Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00562
- Subject:
- XM_011521057.3
- Aligned Length:
- 1724
- Identities:
- 1319
- Gaps:
- 400
Alignment
Query 1 ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA 74
Query 75 GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG 148
Query 149 ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG 222
Query 223 GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT 296
Query 297 AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA 370
Query 371 TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG 444
Query 445 GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT 518
Query 519 GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC 592
Query 593 GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC 666
Query 667 CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA 740
Query 741 GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG 814
Query 815 GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC 888
Query 889 CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT 962
Query 963 GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG 1036
Query 1037 GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG 1110
Query 1111 ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG 1184
Query 1185 GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA 1258
Query 1259 ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTTATACTCAG----CGTG-TGGTTGGAAATG--GAATCAAAGCCCAGTCTG- 1324
|||||||||||||||||||||||| ..||| ||.| ||| |||.||| |.|||||| || ||
Sbjct 1259 ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTT---GGCAGGTTTCGAGCTGG--GGAGATGATGGATCAAA----AG--TGA 1321
Query 1325 GAAATCCTGAAGTCAAAGTCAAAGGAATTGATCCTGTGATAAATCAGATTATTGATAAACTGAAGCATGTTGTT 1398
|||| |||| |||
Sbjct 1322 GAAA----GAAG---AAG-------------------------------------------------------- 1332
Query 1399 CAGTTGTTACAGGGTAGATCACCCAAACCTGACAAGTGGGAACTTCTTCAGCTGGGCAGTGGTGGAGGCATGGT 1472
Sbjct 1333 -------------------------------------------------------------------------- 1332
Query 1473 TGAACAAGTCAGTGGGGACTGTGATGATGAAGATGGTTGCGGGGGATCAGGAAGTGGAGAAGTCAAGAGGACAC 1546
Sbjct 1333 -------------------------------------------------------------------------- 1332
Query 1547 TGAAGATCACAGACTGGATGCCAGATGATATGAACTTCAGTGATGTAAAGCAAATCCATCAAACAGACACTGGC 1620
Sbjct 1333 -------------------------------------------------------------------------- 1332
Query 1621 AGTACTTTAGACACAACAGGAGCAGGATGTGCAGTGGCGACTGAATCTATGACATTCACTCTGATAAGTGTGGT 1694
Sbjct 1333 -------------------------------------------------------------------------- 1332
Query 1695 GATGTTACTTCCCGGGATTTGG 1716
Sbjct 1333 ---------------------- 1332