Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00560
• Subject: NM_001321939.1
• Aligned Length: 756
• Identities: 645
• Gaps: 111

Alignment

Query   1  ATGGTAAAACCGGTGCCCCTCTTCAGGAGAACTGATTTCAAATTATTATTATGCAACCACAAGGATCTCTTCTT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGTAAAACCGGTGCCCCTCTTCAGGAGAACTGATTTCAAATTATTATTATGCAACCACAAGGATCTCTTCTT  74

Query  75  TCTCAGGGTGTCTAAGCTGCTGGATTGCTTTTCGCCCAAATCAATGTGGTTTCTTTGGAACATTTTCAGCAAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCTCAGGGTGTCTAAGCTGCTGGATTGCTTTTCGCCCAAATCAATGTGGTTTCTTTGGAACATTTTCAGCAAAG  148

Query 149  GAACGCATATGCTGCAGTGTCTTTGTGGCAAGAGTCTTAAGAAAAACAAGAACCCAACTGATCCCCAGCTCAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 149  GAACGCATATGCTGCAGTGTCTTTGTGGCAAGAGTCTTAAGAAAAACAAGAACCCAACTG--------------  208

Query 223  GGTATAGTGACCAGGTTATATTGCAGGCAAGGCTACTACTTGCAAATGCACCCCGATGGAGCTCTCGATGGAAC  296
                                                                                     
Sbjct 209  --------------------------------------------------------------------------  208

Query 297  CAAGGATGACAGCACTAATTCTACACTCTTCAACCTCATACCAGTGGGACTACGTGTTGTTGCCATCCAGGGAG  370
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209  -----------------------CACTCTTCAACCTCATACCAGTGGGACTACGTGTTGTTGCCATCCAGGGAG  259

Query 371  TGAAAACAGGGTTGTATATAGCCATGAATGGAGAAGGTTACCTCTACCCATCAGAACTTTTTACCCCTGAATGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260  TGAAAACAGGGTTGTATATAGCCATGAATGGAGAAGGTTACCTCTACCCATCAGAACTTTTTACCCCTGAATGC  333

Query 445  AAGTTTAAAGAATCTGTTTTTGAAAATTATTATGTAATCTACTCATCCATGTTGTACAGACAACAGGAATCTGG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334  AAGTTTAAAGAATCTGTTTTTGAAAATTATTATGTAATCTACTCATCCATGTTGTACAGACAACAGGAATCTGG  407

Query 519  TAGAGCCTGGTTTTTGGGATTAAATAAGGAAGGGCAAGCTATGAAAGGGAACAGAGTAAAGAAAACCAAACCAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408  TAGAGCCTGGTTTTTGGGATTAAATAAGGAAGGGCAAGCTATGAAAGGGAACAGAGTAAAGAAAACCAAACCAG  481

Query 593  CAGCTCATTTTCTACCCAAGCCATTGGAAGTTGCCATGTACCGAGAACCATCTTTGCATGATGTTGGGGAAACG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482  CAGCTCATTTTCTACCCAAGCCATTGGAAGTTGCCATGTACCGAGAACCATCTTTGCATGATGTTGGGGAAACG  555

Query 667  GTCCCGAAGCCTGGGGTGACGCCAAGTAAAAGCACAAGTGCGTCTGCAATAATGAATGGAGGCAAACCAGTCAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556  GTCCCGAAGCCTGGGGTGACGCCAAGTAAAAGCACAAGTGCGTCTGCAATAATGAATGGAGGCAAACCAGTCAA  629

Query 741  CAAGAGTAAGACAACA  756
           ||||||||||||||||
Sbjct 630  CAAGAGTAAGACAACA  645