Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00562
• Subject: XM_011244875.1
• Aligned Length: 1951
• Identities: 1393
• Gaps: 335

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTAAGCATGAGAAGTGCAGCGTCTCAGCCTCAGGGCTTCAGGGGAGAAAGCGGAGCTCTTGCAGGTGAAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGCGGTCCCTTCGCGGTCTTCCCGTGGCCGCCTGCGCATCGAACCCTTGCCAGATTCCGCCACGCATCTTCCTC  148

Query    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3
                                                                                   |||
Sbjct  149  CCGCGCTGCCGATGCTGGGTGCTCTGGAGAGTGAGGACCACAGCGGGGAGGGCGCGACCCGAACACCGAGGATG  222

Query    4  GACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGAGGG  77
            ||.||.|..|||||||...||||||..|||||.|||||.||.|||||.||..||||.||..||||.||||||||
Sbjct  223  GATGCCCGCACCTGGCGTCTGGGCTGGCGCTGTCTCCTTCTCCTGGCTCTCCTTGGATCTACCCGAAGCGAGGG  296

Query   78  CGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGGATT  151
            ||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||..|||||||||||..
Sbjct  297  CGTGGAGAGCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTTGGGGGAGCTGTCAAAGGGCTGCCGGAGG  370

Query  152  CGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAGGAG  225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCCTATCCAAAAACCCAACGTGCTGTACCAGGAAGATGGAGGAG  444

Query  226  AGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCTAAT  299
            ||.||.||||||||.|||||.||.|||.||||||||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  AGGTACCAGATTGCAGCTCGGCAAGATTTGCAGCAGGTGCTTCAGACATCCAGCTCAACATTAAAGTTGCTAAT  518

Query  300  ATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTATAC  373
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  ATCTCGAAATGCAGCTGCTTTTCAAGAGACCCTGGAAACCCTCATCAGACAAGCAGAGAATTACACCAGTATCC  592

Query  374  TTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTGGGG  447
            ||||.||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct  593  TTTTCTGCAACACCTACCGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCCATTCAGGAATTTTTCACGGATGTTGGA  666

Query  448  CTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCTGGT  521
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCCGAGGAATTTGTAAACAGATTCTTTGACAGTCTTTTTCCTCTGGT  740

Query  522  CTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTCGCC  595
            |||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  741  CTACAACCATCTTATAAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCTCTGCAATACTCAGAATGCATTCGAATGGCCCGCC  814

Query  596  GGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGCCGC  669
            .||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||..|||||
Sbjct  815  AGGATGTTAGTCCATTTGGCAACATTCCCAAAAGAGTCATGGGGCAGATGGGGAGGTCGCTGCTGCCTGGCCGC  888

Query  670  ACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGAGTG  743
            ||.||..|||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|..|.|||||||||||.|||||
Sbjct  889  ACATTCTTGCAGGCGCTTAATCTGGGCATTGAGGTCATCAACACCACGGACCACATACACTTCTCCAAGGAGTG  962

Query  744  CAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGGGAT  817
            |||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||..|||||..|||||.||||||.||||||||.|
Sbjct  963  CAGTAGGGCCCTCCTGAAGATGCAGTATTGTCCTCACTGCCAGAGCCTGATGCTCAGTAAGCCCTGTATGGGGT  1036

Query  818  ACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATCCGG  891
            ||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  ACTGCCTCAATGTCATCAGGGGCTGCCTGGCCCACATGACTGAGCTTAATCCACACTGGCATGCTTATATCCGG  1110

Query  892  TCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTTGCT  965
            ||.||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||.|||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1111  TCTTTGGAAGAGTTGTCAGATGCGATGCACGGAACCTACGACGTTGAACACGTGCTCCTGAACTTCCACTTGCT  1184

Query  966  TGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTGGCC  1039
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1185  TGTTAATGATGCCGTGTTGCAGGCTCACCTCAATGGGCAGAAATTATTGGATCAGGTGAATACGATTTGTGGCC  1258

Query 1040  GCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAGACC  1113
            ..||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||.|..|||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 1259  ATCCAGTGAGAACACCAACACAGAGCCCCCGCTGTACTTTTGACCCAAGCAAAGAGAAACATGGAATGAAGATC  1332

Query 1114  ACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAGGTC  1187
            .|..|||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||.|..||||
Sbjct 1333  TCTGCAAGGAATGGTGAAGAGACACTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTCATCAATAGCCTTAGGCTGCATGGGTC  1406

Query 1188  ATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGAATG  1261
            .||||||||.||.||.|||||.||||||||||.|||||||||.|||||..|.||.|||...|||||||||||||
Sbjct 1407  CTTCTATGGTGGCCTGGCTGACCAGCTTTGTGTTAATGAATTGGCTGCCCCTGAAGGAAGGCCCTGCTGGAATG  1480

Query 1262  GAGAAGATATAGTAAAAAGTTATACTCAGCGTGTGGTTGGAAATGGAATCAAAGCCCAGTCTGGAAATCCTGAA  1335
            |.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1481  GGGAGGAAATAGTCAAAAGCTATGCTCAGCGTGTGGTTGGGAATGGAATCAAAGCCCAGTCTGCAAATCCTGAA  1554

Query 1336  GTCAAAGTCAAAGGAATTGATCCTGTGATAAATCAGATTATTGATAAACTGAAGCATGTTGTTCAGTTGTTACA  1409
            ||||.|||||.|||||..|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||||||||||.
Sbjct 1555  GTCAGAGTCAGAGGAACCGATCCTGTGGTAAATCAGATCATTGATAAACTGAAGCATGTCATCCAGTTGTTACG  1628

Query 1410  GGGTAGATCACCCAAACCTGACAAGTGGGAACTTCTTCAGCTGGGCAGTGGTGGAGGCATGGTTGAACAAGTC-  1482
            |||.|||||||||||.||..||||||||||.||.|||||||..||||||||.||.||||||.||| |.||.|| 
Sbjct 1629  GGGGAGATCACCCAAGCCCAACAAGTGGGAGCTCCTTCAGCCAGGCAGTGGAGGCGGCATGCTTG-AGAACTCT  1701

Query 1483  AGTGGGGACTGTGATGATGAAGATGGTTGCGGGGGATCAGGAAGTGGAGAAGTCAAGAGGACACTGAAGATCAC  1556
            |||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1702  AGTGGAGACTGTGATGACGAAGATGGCTGTGGAGGATCAGGAAGCGGAGAAGTAAAGAGGACCCTGAAGATCAC  1775

Query 1557  AGACTGGATGCCAGATGATATGAACTT------------CAGTGATGTAAAGCAA--ATCCATCAAACAGACAC  1616
            |.||              ||||.||||            |||.||.| ||||.||  |     ||||||     
Sbjct 1776  AAAC--------------TATGGACTTGACCCTGTCCACCAGGGAAG-AAAGAAAGGA-----CAAACA-----  1824

Query 1617  TGGCAGTACTTTAGACACA-ACAGGAGCAGGATGTGCAGTGGCGACTGAATCTATGACATTCACTCTGATAAGT  1689
               |||      ||||||| |.|  |||           |||| ||||.|                        
Sbjct 1825  ---CAG------AGACACAGAAA--AGC-----------TGGC-ACTGGA------------------------  1851

Query 1690  GTGGTGATGTTACTTCCCGGGATTTGG  1716
                                       
Sbjct 1852  ---------------------------  1851