Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00560
• Subject: NM_001321938.2
• Aligned Length: 756
• Identities: 561
• Gaps: 195

Alignment

Query   1  ATGGTAAAACCGGTGCCCCTCTTCAGGAGAACTGATTTCAAATTATTATTATGCAACCACAAGGATCTCTTCTT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TCTCAGGGTGTCTAAGCTGCTGGATTGCTTTTCGCCCAAATCAATGTGGTTTCTTTGGAACATTTTCAGCAAAG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GAACGCATATGCTGCAGTGTCTTTGTGGCAAGAGTCTTAAGAAAAACAAGAACCCAACTGATCCCCAGCTCAAG  222
                   ||||                ||||||    ||                   |||||||||||||||
Sbjct   1  --------ATGC----------------CAAGAG----AA-------------------GATCCCCAGCTCAAG  27

Query 223  GGTATAGTGACCAGGTTATATTGCAGGCAAGGCTACTACTTGCAAATGCACCCCGATGGAGCTCTCGATGGAAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  28  GGTATAGTGACCAGGTTATATTGCAGGCAAGGCTACTACTTGCAAATGCACCCCGATGGAGCTCTCGATGGAAC  101

Query 297  CAAGGATGACAGCACTAATTCTACACTCTTCAACCTCATACCAGTGGGACTACGTGTTGTTGCCATCCAGGGAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102  CAAGGATGACAGCACTAATTCTACACTCTTCAACCTCATACCAGTGGGACTACGTGTTGTTGCCATCCAGGGAG  175

Query 371  TGAAAACAGGGTTGTATATAGCCATGAATGGAGAAGGTTACCTCTACCCATCAGAACTTTTTACCCCTGAATGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176  TGAAAACAGGGTTGTATATAGCCATGAATGGAGAAGGTTACCTCTACCCATCAGAACTTTTTACCCCTGAATGC  249

Query 445  AAGTTTAAAGAATCTGTTTTTGAAAATTATTATGTAATCTACTCATCCATGTTGTACAGACAACAGGAATCTGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250  AAGTTTAAAGAATCTGTTTTTGAAAATTATTATGTAATCTACTCATCCATGTTGTACAGACAACAGGAATCTGG  323

Query 519  TAGAGCCTGGTTTTTGGGATTAAATAAGGAAGGGCAAGCTATGAAAGGGAACAGAGTAAAGAAAACCAAACCAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324  TAGAGCCTGGTTTTTGGGATTAAATAAGGAAGGGCAAGCTATGAAAGGGAACAGAGTAAAGAAAACCAAACCAG  397

Query 593  CAGCTCATTTTCTACCCAAGCCATTGGAAGTTGCCATGTACCGAGAACCATCTTTGCATGATGTTGGGGAAACG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398  CAGCTCATTTTCTACCCAAGCCATTGGAAGTTGCCATGTACCGAGAACCATCTTTGCATGATGTTGGGGAAACG  471

Query 667  GTCCCGAAGCCTGGGGTGACGCCAAGTAAAAGCACAAGTGCGTCTGCAATAATGAATGGAGGCAAACCAGTCAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472  GTCCCGAAGCCTGGGGTGACGCCAAGTAAAAGCACAAGTGCGTCTGCAATAATGAATGGAGGCAAACCAGTCAA  545

Query 741  CAAGAGTAAGACAACA  756
           ||||||||||||||||
Sbjct 546  CAAGAGTAAGACAACA  561