Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00562
- Subject:
- XM_011521060.2
- Aligned Length:
- 1718
- Identities:
- 1317
- Gaps:
- 391
Alignment
Query 1 ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGCACAGACCTGGCCCGTGGGCTTTCGCTGCCTCCTCCTTCTGGCCCTGGTTGGGTCCGCCCGCAGCGA 74
Query 75 GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGCGTGCAGACCTGCGAAGAAGTTCGGAAACTTTTCCAGTGGCGGCTGCTGGGAGCTGTCAGGGGGCTGCCGG 148
Query 149 ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTCGCCGCGGGCAGGACCTGATCTTCAGGTTTGCATATCCAAAAAGCCTACATGTTGCACCAGGAAGATGGAG 222
Query 223 GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGAGATATCAGATTGCGGCTCGCCAGGATATGCAGCAGTTTCTTCAAACGTCCAGCTCTACATTAAAGTTTCT 296
Query 297 AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATATCTCGAAATGCGGCTGCTTTTCAAGAAACCCTTGAAACTCTCATCAAACAAGCAGAAAATTACACCAGTA 370
Query 371 TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TACTTTTTTGCAGTACCTACAGGAACATGGCCTTGGAGGCTGCTGCTTCGGTTCAGGAGTTCTTCACTGATGTG 444
Query 445 GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGCTGTATTTATTTGGTGCGGATGTTAATCCTGAAGAATTTGTAAACAGATTTTTTGACAGTCTTTTTCCTCT 518
Query 519 GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTCTACAACCACCTCATTAACCCTGGTGTGACTGACAGTTCCCTGGAATACTCAGAATGCATCCGGATGGCTC 592
Query 593 GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCGGGATGTGAGTCCATTTGGTAATATTCCCCAAAGAGTAATGGGACAGATGGGGAGGTCCCTGCTGCCCAGC 666
Query 667 CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCACTTTTCTGCAGGCACTCAATCTGGGCATTGAAGTCATCAACACCACAGACTATCTGCACTTCTCCAAAGA 740
Query 741 GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGCAGCAGAGCCCTCCTGAAGATGCAATACTGCCCGCACTGCCAAGGCCTGGCGCTCACTAAGCCTTGTATGG 814
Query 815 GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATACTGCCTCAATGTCATGCGAGGCTGCCTGGCGCACATGGCGGAGCTTAATCCACACTGGCATGCATATATC 888
Query 889 CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGGTCGTTGGAAGAACTCTCGGATGCAATGCATGGAACATACGACATTGGACACGTGCTGCTGAACTTTCACTT 962
Query 963 GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTTGTTAATGATGCTGTGTTACAGGCTCACCTCAATGGACAAAAATTATTGGAACAGGTAAATAGGATTTGTG 1036
Query 1037 GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCGCCCTGTAAGAACACCCACACAAAGCCCCCGTTGTTCTTTTGATCAGAGCAAAGAGAAGCATGGAATGAAG 1110
Query 1111 ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCACCACAAGGAACAGTGAAGAGACGCTTGCCAACAGAAGAAAAGAATTTATCAACAGCCTTCGACTGTACAG 1184
Query 1185 GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTCATTCTATGGAGGTCTAGCTGATCAGCTTTGTGCTAATGAATTAGCTGCTGCAGATGGACTTCCCTGCTGGA 1258
Query 1259 ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGTTATACTCAGCGTGTGGTTGGAA--ATGGAATCAAAGCCCAGTCTGGAAATC 1330
||||||||||||||||||||||.|.| ||| |||| ||||| ||| |.||
Sbjct 1259 ATGGAGAAGATATAGTAAAAAGATGT----------------GAAATATGG-ATCAA----CAG------ACTC 1305
Query 1331 CTGAAGTCAAAGTCAAAGGAATTGATCCTGTGATAAATCAGATTATTGATAAACTGAAGCATGTTGTTCAGTTG 1404
||.|.|.|.|| |.||||||.|||.
Sbjct 1306 CTCATGACCAA-------------------TCATAAATTAGAG------------------------------- 1329
Query 1405 TTACAGGGTAGATCACCCAAACCTGACAAGTGGGAACTTCTTCAGCTGGGCAGTGGTGGAGGCATGGTTGAACA 1478
Sbjct 1330 -------------------------------------------------------------------------- 1329
Query 1479 AGTCAGTGGGGACTGTGATGATGAAGATGGTTGCGGGGGATCAGGAAGTGGAGAAGTCAAGAGGACACTGAAGA 1552
Sbjct 1330 -------------------------------------------------------------------------- 1329
Query 1553 TCACAGACTGGATGCCAGATGATATGAACTTCAGTGATGTAAAGCAAATCCATCAAACAGACACTGGCAGTACT 1626
Sbjct 1330 -------------------------------------------------------------------------- 1329
Query 1627 TTAGACACAACAGGAGCAGGATGTGCAGTGGCGACTGAATCTATGACATTCACTCTGATAAGTGTGGTGATGTT 1700
Sbjct 1330 -------------------------------------------------------------------------- 1329
Query 1701 ACTTCCCGGGATTTGG 1716
Sbjct 1330 ---------------- 1329