Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00564
• Subject: XM_011541011.2
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1380
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAATTGGAGCCGGTGGCCACGGCCAAGGAGGATGCTGGCCTGGAAGGGGACTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAATTGGAGCCGGTGGCCACGGCCAAGGAGGATGCTGGCCTGGAAGGGGACTT  74

Query   75  CAGAAGCTACGGGGCAGCAGACCACTATGGGCCTGACCCCACTAAGGCCCGGCCTGCATCCTCATTTGCCCACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGAAGCTACGGGGCAGCAGACCACTATGGGCCTGACCCCACTAAGGCCCGGCCTGCATCCTCATTTGCCCACA  148

Query  149  TCCCCAACTACAGCAACTTCTCCTCTCAGGCCATCAACCCTGGCTTCCTTGATAGTGGCACCATCAGGGGTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCCCAACTACAGCAACTTCTCCTCTCAGGCCATCAACCCTGGCTTCCTTGATAGTGGCACCATCAGGGGTGTG  222

Query  223  TCAGGGATTGGGGTGACCCTGTTCATTGCCCTGTATGACTATGAGGCTCGAACTGAGGATGACCTCACCTTCAC  296
            ||||                                                                      
Sbjct  223  TCAG----------------------------------------------------------------------  226

Query  297  CAAGGGCGAGAAGTTCCACATCCTGAACAATACTGAAGGTGACTGGTGGGAGGCTCGGTCTCTCAGCTCCGGAA  370
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  ---------------------------------TGAAGGTGACTGGTGGGAGGCTCGGTCTCTCAGCTCCGGAA  267

Query  371  AAACTGGCTGCATTCCCAGCAACTACGTGGCCCCTGTTGACTCAATCCAAGCTGAAGAGTGGTACTTTGGAAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  268  AAACTGGCTGCATTCCCAGCAACTACGTGGCCCCTGTTGACTCAATCCAAGCTGAAGA----------------  325

Query  445  ATTGGGAGAAAGGATGCAGAGAGGCAGCTGCTTTCACCAGGCAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAAAG  518
                                                                                      
Sbjct  326  --------------------------------------------------------------------------  325

Query  519  CGAGACCACCAAAGGTGCCTACTCCCTGTCCATCCGGGACTGGGATCAGACCAGAGGCGATCATGTGAAGCATT  592
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  --------------GTGCCTACTCCCTGTCCATCCGGGACTGGGATCAGACCAGAGGCGATCATGTGAAGCATT  385

Query  593  ACAAGATCCGCAAACTGGACATGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGTTCAGTTCAACTCGGTGCAGGAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  ACAAGATCCGCAAACTGGACATGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGTTCAGTTCAACTCGGTGCAGGAGCTG  459

Query  667  GTGCAGCACTACATGGAGGTGAATGACGGGCTGTGCAACCTGCTCATCGCGCCCTGCACCATCATGAAGCCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  GTGCAGCACTACATGGAGGTGAATGACGGGCTGTGCAACCTGCTCATCGCGCCCTGCACCATCATGAAGCCGCA  533

Query  741  GACGCTGGGCCTGGCCAAGGACGCCTGGGAGATCAGCCGCAGCTCCATCACGCTGGAGCGCCGGCTGGGCACCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  GACGCTGGGCCTGGCCAAGGACGCCTGGGAGATCAGCCGCAGCTCCATCACGCTGGAGCGCCGGCTGGGCACCG  607

Query  815  GCTGCTTCGGGGATGTGTGGCTGGGCACGTGGAACGGCAGCACTAAGGTGGCGGTGAAGACGCTGAAGCCGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  GCTGCTTCGGGGATGTGTGGCTGGGCACGTGGAACGGCAGCACTAAGGTGGCGGTGAAGACGCTGAAGCCGGGC  681

Query  889  ACCATGTCCCCGAAGGCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGGTCATGAAGCTGCTGCGGCACGACAAGCTGGTGCAGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  ACCATGTCCCCGAAGGCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGGTCATGAAGCTGCTGCGGCACGACAAGCTGGTGCAGCT  755

Query  963  GTACGCCGTGGTGTCGGAGGAGCCCATCTACATCGTGACCGAGTTCATGTGTCACGGCAGCTTGCTGGATTTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  GTACGCCGTGGTGTCGGAGGAGCCCATCTACATCGTGACCGAGTTCATGTGTCACGGCAGCTTGCTGGATTTTC  829

Query 1037  TCAAGAACCCAGAGGGCCAGGATTTGAGGCTGCCCCAATTGGTGGACATGGCAGCCCAGGTAGCTGAGGGCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  TCAAGAACCCAGAGGGCCAGGATTTGAGGCTGCCCCAATTGGTGGACATGGCAGCCCAGGTAGCTGAGGGCATG  903

Query 1111  GCCTACATGGAACGCATGAACTACATTCACCGCGACCTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTTGGGGAGCGGCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  GCCTACATGGAACGCATGAACTACATTCACCGCGACCTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTTGGGGAGCGGCTGGC  977

Query 1185  GTGCAAGATCGCAGACTTTGGCTTGGCGCGTCTCATCAAGGACGATGAGTACAACCCCTGCCAAGGTTCCAAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  978  GTGCAAGATCGCAGACTTTGGCTTGGCGCGTCTCATCAAGGACGATGAGTACAACCCCTGCCAAGGTTCCAAGT  1051

Query 1259  TCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAAGCTGCCCTCTTTGGCAGATTCACCATCAAGTCAGACGTGTGGTCCTTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052  TCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAAGCTGCCCTCTTTGGCAGATTCACCATCAAGTCAGACGTGTGGTCCTTT  1125

Query 1333  GGGATCCTGCTCACTGAGCTCATCACCAAGGGCCGAATCCCCTACCCAGGCATGAATAAACGGGAAGTGTTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126  GGGATCCTGCTCACTGAGCTCATCACCAAGGGCCGAATCCCCTACCCAGGCATGAATAAACGGGAAGTGTTGGA  1199

Query 1407  ACAGGTGGAGCAGGGCTACCACATGCCGTGCCCTCCAGGCTGCCCAGCATCCCTGTACGAGGCCATGGAACAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200  ACAGGTGGAGCAGGGCTACCACATGCCGTGCCCTCCAGGCTGCCCAGCATCCCTGTACGAGGCCATGGAACAGA  1273

Query 1481  CCTGGCGTCTGGACCCGGAGGAGAGGCCTACCTTCGAGTACCTGCAGTCCTTCCTGGAGGACTACTTCACCTCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274  CCTGGCGTCTGGACCCGGAGGAGAGGCCTACCTTCGAGTACCTGCAGTCCTTCCTGGAGGACTACTTCACCTCC  1347

Query 1555  GCTGAACCACAGTACCAGCCCGGGGATCAGACA  1587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348  GCTGAACCACAGTACCAGCCCGGGGATCAGACA  1380