
            |||||||||||||||||||.||.|||   ||||||   |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGGTGTCCCTGCCTTCCACATCCGAGACCGCTGCGGCAGCGGCATCCGCTTTCCTGGCCTCGTCTGTCTCAGCC  666

Query  661  AAGATCTCCTCTTTAATGTTGCCAAACGCTGCCAGTATTTCATCCGCCTCACCCTTCTCATCTCGGTCCCCGTC  734
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||..||||||||||||||.||
Sbjct  667  AAGATCTCCTCTTTAATGTTGCCAAATGCTGCCAGCATTTCGTCTGCGTCACCCTCTTCATCTCGGTCCCCATC  740

Query  735  CCTGTCCCCCAACTCACCCCTCCCTTCTGAACACAGAAGCCTCTTCCTGGAGGCCGCCTGCCATGACTCCGATT  808
            ||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTGTCCCCCGACTCTCCCCTCCCTTCTGAACACAGAAGCCTCTTCCTGGAGGCAGCCTGCCATGACTCGGATT  814

Query  809  CCCTGGAGCCCTTGAACCTGTCATCGGGCTCCAAGACCAAGTCTCCATCTCTTCCCCCAAAGGCCAAAAAACCC  882
            |.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct  815  CTCTGGAGCCCCTGAATCTGTCATCGGGCTCCAAAACCAAGTCTCCATCTCTTCCCCCAAAAGGCAAAAAACCC  888

Query  883  AAAGGCTTGGAAATCTCAGCGCCCCCGCTGGTGCTCTCCGGCACCGACATCGGCTCCATCGCCCTCAACAGCCC  956
            |||||||||||||||||.||.||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGGCTTGGAAATCTCTGCACCCCAACTGTTGCTCTCCGGCACCGACATCGGCTCCATCGCCCTCAACAGCCC  962

Query  957  AGCCCTCCCCTCGGGATCCCTCACCCCAGCCTTCTTCACCGCACAGACACCAAATGGATTGCTTCTGACTCCGA  1030
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.|..|||
Sbjct  963  AGCCCTCCCCTCAGGATCCCTCACTCCAGCCTTCTTCACCGCACAGACACCAAGTGGACTGTTTCTGGCCTCGA  1036

Query 1031  GTCCACTGCTCTCCAGCATACATTTCTGGAGCAGCCTTAGTCCAGTTGCTCCGCTGAGTCCTGCCAGGCTGCAA  1104
            ||||.|||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCCGCTGCTGCCCAGCATACACTTCTGGAGCAGCCTTAGTCCTGTCGCCCCACTGAGTCCTGCCAGGCTGCAA  1110

Query 1105  GGGCCAAGCACGCTGTTCCAGTTCCCCACACTGCTTAATGGCCACATGCCAGTGCCAATCCCCAGTCTGGACAG  1178
            |||||.|.|||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGCCGAACACACTTTTCCAGTTCCCCACACTGCTCAACGGTCACATGCCGGTGCCGCTCCCCAGTCTGGACAG  1184

Query 1179  AGCTGCTTCTCCAGTACTGCTTTCTTCAAACTCTCAGAAATCC  1221
            ||||.|.||.|||||.|||||.||..|.|.|||||||||||||
Sbjct 1185  AGCTCCATCCCCAGTTCTGCTGTCCCCCAGCTCTCAGAAATCC  1227