Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00581
• Subject: NM_001282694.1
• Aligned Length: 1596
• Identities: 1407
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG  74

Query   75  ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct   75  ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACC----------------  132

Query  149  GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC  222
                                                                                      
Sbjct  133  --------------------------------------------------------------------------  132

Query  223  CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA  296
                                                                                      
Sbjct  133  --------------------------------------------------------------------------  132

Query  297  CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC  370
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  -------------------------ACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC  181

Query  371  AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  182  AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGGC  255

Query  445  TTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCATAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  256  TTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCATAG  329

Query  519  CCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  330  CCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCACAG  403

Query  593  ACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  ACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATCAGC  477

Query  667  CGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  CGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTCCCT  551

Query  741  CCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGGCTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  552  CCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGGCTTAA  625

Query  815  TACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTGGGAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  TACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTGGGAAA  699

Query  889  GTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAAGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  GTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAAGAGCC  773

Query  963  TATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAAAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  TATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAAAGTTG  847

Query 1037  AAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTATTGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  AAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTATTGGC  921

Query 1111  CTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTGAAAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  CTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTGAAAGG  995

Query 1185  TGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCAGTTGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  TGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCAGTTGGT  1069

Query 1259  TTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTATATCAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  TTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTATATCAAT  1143

Query 1333  GCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCCATGCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  GCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCCATGCTC  1217

Query 1407  ACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGTGGGACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218  ACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGTGGGACC  1291

Query 1481  GAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAAGTCTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292  GAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAAGTCTTT  1365

Query 1555  AGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366  AGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1407