Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00510
- Subject:
- NM_001256483.2
- Aligned Length:
- 1665
- Identities:
- 1467
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 ATGACGCTGCGCGCGGCCGTCTTCGACCTTGACGGGGTGCTGGCGCTGCCAGCGGTGTTCGGCGTCCTCGGCCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACGGAGGAGGCCCTGGCGCTGCCCAGAGGACTTCTGAATGATGCTTTCCAGAAAGGGGGACCAGAGGGTGCCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTACCCGGCTTATGAAAGGAGAGATCACACTTTCCCAGTGGATACCACTCATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC 222
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGGAAGAAAACTGCAGGAAGTGC 24
Query 223 TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 TCCGAGACCGCTAAAGTCTGCCTCCCCAAGAATTTCTCCATAAAAGAAATCTTTGACAAGGCGATTTCAGCCAG 98
Query 297 AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 AAAGATCAACCGCCCCATGCTCCAGGCAGCTCTCATGCTCAGGAAGAAAGGATTCACTACTGCCATCCTCACCA 172
Query 371 ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 ACACCTGGCTGGACGACCGTGCTGAGAGAGATGGCCTGGCCCAGCTGATGTGTGAGCTGAAGATGCACTTTGAC 246
Query 445 TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 TTCCTGATAGAGTCGTGTCAGGTGGGAATGGTCAAACCTGAACCTCAGATCTACAAGTTTCTGCTGGACACCCT 320
Query 519 GAAGGCCAGCCCCAGTGAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 GAAGGCCAGCCCCAGTGAGGTCGTTTTTTTGGATGACATCGGGGCTAATCTGAAGCCAGCCCGTGACTTGGGAA 394
Query 593 TGGTCACCATCCTGGTCCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 TGGTCACCATCCTGGTCCAGGACACTGACACGGCCCTGAAAGAACTGGAGAAAGTGACCGGAATCCAGCTTCTC 468
Query 667 AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 AATACCCCGGCCCCTCTGCCGACCTCTTGCAATCCAAGTGACATGAGCCATGGGTACGTGACAGTAAAGCCCAG 542
Query 741 GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 GGTCCGTCTGCATTTTGTGGAGCTGGGCTCCGGCCCTGCTGTGTGCCTCTGCCATGGATTTCCCGAGAGTTGGT 616
Query 815 ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 ATTCTTGGAGGTACCAGATCCCTGCTCTGGCCCAGGCAGGTTACCGGGTCCTAGCTATGGACATGAAAGGCTAT 690
Query 889 GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 GGAGAGTCATCTGCTCCTCCCGAAATAGAAGAATATTGCATGGAAGTGTTATGTAAGGAGATGGTAACCTTCCT 764
Query 963 GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 GGATAAACTGGGCCTCTCTCAAGCAGTGTTCATTGGCCATGACTGGGGTGGCATGCTGGTGTGGTACATGGCTC 838
Query 1037 TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TCTTCTACCCCGAGAGAGTGAGGGCGGTGGCCAGTTTGAATACTCCCTTCATACCAGCAAATCCCAACATGTCC 912
Query 1111 CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 CCTTTGGAGAGTATCAAAGCCAACCCAGTATTTGATTACCAGCTCTACTTCCAAGAACCAGGAGTGGCTGAGGC 986
Query 1185 TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 TGAACTGGAACAGAACCTGAGTCGGACTTTCAAAAGCCTCTTCAGAGCAAGCGATGAGAGTGTTTTATCCATGC 1060
Query 1259 ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 ATAAAGTCTGTGAAGCGGGAGGACTTTTTGTAAATAGCCCAGAAGAGCCCAGCCTCAGCAGGATGGTCACTGAG 1134
Query 1333 GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 GAGGAAATCCAGTTCTATGTGCAGCAGTTCAAGAAGTCTGGTTTCAGAGGTCCTCTAAACTGGTACCGAAACAT 1208
Query 1407 GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 GGAAAGGAACTGGAAGTGGGCTTGCAAAAGCTTGGGACGGAAGATCCTGATTCCGGCCCTGATGGTCACGGCGG 1282
Query 1481 AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283 AGAAGGACTTCGTGCTCGTTCCTCAGATGTCCCAGCACATGGAGGACTGGATTCCCCACCTGAAAAGGGGACAC 1356
Query 1555 ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357 ATTGAGGACTGTGGGCACTGGACACAGATGGACAAGCCAACCGAGGTGAATCAGATCCTCATTAAGTGGCTGGA 1430
Query 1629 TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG 1665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 TTCTGATGCCCGGAACCCACCGGTGGTCTCAAAGATG 1467