Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00581
• Subject: NM_001282692.1
• Aligned Length: 1608
• Identities: 1596
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ------------ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTG  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGGAGAACATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTG  74

Query   63  TCTGGAAGAAGGACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAAC  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGGAAGAAGGACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAAC  148

Query  137  ATGTTGAAGAAGGCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCA  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTTGAAGAAGGCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCA  222

Query  211  GACTTTCCATTCCCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGC  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTTCCATTCCCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGC  296

Query  285  AAACCACTTTGACCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTG  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACCACTTTGACCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTG  370

Query  359  CTGTCTCTGGCCAATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTCTCTGGCCAATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATG  444

Query  433  GTCTGCACTGGCTTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCA  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCTGCACTGGCTTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCA  518

Query  507  GTACTTTCATAGCCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACTTTCATAGCCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAA  592

Query  581  ATTCTGGCACAGACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGA  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTCTGGCACAGACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGA  666

Query  655  TGGGTGATCAGCCGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTT  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGGTGATCAGCCGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTT  740

Query  729  GAGAAATTCCCTCCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAA  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGAAATTCCCTCCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAA  814

Query  803  ATTACGGCTTAATACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTACGGCTTAATACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATC  888

Query  877  ATCACTGGGAAAGTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCACTGGGAAAGTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTC  962

Query  951  AAAGGAAGAGCCTATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGGAAGAGCCTATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTG  1036

Query 1025  TAGTGAAAGTTGAAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGTGAAAGTTGAAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTG  1110

Query 1099  GCCATTATTGGCCTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCG  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCATTATTGGCCTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCG  1184

Query 1173  AGTCCTGAAAGGTGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTCCTGAAAGGTGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACA  1258

Query 1247  AGCCCAGTTGGTTTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCCAGTTGGTTTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTG  1332

Query 1321  ACCTATATCAATGCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTT  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCTATATCAATGCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTT  1406

Query 1395  TGGCCCATGCTCACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGA  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCCCATGCTCACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGA  1480

Query 1469  CCCAGTGGGACCGAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTT  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCAGTGGGACCGAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTT  1554

Query 1543  CTTAAAGTCTTTAGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTAAAGTCTTTAGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1608